Aspartatproteasen

Aspartatproteasen
Enzymklassifikation
EC, Kategorie3.4.23.-, Proteolyse

Aspartatproteasen (auch Carboxylproteasen oder Aspartylproteasen) sind Enzyme, die die Peptidbindungen eines Proteins (Eiweiß) spalten können (Proteolyse). Es handelt sich bei Aspartatproteasen durchweg um Endopeptidasen.

Reaktionsmechanismus

Ein Molekül Wasser wird pro Reaktion verbraucht (Hydrolyse). Das Wassermolekül wird von der Aminosäure Asparaginsäure in Position gehalten, die Teil der Protease ist und gleichzeitig das katalytische Zentrum darstellt.

Klassifizierung nach UniProt/MEROPS

Das UniProt-Consortium gibt regelmäßig eine Liste der Peptidasen heraus, die diese Enzyme nach ihrer evolutionären Abstammung kategorisiert. Die Daten der Liste sind, mit hochwertiger Information versehen, in der MEROPS-Datenbank abrufbar. Eng verwandte Moleküle sind dabei in Familien zusammengefasst, deren Bezeichner aus einem Buchstaben ('A' für Aspartatproteasen) und einer Zahl bestehen. Familien wiederum gehören zu Clans, deren Familien verwandt sind. Clan Bezeichner haben statt Zahlen einen Buchstaben.[1]

Es gibt 15 Aspartatprotease-Familien in 7 Clans (Stand: 2009), wobei dem Clan AA mit 6 Familien eine hervorragende Bedeutung zukommt.[2]

ClanBeschreibungExemplarisches EnzymUniProtFamilien
AAazidische Aspartylproteasen (nur Eukaryoten/Viren); zwei Asp um H2O gruppiertPepsin (Homo sapiens)P00790A1 A2 A3 A9 A11 A33
ABautolytische virale Hüllproteine; nur ein Asp involviertNodavirus-PeptidaseP12870A6 A21
ACSignalpeptidasen Typ II (nur Bakterien)Signalpeptidase II (E. coli)Q1RGH5A8
AD(zwei Asp)Präsenilin-1 (Homo sapiens)P49768A22 A24
AE(ein oder zwei Asp)gpr-Peptidase (Bacillus megaterium)P22321A25 A31
AFOmptin-Familie; Asp und His binden WasserOmptin (E. coli)P09169A26
A-ohne ZuordnungA5

Wichtige Aspartatproteasen

Einzelnachweise

  1. ↑ UniProt: Peptidase families: classification and list of entries.
  2. ↑ MEROPS: Liste der Clans und Familien