Viruses-09-00361-g001-IWaV-genome


Autor/Urheber:
Kalia S. I. Bistolas, Ryan M. Besemer, Lars G. Rudstam, Ian Hewson
Attribution:
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Größe:
2568 x 2510 Pixel (321692 Bytes)
Beschreibung:
Diagram of Idotea virus IWaV278 genome. Scaled depiction of chimeric virus IWaV278 exhibiting type III genomic architecture. Annuli from the center: (i) line graph represents coverage per site; (ii) grey tiles indicate the position of rolling circle Rep motifs RCRII (LHLQG) and RCRIII (YCRK and YALK), Rep-associated Walker-A motif (WA: GSTGTGKS), and Cp domains R (RNA/genome-interacting), S (shell), and P (protruding); (iii) black arrows denote Rep, Cp, and Cp’ ORF size, and orientation; (iv) external arrows indicate substitution sites; (v) the asterisk denotes position of the putative ori (nonanucleotide motif: TAATATTAC).
Lizenz:
Credit:
https://www.mdpi.com/viruses/viruses-09-00361/article_deploy/html/images/viruses-09-00361-g001.png (Fig. 1) at https://www.mdpi.com/1999-4915/9/12/361/htm Distribution and Inferred Evolutionary Characteristics of a Chimeric ssDNA Virus Associated with Intertidal Marine Isopods MDPI Viruses 2017, 9(12), 361; doi:10.3390/v9120361 CC-BY icon.svg
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Weitere Informationen zur Lizenz des Bildes finden Sie hier. Letzte Aktualisierung: Sat, 06 Aug 2022 07:29:04 GMT

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Idotea-Virus IWaV278

„Idotea-Virus IWaV278“ ist die vorgeschlagene Bezeichnung für eine Spezies (Art) von Viren mit einem Genom aus einer zyklischen Einzelstrang-DNA (ssDNA). Das Genom hat das für Mitglieder des Phylums Cressdnaviricota typische REP-Gen und Haarnadelstruktur, verantwortlich für den Replikationsstart. „Idotea-Virus IWaV278“ ist vergesellschaftet (assoziiert) mit Asseln der Spezies Idotea wosnesenskii, die im Intertidalbereich (Litoral) der US-Pazifikküste vorkommen. IWaV278 teilt Sequenzähnlichkeit und genomische Merkmale mit den Tombusviridae (ssRNA) und Circoviridae (ssDNA) und wurde der vorgeschlagenen Familie „Cruciviridae“ zugeordnet, die eine vermutete Klade chimärer Viren umfasst. .. weiterlesen