Reverse Transkription

Vermehrung eines Retrovirus über RNA am Beispiel von HIV.

Als Reverse Transkription wird in der Genetik die Synthese von DNA anhand einer RNA als Vorlage bezeichnet. Bei diesem Vorgang werden die Nukleinbasen der RNA (A – U – G – C) in die Nukleinbasen der DNA (A – T – G – C) umgeschrieben. Anstelle des Uracil kommt Thymin und anstelle der Ribose kommt Desoxyribose in der DNA vor. Die Reverse Transkription geschieht durch das Enzym reverse Transkriptase. Der umgekehrte Fall der Erzeugung von RNA nach einer DNA-Vorlage ist die Transkription.

Vorkommen

Die Reverse Transkription wird vor allem von Retroviren genutzt. Bei Retroviren besteht das Genom aus RNA, welches zunächst in die DNA umgeschrieben werden muss, bevor es transkribiert und translatiert werden kann. Außerdem wird die RNA genutzt, um ihre Erbinformation in eine Wirtszelle einzuschleusen. Dort wird die RNA umgeschrieben durch die Reverse Transkriptase und anschließend durch die Integrase ins Wirtsgenom eingebaut. Dort wird sie dann als Provirus bezeichnet.[1]

In Eukaryoten wird die Reverse Transkription genutzt, um die Telomere zu verlängern. Die Reverse Transkriptase wird in diesem Fall als Telomerase bezeichnet und nutzt Telomerase-RNA als Matrize.

Im Genom kommen viele repetitive Abschnitte, wie zum Beispiel Transposons vor. Die Retrotransposons vermehren sich, indem sie zunächst transkribiert werden, anschließend wird über Reverse Transkription wieder DNA gewonnen, welche in die DNA eingefügt werden kann.[2]

Ablauf der Reversen Transkription

Der Mechanismus der Reversen Transkription.

Die Reverse Transkriptase schreibt mithilfe eines tRNA-Primers die einzelsträngige RNA zunächst in einen komplementären DNA-Strang um (Schritte 1–4; Aktivität als RNA-abhängige DNA-Polymerase). Danach wird die RNA bis auf ein Fragment abgebaut, das als zweiter Primer dient (Schritt 5; Aktivität als Ribonuklease H). Anschließend entsteht die doppelsträngige DNA (Schritte 6–9; Aktivität als DNA-abhängige DNA-Polymerase).[3]

Einzelnachweise

  1. Retroviren. Abgerufen am 26. Februar 2020.
  2. DAS GROSSE SPRINGEN - wissenschaft.de. Abgerufen am 26. Februar 2020.
  3. John M. Coffin, Stephen H. Hughes, Harold E. Varmus: Overview of Reverse Transcription. Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1997 (nih.gov [abgerufen am 26. Februar 2020]).

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Mechanism of reverse transcription in class VI virus ssRNA-RT, human immunodeficiency virus (HIV). Key: U3 - promoter region, U5 - recognition site for viral integrase; PBS - primer binding site; PP - polypurine section (polypurine tract); gag, pol, env - see HIV genome organisation). Colors mark complementary sequences. This diagram isn't drawn to scale.
Reverse transcription occurs in the cytoplasm of host cell. In this process, viral ssRNA is transcribed by the viral reverse transcriptase (RT) into double stranded DNA. Reverse transcription takes place in 5'→3' direction. tRNA ("cloverleaf") hybridizes to PBS and provides -OH group for initiation of reverse transcription. 1) Strong stop complementary DNA (cDNA) is formed. 2) Template in RNA:DNA hybrid is degraded by RNase H domain of reverse transcriptase 3) DNA:tRNA is transferred to the 3'-end of the template (synthesis "jumps"). 4) First strand synthesis takes place. 5) The rest of viral ssRNA is degraded by RNase H, except for PP site. 6) Synthesis of second strand of ssDNA is initiated from the 3'-end of the template. tRNA is necessary to synthesis of complementary PBS 7) tRNA is degraded 8) After another "jump", PBS from the second strand hybridizes with the complementary PBS on the first strand. 9) Synthesis of both strands is completed by the DNAP function of reverse transcriptase. Both dsDNA ends have U3-R-U5 sequences, so called long terminal repeat sequences (3'LTR and 5'LTR, respectively). LTRs mediate integration of the retroviral DNA into another region of the host genome. Sources: Alan Cann: Principles of molecular virology. Amsterdam: Elsevier Academic Press, 2005, p. 93 ISBN 0-12-088787-8.; en:Reverse transcription entry in Wikipedia.
HIV gross cycle only.png
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Cycle only, no structure