Novymonas esmeraldas

Novymonas esmeraldas

Stoffwechsel-Austausch zwischen N. esmeraldas (links) und seinem Endosymbionten „Ca. P. novymonadis“ (rechts)

Systematik
ohne Rang:Euglenozoa
ohne Rang:Kinetoplastea
ohne Rang:Metakinetoplastina
Ordnung:Trypanosomatida
Gattung:Novymonas
Art:Novymonas esmeraldas
Wissenschaftlicher Name der Gattung
Novymonas
Kostygov & Yurchenko 2015[1]
Wissenschaftlicher Name der Art
Novymonas esmeraldas
Votypka, Kostygov, Maslov & Lukes 2015[1]

Novymonas esmeraldas ist eine Spezies (Art) von geißeltragender Protisten aus der Gruppe der Try­pano­somatida innerhalb der Euglenozoa. Die Art ist ein obligater Parasit im Magen-Darm-Trakt von Glas­flügel­wanzen und ist seinerseits Wirt für symbiotische Bakterien, die als Mitglied der Burkholderiales-Gat­tung Pandoraea identifiziert wurden.[2] N. esmeraldas unterhält es eine strikt mutualistische Be­zie­hung mit diesen Bakterien, deren Rolle der eines Zellorganells entspricht (Endosymbiont), sodass der Protist ohne die Bakterien kein eigenständiges Leben führen kann.[3] Seine Entdeckung im Jahr 2016 legt nahe, dass es ein gutes Modell für die Evolution von Prokaryoten zu Eukaryoten durch Symbiogenese ist (Modell­organismus).[4][5] Bislang ist N. esmeraldas der einzige Vertreter der (damit monotypischen) Gattung Novimons.

Entdeckung und Etymologie

Novymonas esmeraldas (anfangs provisorisch Trypanosomatidae sp. AK-2016a genannt[1]) wurde bei der Glasflügelwanze Niesthrea vincentii[6][7] aus Ecuador entdeckt. Die Wanze wurde im Juli 2008 in der Nähe von Atacames in der Provinz Esmeraldas gesammelt, auf die das Art-Epitheton des Protisten hinweist. Die Gattung selbst ist nach Frederick George Novy[8] benannt, einem amerikanischen Bakteriologen und Parasitologen, der Pionierarbeit bei der Erforschung von Insekten-Parasiten aus der Gruppe Try­pano­soma­tida leistete[4] und 1907 den ersten bekannten Vertreter der Try­pano­somatida beschrieb, der Sym­bionten beherbergt, und der später Strigomonas culicis[9] genannt wurde.[10][11]

Biologie

Beschreibung

N. esmeraldas Isolat E262AT.01, Morphotypen im frühen/mittleren Log-Stadium (Promastigoten, unten) und im stationären Stadium (Choano­masti­goten[12] in Rosetten, oben). Balken jeweils 10 µm.

Novymonas esmeraldas verbringt seinen Lebenszyklus im Darm (Hinterdarm) der Wanze Niesthrea vincentii. Dieser umfasst zwei morphologischen Formen, ein freischwimmender (motiler) Promastigot und eine festsitzende (sessile) Form von Choanomastigot.[12][13] Die Promastigoten sind länglich und messen etwa 10,9 bis 18,0 μm in der Länge und etwa 1,3 bis 4,8 μm in der Breite. Sie tragen vorne eine einzelne Geißel (Flagellum), die 7,8 bis 19,5 μm lang ist. Die Choanomastigoten sind eher kugelförmig, 4,5 bis 9,7 μm lang und 2,8 bis 6,4 μm breit. Das Flagellum ist länger und misst 8,6 bis 20,4 μm. Der Zellkern befindet sich in der Mitte, davor liegt der Kinetoplast. Der Kinetoplast hat die Anordnung einer kompakten Scheibe mit einen Durchmesser von 553 bis 938 nm und einen Querschnitt von 114 bis 213 nm aufweist.[4]

