Closteroviridae

Closteroviridae
Closteroviridae
Systematik
Klassifikation: Viren Realm: Riboviria[2] Reich: Orthornavirae[1] Phylum: Kitrinoviricota[1] Klasse: Alsuviricetes[1] Ordnung: Martellivirales[1] Familie: Closteroviridae
Taxonomische Merkmale
Genom: (+)ssRNA linear Baltimore: Gruppe 4 Symmetrie: helikal Hülle: keine
Wissenschaftlicher Name
Closteroviridae
Links
NCBI Taxonomy: 69973 ViralZone (Expasy, SIB): 34 ICTV Taxon History: 201902978

Die Closteroviridae (nicht zu verwechseln mit den Klosneuviren, gefunden in Klosterneuburg) sind eine Familie von RNA-Viren, die Pflanzen infizieren.^[3][4]

Aufbau

Virion

Die Virionen (Viruspartikel) der Closteroviridae besitzen ein helikal-filamentöses Kapsid (gewunden fadenförmig) mit einer variablen Länge von etwa 650 nm bis über 2200 nm und einem Durchmesser von 10–13 nm. Das virale Genom ist einzelsträngig mit positiver Polarität bei einer Länge von etwa 13 bis 19 Kilobasen, mit unterschiedlicher Segmentierung des Genoms. Das Genom ist in einem Kapsid verpackt, das aus dem Hauptkapsidprotein (englisch major capsid protein, MCP) aufgebaut ist und beidseitig vom Nebenkapsidprotein (engl. minor capsid protein, mCP) gedeckelt wird.

Genom

Voraussichtliche Sekundärstruktur des 3'-Pseudoknotens im Sweet Potato Chlorotic Stunt Virus

Das Genom der Closteroviridae gehört zu den größten RNA-Genomen von Pflanzenviren. Es enthält linear angeordnete Duplikate kodierender Sequenzen wie auch zum Teil nicht-virale Abschnitte (z. B. für Proteasen und das HSP70), die durch RNA-Rekombination flexibel integriert werden können. Einige Spezies bilden subvirale, kleine Partikel, die nur Teile des Genoms oder subgenomische virale RNA enthalten. Das Genom des Beet yellows virus (BYT) kodiert für die Proteine ORF1a (enthält die RNA-Polymerase), ORF1ab (enthält ebenfalls die RNA-Polymerase), p6, MP/Hsp70h, p64, CPm, Cp, p20 und p21.

Systematik

Innere Systematik

Die Gattungen der Familie unterscheiden sich in der Segmentierung des Genoms und in der Art der Übertragung. Die Genome der Ampeloviren sind einteilig segmentiert aufgebaut und werden durch Schmierläuse und andere Schildläuse übertragen, während das Genom der Closteroviren einteilig ist und durch Blattläuse weitergegeben wird und das Genom der Criniviren zwei- oder dreiteilig ist und durch die weiße Fliege übertragen wird.^[5] Die folgende Gliederung der Closteroviridae in Genera folgt den Vorgaben des International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) mit Stand November 2018,^[6]

• Familie Closteroviridae

• Genus Ampelovirus^[7]

• Spezies Grapevine leafroll-associated virus 3 (GLRaV-3, Typusspezies)
• Spezies Little cherry virus 2 (LChV-2)

• Genus Closterovirus^[8]

• Spezies Beet-yellows-Virus (BYT, Typusspezies)

• Genus Crinivirus^[9]

• Spezies Lettuce-infectious-yellows-Virus (LIYV, Typusspezies)
• Spezies Sweet Potato Chlorotic Stunt Virus (SPCSV)

• Genus Velarivirus

• Spezies Grapevine leafroll-associated virus 7 (Typusspezies)
• Spezies Little cherry virus 1 (LChV-1)

Daneben gibt es noch etliche Spezies, die keinem Genus zugeordnet sind, z. B. das Blueberry virus A

Äußere Systematik

Koonin et al haben 2015 die Closteroviridae taxonomisch (aufgrund ihrer Verwandtschaft) der von ihnen postulierten Supergruppe ‚Alphavirus-like superfamily‘ zugeordnet.^[10] Schwestergruppe ist danach die Familie Virgaviridae.^[11] Die Mitglieder dieser vorgeschlagenen Supergruppe gehören verschiedenen Gruppen der Baltimore-Klassifikation an, in der Regel handelt es sich um einzelsträngige RNA-Viren positiver Polarität ((+)ssRNA, Baltimore-Gruppe 4), es sind aber auch doppelsträngige Vertreter (mit dsRNA gekennzeichnet, Baltimore-Gruppe 3) zu finden.

