Birnaviridae

Birnaviridae

Schemazeichnung:
Virion der Familie Birnaviridae

Systematik
Klassifikation:Viren
Realm:Riboviria
Reich:Orthornavirae
Phylum:nicht klassifiziert
Ordnung:nicht klassifiziert
Familie:Birnaviridae
Taxonomische Merkmale
Genom:dsRNA, 2 Segmente
Baltimore:Gruppe 3
Symmetrie:ikosaedrisch
Hülle:keine
Wissenschaftlicher Name
Birnaviridae
Links
Genom der Familie Birnaviridae (prinzipieller Aufbau)
Genom einiger Vertreter der Birnaviridae

Die Familie Birnaviridae umfasst mehrere Gattungen (Genera) von Virusspezies mit doppelsträngiger RNA,[1][2] die ähnlich der Familie Partitiviridae in zwei Segmenten vorliegt. Von der Eigenschaft dieser Segmentierung (bi-RNA) leitet sich der Familienname ab. Die Viren dieser Familie haben keine Ähnlichkeiten in der Nukleinsäuresequenz mit anderen Virustaxa. Die VP4-Protease der Birnaviridae zeigt Homologien zu einer ATP-abhängigen Protease in Bakterien und Organellen. Nach neueren Untersuchungen gibt es Ähnlichkeiten in der Sekundärstruktur des viralen RNA-abhängigen RNA-Polymerase (RdRP) der Birnaviridae zu Mitgliedern der früheren Familie Tetraviridae (2011 vom International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) aufgeteilt in die Familien Alphatetraviridae, Carmotetraviridae und Permutotetraviridae).[3] Diese Befunde lassen den Schluss zu, dass die Birnaviridae zu den evolutionsgeschichtlich ältesten Viren gehören.

Systematik

Innere Systematik

Phylogenetischer Baum der Birnaviridae

Die folgende Gliederung in Gattungen der Birnaviridae folgt den Vorgaben des International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) mit Stand 3. April 2024.[1][2]

Familie Birnaviridae

  • Gattung Aquabirnavirus, bei Fischen, Weichtieren und Krebstieren
    • Spezies Aquabirnavirus ascitae
      • Yellowtail-Ascites-virus (en. Yellowtail ascites virus, YTAV)
    • Spezies Aquabirnavirus salmonidae (ehem. Typusspezies)
    • Spezies Aquabirnavirus tellinae
  • Gattung Avibirnavirus bei Vögeln
    • Spezies Avibirnavirus gumboroense
      • Virus der Infektiösen Bursitis (en. Infectious bursal disease virus, IBDV)
  • Gattung Blosnavirus
    • Spezies Blosnavirus channae
      • Blotched-Snakehead-Virus (en. Blotched snakehead virus, BSNV – siehe Schlangenkopffische: Channa maculata englisch Blotched snakehead)
    • Spezies Blosnavirus lati
      • Lates calcarifer birnavirus (LCBV)
  • Gattung Dronavirus
    • Spezies Dronavirus drosophilae
      • Drosophila-B-Virus (en. Drosophila B birnavirus, DBV)
  • Gattung Entomobirnavirus bei Insekten
    • Spezies Entomobirnavirus anophelae
      • Moskito-X-Virus (en. Mosquito X virus, MoXV)
    • Spezies Entomobirnavirus drosophilae (ehem. Typusspezies)
      • Drosophila-X-Virus (en. Drosophila X virus, DXV – siehe Drosophila)
  • Gattung Ronavirus
    • Spezies Ronavirus rotiferae
      • Rotifer-Birnavirus (RBV)[4]
  • Gattung Telnavirus
    • Spezies Telnavirus tellinae
      • Tellina-Virus 1 (TV1)

