Drexlerviridae

Drexlerviridae
Tunavirus, EM-Aufnahme
Systematik
Klassifikation: Viren Realm: Duplodnaviria[2][3] Reich: Heunggongvirae Phylum: Uroviricota Klasse: Caudoviricetes[1] Ordnung: incertae sedis Familie: Drexlerviridae
Taxonomische Merkmale
Genom: dsDNA linear Baltimore: Gruppe 1 Symmetrie: ikosaedrisch, tailed (Siphoviren)
Wissenschaftlicher Name
Drexlerviridae
Links
NCBI Taxonomy: 2731691 ViralZone (Expasy, SIB): 510 (Tunavirus) ICTV Taxon History: 201908128

Drexlerviridae ist die Bezeichnung einer Familie von Viren in der Klasse Caudoviricetes (Viren mit Kopf-Schwanz-Aufbau). Als natürliche Wirte dienen Bakterien, die Familie wird daher nicht-taxonomisch zu den Bakteriophagen klassifiziert. Derzeit (Stand 23. Februar 2021) gibt es offiziell vom International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) bestätigt vier Unterfamilien, sechs Gattungen und 75 Spezies (Arten) in dieser Familie.^[4][2][5]

Die drexlerviridae haben den Morphotyp von Siphoviren; die Familie ging aus der früheren Unterfamilie Tunavirinae der inzwischen aufgelsten Familie Siphoviridae hervor.^[6]

Etymologie

Der Name der Familie wurde gewählt zu Ehren des amerikanischen Erforschers des T1-Phagen Henry Drexler (1927–1991), Wake Forest University Medical Center ([en]), Winston-Salem, USA.^[7]

Beschreibung

Schemazeichnung eines Virions der Spezies Escherichia-Virus T1 (Querschnitt und Seitenansicht)

Aufgrund genomischer Unterschiede wurde die Familie vom ICTV von der ehemaligen Familie Siphoviridae der Viren von Siphoviren-Gestalt abgetrennt.^[7]

Systematik

Die Systematik der Drexlerviren ist nach ICTV (ergänzt um einige Vorschläge nach NCBI in Anführungszeichen) wie folgt:^[4][3][8]

Klasse: Caudoviricetes, Familie: Drexlerviridae

• Unterfamilie: Braunvirinae (benannt nach Volkmar Braun)

• Genus Rtpvirus (alias Rtplikevirus)

• Spezies: Escherichia-Virus Rtp, Typus

• Escherichia-Phage Rtp

• Spezies: Escherichia-Virus ACGM12

• Enterobacteria-Phage vB_EcoS_ACG-M12

• Gattung: Christensenvirus
• Gattung: Guelphvirus
• Gattung: Loudonvirus
• Gattung: Rtpvirus – abgetrennt von Tunalikevirus (jetzt Tunavirus, damals noch zur früheren Familie Siphoviridae)

• Spezies Escherichia-Virus IME253 (en. Escherichia virus IME253)
• Spezies Escherichia-Virus Rtp (en. Escherichia virus Rtp, Typus)^[9]
• Spezies „Escherichia-Phage vB_EcoD_SU57“ (en. „Escherichia phage vB_EcoD_SU57“)^[10][11] – gemäß Koonjan et al. (2020) zu Tunavirus, nach ICTV und NCBI aber davon abgetrennt

• Gattung: Veterinaerplatzvirus

• Unterfamilie: Rogunavirinae

• Gattung: Eastlansingvirus
• Gattung: Lindendrivevirus
• Gattung: Rogunavirus (veraltet: Rogue1virus, Jk06likevirus)^[12]

• Spezies: Escherichia-Virus Eb49 (en. Escherichia virus Eb49)

• Escherichia-Phage Eb49

• Spezies: Escherichia-Virus Jk06 (en. Escherichia virus Jk06)