Dieser Vorschlag ist inzwischen abgelöst durch die Master species List #35 des ICTV vom März 2020.^[1] Eine Gegenüberstellung der Kladogramme findet sich bei Tymovirales §ICTV Master Species List #35.

Literatur

• D. M. Knipe, Peter M. Howley, D. E. Griffin, (Hrsg.): Fields Virology. 5. Auflage, Lippincott Williams & Wilkins, Philadelphia 2007, ISBN 978-0-7817-6060-7.
• G. P. Martelli et al.: Family Closteroviridae. In: A. M. Q. King, M. J. Adams, E. B. Carstens, E. J. Lefkowitz (eds.): Virus Taxonomy. Ninth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses. Amsterdam 2012 S. 987ff, ISBN 978-0-12-384684-6

Weblinks

• Viralzone: Closteroviridae
• MeSH Closteroviridae
• ICTV: Index of Viruses - Closteroviridae. In: ICTVdB - The Universal Virus Database, version 4. Büchen-Osmond, C. (Ed), Columbia University, New York 2009. [1].

Einzelnachweise

1. ↑ ^{a b c d e} ICTV: ICTV Master Species List 2019.v1, New MSL including all taxa updates since the 2018b release, March 2020 (MSL #35)
2. ↑ ICTV Master Species List 2018b v1 MSL #34, Feb. 2019
3. ↑ R. Flores, P. Moreno, B. Falk, G. P. Martelli, W. O. Dawson: e-Book on Closteroviridae. In: Frontiers in microbiology. Band 4, 2013, S. 411, ISSN 1664-302X. doi:10.3389/fmicb.2013.00411. PMID 24409172. PMC 3873501 (freier Volltext).
4. ↑ G. P. Martelli, A. A. Agranovsky, M. Bar-Joseph, D. Boscia, T. Candresse, R. H. Coutts, V. V. Dolja, B. W. Falk, D. Gonsalves, W. Jelkmann, A. V. Karasev, A. Minafra, S. Namba, H. J. Vetten, G. C. Wisler, N. Yoshikawa: The family Closteroviridae revised. In: Archives of virology. Band 147, Nummer 10, Oktober 2002, S. 2039–2044, ISSN 0304-8608. doi:10.1007/s007050200048. PMID 12376765.
5. ↑ L. Rubio, J. Guerri, P. Moreno: Genetic variability and evolutionary dynamics of viruses of the family Closteroviridae. In: Frontiers in microbiology. Band 4, 2013, S. 151, ISSN 1664-302X. doi:10.3389/fmicb.2013.00151. PMID 23805130. PMC 3693128 (freier Volltext).
6. ↑ ICTV: Master Species List 2018a v1 (Memento des Originals vom 14. März 2019 im Internet Archive)  Info: Der Archivlink wurde automatisch eingesetzt und noch nicht geprüft. Bitte prüfe Original- und Archivlink gemäß Anleitung und entferne dann diesen Hinweis.@1@2Vorlage:Webachiv/IABot/talk.ictvonline.org, MSL (#33) including all taxa updates since the 2017 release. Herbst 2018
7. ↑ SIB: Ampelovirus, auf: ViralZone
8. ↑ SIB: Closterovirus, auf: ViralZone
9. ↑ SIB: Crinivirus, auf: ViralZone
10. ↑ Da diese Gruppe (von den Autoren als englisch superfamily bezeichnet) mit den Tymovirales eine Ordnung enthält, muss ihr Rang höher sein als dieser und ist nicht etwa als Überfamilie zu verstehen. Ränge höher als Ordnung waren zum Zeitpunkt der Arbeit vom ICTV aber noch gar nicht vorgegeben.
11. ↑ Eugene V. Koonin, Valerian V. Dolja, Mart Krupovic: Origins and evolution of viruses of eukaryotes: The ultimate modularity, in: Virology Mai 2015; 479–480. 2–25. PMC 5898234 (freier Volltext), PMID 25771806.