Virgaviridae

Virgaviridae
TobaccoMosaicVirus.jpg

TEM-Aufnahme von Virionen des Tabakmosaikvirus (TMV),
mit Schwermetall negativ gefärbt.

Systematik
Klassifikation:Viren
Realm:Riboviria[2]
Reich:Orthornavirae[1]
Phylum:Kitrinoviricota[1]
Klasse:Alsuviricetes[1]
Ordnung:Martellivirales[1]
Familie:Virgaviridae
Taxonomische Merkmale
Genom:(+)ssDNA linear segmentiert
Baltimore:Gruppe 4
Symmetrie:stäbchenförmig helikal
Hülle:keine
Wissenschaftlicher Name
Virgaviridae
Links
NCBI Taxonomy:675071
ViralZone (Expasy, SIB):734
ICTV Taxon History:201905394

Die Virgaviridae sind eine Familie von einzelsträngigen RNA-Viren mit positiver Polarität. Ihre natürlichen Wirte sind Pflanzen.[3][4][5][6] Derzeit gibt es mindestens 59 Arten in dieser Familie, aufgeteilt in 7 Gattungen.[4][5][7] Der Name der Familie leitet sich von lateinisch virga ‚Stock, Stab‘,[8] auch ‚Stange‘, ab (da alle Viren in dieser Familie stab- oder stangenförmig sind).

Aufbau

Schemazeichnung eines Virusteilchens aus der Familie Virgaviridae, aufgeschnitten

Die Virusteilchen (Virionen) der Virgaviridae sind nicht umhüllt, ihre Geometrie ist starr stabförmig und sie haben eine mit helikale Symmetrie. Der Durchmesser liegt bei 20–25 nm,[4][5] Die Virionen haben einen zentralen „Kanal“. RNARNARNA Das Genom besteht aus einer linearen, einzelsträngigen Positiv-Sense-RNA[4][5] mit einer 3'-tRNA-ähnlichen Struktur und keinem Poly-A-Schwanz. Das Genom kann je nach Gattung in einem, zwei oder drei Segmenten vorliegen (mono-, bi- oder tripartit). Die Hüllproteine haben eine Größe von 19 bis 24 Kilodalton.[4][5]

Vermehrungszyklus

Replikation der Virusteilchen ist cytoplasmatisch (d. h. sie findet im Zytoplasma statt) und folgt dem Replikationsmodell von Positivstrang-RNA-Viren. Ebenso ist die Transkriptions­methode die übliche für Positivstrang-RNA-Viren. Die Übersetzung benutzt durch Leaky-Scanning (en) und Unterdrückung der Terminierung. [4][5]

Die natürlichen Wirte sind Pflanzen.[4][5]

Systematik

Innere Systematik

Die innere Systematik der Virgaviridae ist nach dem International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) mit Stand März 2019 wie folgt:[9]