Endosymbiont

Der Endosymbiont ist ein als Candidatus Pandoraea novymonadis (vorläufige Bezeichnung Pandoraea sp. E262-ES) klassifiziertes Bakterium. Es gehört zur Familie der Burkholderiaceae unter den gramnegativen stäbchenförmigen β-Proteo­bakterien.[14][15][16] Anders als bei anderen sym­bion­tischen Trypanosomatida wie Strigomonas culicis,[17][18] Kentomonas sorsogonicus[19][20] und Angomonas deanei ist die Teilung des Endosymbionten nicht mit dem Wirt synchronisiert. Die Zellen von N. esmeraldas können eine unterschiedliche Anzahl von endosymbiotischen Bakterienzellen tragen, und einige haben überhaupt keine, weil sie aus einer Ab­stam­mungs­linie her­vor­ge­gangen sind, in der irgendwann bei einer Teilung die Endo­symbionten verloren gingen (und nicht beide Tochter­zellen mit diesen versorgt wurden). Dies deutet darauf hin, dass die Symbiose bei dieser Spezies jüngeren Datums ist als bei den anderen Endosymbionten tragenden Trypanosomatida und daher noch nicht so weit fortgeschritten. Allerdings hat auch „Ca. P. novymonadis“ im Vergleich zu seinen freilebenden Verwandten bereits ein stark reduziertes Genom mit weniger Genen und einen geringeren GC-Gehalt.[2][3]

Stoffwechsel

Der Stoffwechsel von N. esmeraldas und seinem Endosymbionten „Ca. P. novymonadis“
Der zwischen N. esmeraldas und seinem Endosymbionten „Ca. P. novymonadis“ aufgeteilte Harnstoffzyklus.

Phylogenie

Phylogenetische Position von N. esmeraldas (Maximum-Likeli­hood).
Phylogenetische Position von „Ca. P. novymonadis“ und „Ca. Kineto­plasti­bacterium“.

Bildergalerie

Einzelnachweise

  1. a b c NCBI: Novymonas, Details: Novymonas Kostygov & Yurchenko 2015 (genus).
  2. a b Alexei Y. Kostygov, Anzhelika Butenko, Anna Nenarokova, Daria Tashyreva, Pavel Flegontov, Julius Lukeš, Vyacheslav Yurchenko: Genome of Ca. Pandoraea novymonadis, an Endosymbiotic Bacterium of the Trypanosomatid Novymonas esmeraldas. In: Frontiers in Microbiology, Band 8, 4. Oktober 2017, S. 1940; doi:10.3389/fmicb.2017.01940, PMC 5632650 (freier Volltext), PMID 29046673 (englisch).
  3. a b Jane Harmer, Vyacheslav Yurchenko, Anna Nenarokova, Julius Lukeš, Michael L. Ginger: Farming, slaving and enslavement: histories of endosymbioses during kinetoplastid evolution. In: Cambridge University Press: Parasitology, Band 145, Nr. 10, S. 1311–1323, September 2018; doi:10.1017/S0031182018000781, PMID 29895336, Epub 13. Juni 2018 (englisch). Siehe u. a. Fig. 2.
  4. a b c Alexei Y. Kostygov, Eva Dobáková, Anastasiia Grybchuk-Ieremenko, Dalibor Váhala, Dmitri A. Maslov, Jan Votýpka, Julius Lukeš, Vyacheslav Yurchenko: Novel Trypanosomatid-Bacterium Association: Evolution of Endosymbiosis in Action. In: mBio. 7. Jahrgang, Nr. 2, 15. März 2016, S. e01985, doi:10.1128/mBio.01985-15, PMID 26980834, PMC 4807368 (freier Volltext) – (englisch).
  5. Alexandra Zakharova, Andreu Saura, Anzhelika Butenko, Lucie Podešvová, Sandra Warmusová, Alexei Yu. Kostygov, Anna Nenarokova, Julius Lukeš, Fred R. Opperdoes, Vyacheslav Yurchenko: A New Model Trypanosomatid, Novymonas esmeraldas: Genomic Perception of Its “Candidatus Pandoraea novymonadis” Endosymbiont. In: mBio, 17. August 2021; doi:10.1128/mbio.01606-21
  6. Wikidata: Niesthrea (Q10600637)
  7. NCBI: Niesthrea, Details: Niesthrea (genus).
  8. Wikidata: Frederick George Novy (Q15999010).
  9. Wikidata: Strigomonas culicis (Q56324252).
  10. Frederick G. Novy, Ward J. MacNeal, Harry N. Torrey: The Trypanosomes of Mosquitoes and Other Insects. In: Journal of Infectious Diseases. 4. Jahrgang, Nr. 2, 10. April 1907, S. 223–276, doi:10.1093/infdis/4.2.223, JSTOR:30072673 (englisch).
  11. Marta M. G. Teixeira, Tarcilla C. Borghesan, Robson C. Ferreira, Marcia A. Santos, Carmen S. A. Takata, Marta Campaner, Vania L. B. Nunes, Regina V. Milder, Wanderley de Souza, Erney P. Camargo: Phylogenetic validation of the genera Angomonas and Strigomonas of trypanosomatids harboring bacterial endosymbionts with the description of new species of trypanosomatids and of proteobacterial symbionts. In: Protist, Band 162, Nr. 3, Juli 2011, S. 503–524; doi:10.1016/j.protis.2011.01.001, PMID 21420905 (englisch).
  12. a b Werner Lange, Frank Antwerpes et al.: Choanomastigot. Auf: DocCheck Flexikon (doccheck.com).
  13. Wiktionary: wikt:en:choanomastigote (englisch).
  14. LPSN: Species "Candidatus Pandoraea novymonadis" Kostygov et al. 2016.
  15. NCBI: "Candidatus Pandoraea novymonadis" Kostygov et al. 2016 (species); includes: Pandoraea sp. E262-ES.
  16. GTDB: Pandoraea novymonadis. Details: GCF_003004665.1 Pandoraea novymonadis, strain: E262
  17. Wikidata: Strigomonas (Q25412469).
  18. NCBI Taxonomy Browser: Strigomonas, Details: Strigomonas Lwoff & Lwoff 1931 (genus). Dazu:
  19. Wikidata: Kentomonas (Q106446391).
  20. NCBI Taxonomy Browser: Kentomonas, Details: Kentomonas Votypka, Yurchenko, Kostygov et Lukes, 2014 (genus).
  21. Wikidata: mCherry (Q412287).
  22. mCherry. Fluorescent Protein Database (FPbase).