Äußere Systematik

Koonin et al haben 2015 die Birnaviridae taxonomisch (aufgrund ihrer Verwandtschaft) der von ihnen postulierten Supergruppe ‚Alphavirus-like superfamily‘ zugeordnet.[5] In unmittelbarer verwandtschaftlicher Nachbarschaft finden sich die Familien, die früher als ‚Tetraviridae‘ zusammengefasst wurden: Alphatetraviridae, Carmotetraviridae und Permutotetraviridae (von den Autoren noch nicht unterschieden).[6] Die Mitglieder dieser vorgeschlagenen Supergruppe gehören verschiedenen Gruppen der Baltimore-Klassifikation an, in der Regel handelt es sich um einzelsträngige RNA-Viren positiver Polarität ((+)ssRNA, Baltimore-Gruppe 4); es sind aber auch – wie die Birnaviridae – doppelsträngige Vertreter (mit dsRNA gekennzeichnet, Baltimore-Gruppe 3) zu finden.

Dieser Vorschlag wurde inzwischen abgelöst durch die Master species List #35 des ICTV vom März 2020. Eine Gegenüberstellung der Kladogramme findet sich bei Tymovirales §ICTV Master Species List #35.

Literatur

  • P. Dobos, B. J. Hill, R. Hallett, D. T. Kells, H. Becht, D. Teninges: Biophysical and biochemical characterization of five animal viruses with bisegmented double-stranded RNA genomes. In: J Virology, 1979, 32(2), S. 593–605, PMID 228080 (mit EM-Bildern)
  • B. Delmas, F.S.B. Kibenge et al.: Family Birnaviridae. In: C.M. Fauquet, M.A. Mayo et al.: Eighth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses. London San Diego 2004, S. 561 ff.

Einzelnachweise

  1. a b ICTV: Taxonomy Browser.
  2. a b ICTV: Virus Metadata Resource (VMR).
  3. AE Gorbalenya, FM Pringle, JL Zeddam, BT Luke, CE Cameron, J Kalmakoff, TN Hanzlik, KH Gordon, VK Ward: The palm subdomain-based active site is internally permuted in viral RNA-dependent RNA polymerases of an ancient lineage. In: J Mol Biol., 2002, 15;324(1), S. 47–62, PMID 12421558 (englisch).
  4. Michel Comps, Bruno Menu: Infectious diseases affecting mass production of the marine rotifer Brachionus plicatilis, in: Hydrobiologia, Dezember 1997, Volume 358, Issue 1–3, S. 179–183
  5. Da diese Gruppe (von den Autoren als englisch superfamily bezeichnet) mit den Tymovirales eine Ordnung enthält, muss ihr Rang höher sein als dieser und ist nicht etwa als Überfamilie zu verstehen. Ränge höher als Ordnung waren zum Zeitpunkt der Arbeit vom ICTV aber noch gar nicht vorgegeben.
  6. Eugene V. Koonin, Valerian V. Dolja, Mart Krupovic: Origins and evolution of viruses of eukaryotes: The ultimate modularity. In: Virology, Mai 2015, S. 479–480. 2–25, Epub 12. März 2015, PMC 5898234 (freier Volltext), PMID 25771806 (englisch).

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Birnaviridae. A distance tree representing the phylogenetic relationships of VP1 for members of the various genera and genetic clusters in the family (including new birnaviruses described in (Shi et al., 2016, Shi et al., 2018)). Amino acid alignment was done with ClustalW (Larkin et al., 2007) and adjusted visually. Phylogenetic analysis was performed with MEGA7 (Kumar et al., 2016) using the JTT substitution matrix and a gamma distribution of rate variation between sites. This phylogenetic tree and corresponding sequence alignment are available to download from the Resources page.
Birnaviridae virion layer 3 image.svg
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Schemazeichnung: Virion der Familie Birnaviridae, Querschnitt und Außenansicht
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Birnaviridae. Schematic representation of the gene arrangement in the coding strand of genome segment A of representative birnaviruses. Polyprotein cleavage sites are indicated by a vertical bar and identified by amino acid position. Related ORFs are color-coded with red indicating the peptides derived from processing of preVP2; green indicates the small additional ORFs. Parentheses at the 5′-ends indicate the length of the 5′-non-coding region where known.
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