Familie Virgaviridae

  • Gattung: Furovirus
    • Spezies: Chinese wheat mosaic virus (CWMV)
    • Spezies: Japanese soil-borne wheat mosaic virus (JSBWMV)
    • Spezies: Oat golden stripe virus (OGSV)[10]
    • Spezies: Soil-borne cereal mosaic virus (SBCMV)
    • Spezies: Soil-borne wheat mosaic virus (SBWMV, Typusspezies)
    • Spezies: Sorghum chlorotic spot virus
  • Gattung: Goravirus
    • Spezies: Drakaea virus A (DVA)
    • Spezies: Gentian ovary ringspot virus (GORV, Typusspezies)
  • Gattung: Hordeivirus
    • Spezies: Anthoxanthum latent blanching virus
    • Spezies: Barley stripe mosaic virus (BSMV, Typusspezies)
    • Spezies: Lychnis ringspot virus
    • Spezies: Poa semilatent virus
  • Gattung: Pecluvirus
    • Spezies: Indian peanut clump virus (IPCV)
    • Spezies: Peanut clump virus (PCV, Typusspezies)
  • Gattung: Pomovirus
    • Spezies: Beet soil-borne virus
    • Spezies: Beet virus Q (BVQ)
    • Spezies: Broad bean necrosis virus
    • Spezies: Potato mop-top virus (PMTV, Typusspezies)
  • Gattung: Tobamovirus
    • Spezies: Bell pepper mottle virus (BPeMV)
    • Spezies: Brugmansia mild mottle virus
    • Spezies: Cactus mild mottle virus (CMMoV)[11]
    • Spezies: Clitoria yellow mottle virus (CliYMV)
    • Spezies: Cucumber fruit mottle mosaic virus (CFMMV0)
    • Spezies: Cucumber green mottle mosaic virus (Grünscheckungsmosaikvirus der Gurke, CGMMV)[12]
    • Spezies: Cucumber mottle virus (CMV)
    • Spezies: Frangipani mosaic virus (FrMV)
    • Spezies: Hibiscus latent Fort Pierce virus (HLFPV)
    • Spezies: Hibiscus latent Singapore virus (HLSV)
    • Spezies: Kyuri green mottle mosaic virus (Grünscheckungsmosaikvirus der Kyuri, KGMMV)[12]
    • Spezies: Maracuja mosaic virus (MarMV)
    • Spezies: Obuda pepper virus (ObPV)
    • Spezies: Odontoglossum ringspot virus (ORSV)
    • Spezies: Paprika mild mottle virus
    • Spezies: Passion fruit mosaic virus
    • Spezies: Pepper mild mottle virus (PMMoV)
    • Spezies: Rattail cactus necrosis-associated virus (RCNaV)
    • Spezies: Rehmannia mosaic virus
    • Spezies: Ribgrass mosaic virus (HRV)
    • Spezies: Sammons's Opuntia virus (SOV)
    • Spezies: Streptocarpus flower break virus
    • Spezies: Sunn-hemp mosaic virus (SHMV)
    • Spezies: Tobacco latent virus (TLV)
    • Spezies: Tobacco mild green mosaic virus (TMGMV)
    • Spezies: Tobacco mosaic virus (Tabakmosaikvirus, TMV, T2MV)
    • Spezies: Tomato mosaic virus (Tomatenmosaikvirus, ToMV)
    • Spezies: Tomato mottle mosaic virus (ToMMV)
    • Spezies: Tropical soda apple mosaic virus
    • Spezies: Turnip vein-clearing virus (TVCV)
    • Spezies: Ullucus mild mottle virus
    • Spezies: Wasabi mottle virus (WMoV)
    • Spezies: Yellow tailflower mild mottle virus
    • Spezies: Youcai mosaic virus (Oilseed rape mosaic virus, YoMV, ORMV)
    • Spezies: Zucchini green mottle mosaic virus (Grünscheckungsmosaikvirus der Zucchini, ZGMMV)[12]
  • Gattung: Tobravirus
    • Spezies: Pea early-browning virus (PEBV)
    • Spezies: Pepper ringspot virus (PEPRSV)
    • Spezies: Tobacco rattle virus (Tabak-Rattle-Virus, TRV)

Äußere Systematik

Koonin et al haben 2015 die Virgaviridae taxonomisch (aufgrund ihrer Verwandtschaft) der von ihnen postulierten Supergruppe ‚Alphavirus-like superfamily‘ zugeordnet.[13] Schwestergruppe ist danach die Familie Closteroviridae. Der Stammbaum dieser Supergruppe ist nach den Autoren wie folgt:[14]


 „Alphavirus-like superfamily“  


 „Tetraviridae“ (vom ICTV 2011 aufgeteilt) 

Alphatetraviridae,[15] (mit Helicoverpa armigera stunt virus)


   

Carmotetraviridae[16] (mit Providence virus)


   

Permutotetraviridae[17] (mit Thosea asigna virus)


Vorlage:Klade/Wartung/3

   

?Birnaviridae (dsRNA)



   





Virgaviridae


   

Closteroviridae



   

Bromoviridae



   

Tymovirales (Ordnung)



   

Endornaviridae[18] (dsRNA, mit Oryza sativa alphaendornavirus)



   

Hepeviridae


   

Togaviridae (mit Alphavirus)


   

?Matonaviridae (mit Rötelnvirus — vom ICTV 2019 aus den Togaviridae ausgegliedert)


Vorlage:Klade/Wartung/3



   

?Nodaviridae[19] (mit Boolarravirus)



Vorlage:Klade/Wartung/Style

Die Mitglieder dieser vorgeschlagenen Supergruppe gehören verschiedenen Gruppen der Baltimore-Klassifikation an, in der Regel handelt es sich um einzelsträngige RNA-Viren positiver Polarität ((+)ssRNA, Baltimore-Gruppe 4), es sind aber auch doppelsträngige Vertreter (mit dsRNA gekennzeichnet, Baltimore-Gruppe 3) zu finden.