• Escherichia-Phage Jk06

• Spezies: Escherichia-Virus AHS24

• Escherichia-Phage AHS24
• Escherichia-Phage vB_EcoS_AHS24
• Escherichia-Phage bV_EcoS_AHP24

• Spezies: Escherichia-Virus AHP42

• Escherichia-Phage AHP42
• Escherichia-Phage vB_EcoS_AHP42

• Spezies: Escherichia-Virus AKS96

• Escherichia-Phage AKS96
• Escherichia-Phage vB_EcoS_AKS96

• Species Escherichia-Virus KP26

• Enterobacteria-Phage KH4
• Enterobacteria-Phage phiJLA23
• Enterobacteria-Phage phiKP26

• Spezies Escherichia-Virus Rogue1 (en. Escherichia virus Rogue1)

• Escherichia-Phage Rogue1
• Enterobacteria phage vB_EcoS_Rogue1

• Spezies: Escherichia-Virus C119

• Escherichia-Phage C119

• Spezies: Escherichia-Virus E41c

• Escherichia-Phage e4/1c

• Gattung: Wilsonroadvirus

• Unterfamilie: Tempevirinae

• Gattung: Changchunvirus
• Gattung: Hanrivervirus
• Gattung: Henuseptimavirus
• Gattung: Tlsvirus (alias Tlslikevirus)

• Spezies: Escherichia-Virus TLS, Typus

• Escherichia-Phage Tls

• Spezies: Salmonella-Virus SP126

• Salmonella-Phage FSL SP-126

• Gattung: Warwickvirus

• Spezies Escherichia-Virus 95 (en. Escherichia virus 95)
• Spezies Escherichia-Virus mar001J1 (en. Escherichia virus mar001J1)
• Spezies Escherichia-Virus mar002J2 (en. Escherichia virus mar002J2)
• Spezies Escherichia-Virus SECphi27 (en. Escherichia virus SECphi27)
• Spezies Escherichia-Virus swan01 (en. Escherichia virus swan01, Typus)
• Spezies „Escherichia-Phage vB_Eco_SLUR29“ (en. „Escherichia phage vB_Eco_SLUR29“)^[13][14]

• Unterfamilie: Tunavirinae

• Gattung: Badaguanvirus
• Gattung: Sertoctavirus
• Gattung: Tunavirus (veraltet: T1virus, Tunalikevirus, T1-like viruses, T1-like phages, T1-ähnliche Viren),^[15] isometrisches Kapsid

• Spezies Escherichia-Virus ADB2 (en. Escherichia virus ADB2)
• Spezies Escherichia-Virus BIFF (en. Escherichia virus BIFF)
• Spezies Escherichia-Virus IME18 (en. Escherichia virus IME18)
• Spezies Escherichia-Virus JMPW1 (en. Escherichia virus JMPW1)
• Spezies Escherichia-Virus JMPW2 (en. Escherichia virus JMPW2)
• Spezies Escherichia-Virus SH2 (en. Escherichia virus SH2)
• Spezies Escherichia-Virus T1 (en. Escherichia virus T1, Typus)^[16]

• Enterobacteria-Phage T1

• Spezies Shigella-Virus 008 (en. Shigella virus 008)
• Spezies Shigella-Virus ISF001 (en. Shigella virus ISF001)
• Spezies Shigella-Virus PSf2 (en. Shigella virus PSf2)
• Spezies Shigella-Virus Sfin1 (en. Shigella virus Sfin1)
• Spezies Shigella-Virus SH6 (en. Shigella virus SH6)
• Spezies Shigella-Virus Shfl1 (en. Shigella virus Shfl1)
• Spezies Shigella-Virus ISF002 (en. Shigella virus ISF002)
• Spezies „Campylobacter-Phage A15b“ (en. „Campylobacter phage A15b“)
• Spezies „Klebsiella-Phage vB_KaS-Ahsoka“ (en. „Klebsiella phage vB_KaS-Ahsoka“)
• Spezies „Klebsiella-Phage vB_KaS-Gatomon“ (en. „Klebsiella phage vB_KaS-Gatomon“)
• Spezies „Klebsiella-Phage vB_KppS-Samwise“ (en. „Klebsiella phage vB_KppS-Samwise“)

