41396 2017 article bfismej201777 fig3

Autor/Urheber:

Kirsten Oswald, Jon S. Graf, Sten Littmann, Daniela Tienken, Andreas Brand, Bernhard Wehrli, Mads Albertsen, Holger Daims, Michael Wagner, Marcel M. M. Kuypers, Carsten J. Schubert, Jana Milucka

Attribution:

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Shortlink:

https://dewiki.de/b/367090

Quelle:

Wikimedia Commons

Größe:

625 x 393 Pixel (67731 Bytes)

Beschreibung:

Genome-inferred metabolic potential of Crenothrix for respiration and methane oxidation. Predicted metabolic potential of the lacustrine Crenothrix as well as of the two Wolfenbüttel sand filter Crenothrix species with respect to its CH₄ and N metabolism inferred from the three draft genomes. Indicated are the methane oxidation pathway (gray boxes), the aerobic respiratory chain (orange boxes) and the pathway for nitrate respiration (blue boxes). Genes that were found in the respective Crenothrix genomes are depicted in red:

□ square: lacustrine Crenothrix sp. D3 (NCBI) syn. UBA4132 sp002134785 (GTDB),

△ triangle: Wolfenbüttel sand filter Crenothrix bin 1,

○ circle: Wolfenbüttel sand filter Crenothrix bin 2;

not found in white.

Cyt. bc1 complex, cytochrome bc1 complex; Cyt. bd complex, cytochrome bd complex (cydABCD); cyt c., cytochrome c; CytS, cytochrome c’-beta; FDH, formate dehydrogenase; H₄F, tetrahydrofolate; H₄MPT, tetrahydromethanopterin; HCO, heme copper oxygen reductase (COXI-III); Hcp, hybrid cluster protein; Hcr, NADH-dependent Hcp reductase; MDH, methanol dehydrogenase (xoxF); Nar, nitrate reductase (narGHI); NarK, nitrate/nitrite antiporter (narK); NirS, copper-containing nitrite reductase (nirS); Nqr, sodium-translocating NADH:quinone oxidoreductase; pMMO, particulate methane monooxygenase (pmoCAB); Q, ubiquinone; RuMP, ribulose monophosphate; sMMO, soluble methane monooxygenase (smmoXYBZDC).

Lizenz:

CC BY 4.0

Credit:

Crenothrix are major methane consumers in stratified lakes. In: The ISME Journal, Volume 11, Issue 9, Pages 2124–2140, doi:10.1038/ismej.2017.77.

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