Obwohl ihre Mitglieder stäbchenförmig sind und Pflanzen infizieren gehört die Gattung Benyvirus nicht zu dieser Familie, sondern zu den Benyviridae; die Proteine der beiden Gruppen sind offenbar nur weitläufig verwandt.[20] Eine weitere verwandte Gattung ist vorschlagsgemäß Charavirus mit den Spezies Charavirus canadensis (CV-Can) und Charavirus australis (CV-Aus), diese Viren befallen Charophyten.[21]

Weblinks

Einzelnachweise

  1. ↑ a b c d ICTV Master Species List 2019.v1. ICTV, New MSL including all taxa updates since the 2018b release, March 2020 (MSL #35)
  2. ↑ ICTV Master Species List 2018b.v2. MSL #34, März 2019
  3. ↑ Michael J. Adams, Scott Adkins, Claude Bragard, David Gilmer, Dawei Li, Stuart A. MacFarlane, Sek-Man Wong, Ulrich Melcher, Claudio Ratti, Ki Hyun Ryu: ICTV Virus Taxonomy Profile: Virgaviridae. In: Journal of General Virology. 98. Jahrgang, Nr. 8, 1. August 2017, S. 1999–2000, doi:10.1099/jgv.0.000884, PMID 28786782, PMC 5656781 (freier Volltext).
  4. ↑ a b c d e f g ICTV Report Virgaviridae.Vorlage:Cite web/temporär
  5. ↑ a b c d e f g Viral Zone. ExPASy, abgerufen am 2. September 2019.Vorlage:Cite web/temporär
  6. ↑ MJ Adams, JF Antoniw, J Kreuze: Virgaviridae: a new family of rod-shaped plant viruses. In: Arch Virol, 154(12), 2009, S. 1967–1972
  7. ↑ Virus Taxonomy: 2015 Release. ICTV, abgerufen am 4. Juni 2016.Vorlage:Cite web/temporär
  8. ↑ virga|Latein → Deutsch. Pons.de
  9. ↑ ICTV MSL #34v 2018b.v2. ICTV, März 2019
  10. ↑ M. J. Adams, P. Jones, A. G. Swaby: Purification and some properties of oat golden stripe virus, in: Annals of Applied Biology, April 1988, doi:10.1111/j.1744-7348.1988.tb02064.x
  11. ↑ BE Min, BN Chung, MJ Kim, JH Ha, BY Lee, KH Ryu: Cactus mild mottle virus is a new cactus-infecting tobamovirus. In: Archives of Virology. 151. Jahrgang, Nr. 1, Januar 2006, S. 13–21, doi:10.1007/s00705-005-0617-7, PMID 16132178.
  12. ↑ a b c Tobamovirien, auf: Seminis
  13. ↑ Da diese Gruppe (von den Autoren als englisch superfamily bezeichnet) mit den Tymovirales eine Ordnung enthält, muss ihr Rang höher sein als dieser und ist nicht etwa als Überfamilie zu verstehen. Ränge höher als Ordnung waren zum Zeitpunkt der Arbeit vom ICTV aber noch gar nicht vorgegeben.
  14. ↑ Eugene V. Koonin, Valerian V. Dolja, Mart Krupovic: Origins and evolution of viruses of eukaryotes: The ultimate modularity. In: Virology, Mai 2015, S. 479–480. 2–25, Epub 12. März 2015, PMC 5898234 (freier Volltext), PMID 25771806
  15. ↑ SIB: Alphatetraviridae, auf: ViralZone
  16. ↑ SIB: Carmotetraviridae, auf: ViralZone
  17. ↑ SIB: Permutotetraviridae, auf: ViralZone
  18. ↑ SIB: Endornaviridae, auf: ViralZone
  19. ↑ SIB: Nodaviridae, auf: ViralZone
  20. ↑ ICTV Report Benyviridae.Vorlage:Cite web/temporär
  21. ↑ Marli Vlok, Adrian J. Gibbs. Curtis A. Suttle: Metagenomes of a Freshwater Charavirus from British Columbia Provide a Window into Ancient Lineages of Viruses, in: Viruses, Band 11, Nr. 3, 299, 25. März 2019, doi:10.3390/v11030299, PMC 6466400 (freier Volltext), PMID 30934644

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Tobacco Mosaic Virus (TMV) particles negative stained with heavy metal to make them visible in the TEM. Magnified 160,000X
Tobamovirus virion.jpg
Autor/Urheber: ViralZone, SIB Swiss Institute of Bioinformatics: Virgaviridae, Lizenz: CC BY 4.0
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