• ohne zugewiesene Gattung

• Spezies Cronobacter-Virus Esp2949-1 (en. Cronobacter virus Esp2949-1)

• ohne zugeordnete Unterfamilie

• Gattung: Eclunavirus
• Gattung: Gyeonggidovirus
• Gattung: Hicfunavirus
• Gattung: Jhansiroadvirus
• Gattung: Kyungwonvirus
• Gattung: Nouzillyvirus
• Gattung: Sauletekiovirus
• Gattung: Vilniusvirus
• Gattung: Webervirus (veraltet: Kp36virus, Kp36likevirus)

• Spezies Klebsiella-Virus KP36 (en. Klebsiella virus KP36, Typus)

• Klebsiella-Phage KP36

• Spezies Enterobacteria-Virus F20

• Enterobacteria-Phage F20

Einzelnachweise

1. ↑ ICTV: ICTV Master Species List 2021.v2, New MSL including some corrections.
2. ↑ ^{a b} ICTV: ICTV Master Species List 2019.v1, New MSL including all taxa updates since the 2018b release, March 2020 (MSL #35)
3. ↑ ^{a b} ICTV: ICTV Master Species List 2020.v1, New MSL including all taxa updates since the 2019 release, March 2021 (MSL #36)
4. ↑ ^{a b} Virus Taxonomy: 2019 Release. In: talk.ictvonline.org. International Committee on Taxonomy of Viruses. Abgerufen am 3. Mai 2020.
5. ↑ UniProt: Taxonomy - Drexlerviridae (FAMILY)
6. ↑ Dann Turner, Andrew M. Kropinski, Evelien M. Adriaenssens: A Roadmap for Genome-Based Phage Taxonomy, in: MDPI Viruses Band 13, Nr. 3, Section Bacterial Viruses, 18. März 2021, 506, doi:10.3390/v13030506
7. ↑ ^{a b} ICTV: Create one new family (Drexlerviridae), Proposal
8. ↑ NCBI: Drexlerviridae (family)
9. ↑ ICTV: ICTV Taxonomy history: Escherichia virus Rtp
10. ↑ NCBI: Escherichia phage vB_EcoD_SU57 (species)
11. ↑ Shazeeda Koonjan, Fredrik Seijsing, Callum J. Cooper, Anders S. Nilsson: Infection Kinetics and Phylogenetic Analysis of vB_EcoD_SU57, a Virulent T1-Like Drexlerviridae Coliphage, in: Front. Microbiol. 11:565556, 16. November 2020, doi:10.3389/fmicb.2020.565556, PMID 33329423, PMC 7718038 (freier Volltext). Mit EM-Aufnahme.
12. ↑ NCBI: Rugunavirus (genus)
13. ↑ NCBI: Escherichia phage vB_Eco_SLUR29 (species)
14. ↑ Ibrahim Besler, Pavelas Sazinas, Christian Harrison, Lucy Gannon, Tamsin Redgwell, Slawomir Michniewski, Steven P. Hooton, Jon L. Hobman, Andrew Millard; Mary Ann Liebert (Hrsg.): Genome Sequence and Characterization of Coliphage vB_Eco_SLUR29, in: PHAGE, Band 1, Nr. 1, 28. Februar 2020, doi:10.1089/phage.2019.0009. Dazu:
    • Mary Ann Liebert: New E. coli-infecting bacteriophage introduced in PHAGE, auf: EurekAlert! vom 14. Januar 2020
15. ↑ NCBI: unclassified Tunavirinae (list)
16. ↑ ICTV: ICTV Taxonomy history: Escherichia virus T1