Turriviridae

Turriviridae

Kryo-EM-Struktur von Sulfolobus Turreted Icosahedral Virus 1 (Gattung Alphaturrivirus)

Systematik
Klassifikation:Viren
Realm:Varidnaviria[1]
Reich:Bamfordvirae[1]
Phylum:Preplasmiviricota
Klasse:Tectiliviricetes
Ordnung:Belfryvirales
Familie:Turriviridae
Taxonomische Merkmale
Genom:dsDNA linear
Baltimore:Gruppe 1
Wissenschaftlicher Name
Turriviridae
Links
ICTV Taxon History:202005325 (Fam.),
202005327 (Genus)
NCBI Taxonomy:1511858 (Fam.),
1511859 (Genus)
ViralZone (Expasy, SIB):4742 (Fam.),
4743 (Genus)
Schemazeichnung: Virion der Turriviridae, Querschnitt und Außenansicht

Die Turriviridae sind eine Familie von doppelsträngigen DNA-Viren, die thermophile Archaeen (Klasse Thermoprotei der Crenarchaeota) infizieren.

Derzeit (Stand Mitte Juni 2021) enthält die Familie monotypisch nur die eine Gattung Alphaturrivirus. Als natürliche Wirte dieser Gattung dienen Archaeen der Art Sulfolobus solfataricus. Es gibt in ihr zurzeit nur zwei offiziell bestätigte Spezies.[2][3][1] Diese Viren wurden aus dem Thermalquellenbereich der Rabbit Creek Hot Springs[4][5] isoliert, die sich im Midway Geyser Basin (deutsch: Mittleres Geysir-Becken) im Yellowstone-Nationalpark in den USA befindet.[6]

Aufbau

Die Virionen (Viruspartikel) der Turriviridae haben ikosaedrische Geometrie und eine Symmetrie mit Triangulationszahl T=31. Ihr Durchmesser beträgt etwa 74 nm.[2] An den 12 fünffach-symmetrischen Ecken des Ikosaeders ragen „Türmchen“ heraus, die 13 nm über die Kapsidoberfläche hinausragen. Die Türmchen haben einen durchschnittlichen Durchmesser von 24 nm. Die Mitte jedes Türmchens enthält einen Kanal mit ~3 nm Durchmesser. Die Funktion dieses Kanals ist unbekannt, aber er könnte den Zugang zwischen dem Inneren und dem Äußeren der Virionen ermöglichen.[2][7]

Das Genom der Turriviridae ist ein lineares Doppelstrang-DNA-Molekül (unsegmentiert, d, monopartit). Seine Länge beträgt 17.663 kbp (Kilobasenpaare), es hat 36 Offene Leserahmen (open reading frames, ORFs). Das Genom hat einen GC-Gehalt von 36 %. Es gibt fünf Strukturproteine: ein Hauptprotein von 37 kDa (KiloDalton) und mehrere Nebenproteine mit geschätzten Massen von 75, 25, 12,5 und 10 kDa. Das Hauptkapsidprotein (en. major capsid protein, MCP) hat überwiegend β-Faltblatt-Struktur.[8]

Replikationszyklus

Die virale Replikation findet im Zytoplasma statt.[8] Die Transkription folgt dem üblichen Modell der Transkription nach DNA-Vorlage. Als natürlicher Wirt dient Sulfolobus solfataricus. Die Übertragung erfolgt durch passive Diffusion.[2]

Systematik

Die Systematik der Familie Turriviridae ist nach ICTV mit Stand Mai/Juni 2024 (Master Species List #39v1) wie folgt:[9][10]

Familie Turriviridae

  • Gattung Alphaturrivirus
    • Spezies Alphaturrivirus yellowstonense mit Sulfolobus turreted icosahedral virus 1 (STIV1, veraltet Sulfolobus turreted icosahedral virus)
    • Spezies Alphaturrivirus hveragerdiense mit Sulfolobus turreted icosahedral virus 2

Das NCBI listet derzeit (Stand 20. Juli 2024) keine weiteren Vorschläge im Bereich dieser Familie.

Einzelnachweise

  1. ↑ a b c ICTV: ICTV Master Species List 2020.v1, New MSL including all taxa updates since the 2019 release, März 2021 (MSL #36)
  2. ↑ a b c d Viral Zone. ExPASy;
  3. ↑ Virus Taxonomy: 2020 Release. International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV), März 2021;.
  4. ↑ Dirk Niemann: Midway Geyser Basin, Rabbit Creek Hot Springs, auf: volcanic-springs.com
  5. ↑ Rabbit Creek Group, Yellowstone National Park, auf: The American Southwest: Wyoming > Yellowstone National Park > The Southwest > Hiking > Rabbit Creek Group
  6. ↑ G. Rice: The structure of a thermophilic archaeal virus shows a double-stranded DNA viral capsid type that spans all domains of life. In: Proceedings of the National Academy of Sciences. 101. Jahrgang, Nr. 20, 2004, S. 7716–7720, doi:10.1073/pnas.0401773101, PMID 15123802, PMC 419672 (freier Volltext).
  7. ↑ L. J. Happonen, P. Redder, X. Peng, L. J. Reigstad, D. Prangishvili, S. J. Butcher: Familial Relationships in Hyperthermo- and Acidophilic Archaeal Viruses. In: Journal of Virology. 84. Jahrgang, Nr. 9, 2010, S. 4747–4754, doi:10.1128/JVI.02156-09, PMID 20164227, PMC 2863766 (freier Volltext).
  8. ↑ a b Mark Young et al.: ICTV proposals 2013.002a-gB et al., "Create the family Turriviridae, comprising the new genus, Alphaturrivirus, and two new species"
  9. ↑ ICTV: Taxonomy Browser.
  10. ↑ ICTV: Virus Metadata Resource (VMR).

Auf dieser Seite verwendete Medien

Emd-5584.jpg
Autor/Urheber: A2-33, Lizenz: CC BY-SA 3.0
4.5 Å structure of Sulfolobus Turreted Icosahedral Virus determined by cryoEM.
Turriviridae image.svg
Autor/Urheber: ViralZone, SIB Swiss Institute of Bioinformatics, Philippe Le Mercier et al., Lizenz: CC BY 4.0
Schemazeichung eines Virions der Familie Turriviridae, Querschnitt und außenansicht