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Autor/Urheber: Alexei Y. Kostygov, Eva Dobáková, Anastasiia Grybchuk-Ieremenko, Dalibor Váhala, Dmitri A. Maslov, Jan Votýpka, Julius Lukeš, Vyacheslav Yurchenko, Lizenz: CC BY-SA 3.0
Novymonas esmeraldas (isolate E262AT.01). Prevailing morphotypes at the early/mid-log (promastigotes) and stationary (choanomastigotes in rosettes) stages. Scale bars are 10 µm.
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Phylogenetic position of Novymonas esmeraldas. Maximum-likelihood phylogenomic tree based on the alignment of 359 proteins encoded by single-copy genes demonstrating the phylogenetic position of N. esmeraldas (underlined) as the closest described relative of Leishmania. All branches have maximal bootstrap support and posterior probability values (except the branch, where support values are indicated). The bar indicates number of substitutions per site.
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Metabolic exchange between Novymonas esmeraldas and its endosymbiont “Ca. Pandoraea novymonadis”: The urea cycle of N. esmeraldas. The urea cycle is divided over host and endosymbiont. Enzyme contributions by host and endosymbiont are indicated by dots of different colors.
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Metabolic exchange between Novymonas esmeraldas and its endosymbiont “Ca. Pandoraea novymonadis”: Glycolysis and gluconeogenesis. Boxed metabolites are nutrients (in gray) or end products (in black). Glycolysis (red arrows) takes place both in glycosomes and in the endosymbiont. In the latter, exchange of intermediates with the host organism occurs. Gluconeogenesis (blue arrows) takes place exclusively in the host, where malate (resulting from mitochondrial amino acid metabolism) and glycerol (formed from lipid hydrolysis) are converted to glucose 6-phosphate. Enzymes: 1, hexokinase; 2, phosphoglucose isomerase; 3, phosphofructokinase; 3a, fructose-bisphosphatase; 4, fructose-bisphosphate aldolase; 5, triosephosphate isomerase; 6, glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase; 7, phosphoglycerate kinase; 8, phosphoglycerate mutase; 9, enolase; 10, pyruvate kinase; 11, phosphoenolpyruvate carboxykinase; 12, pyruvate phosphate di-kinase; 13, malate dehydrogenase; 14, fumarate hydratase; 15, NADH-dependent fumarate reductase; 16, malic enzyme; 17, phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase. 18, glycerol-3-phosphate dehydrogenase (NAD); 19, glycerol kinase. Enzyme contributions by host and endosymbiont are indicated by dots of different colors.
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Metabolic exchange between Novymonas esmeraldas and its endosymbiont “Ca. Pandoraea novymonadis”: Summarized scheme of metabolic exchange between N. esmeraldas and its endosymbiont “Ca. P. novymonadis.” Abbreviations: F6P, fructose 6-phosphate; F1,6P2, fructose 1,6-bisphosphate; 3PGA, 3-phosphoglycerate; 2PGA, 2-phosphoglycerate; S7P, sedoheptulose 7-phosphate; GA3P, glyceraldehyde 3-phosphate; HMP, hexose-monophosphate shunt, or pentose-phosphate pathway.
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Autor/Urheber: Alexei Y. Kostygov, Eva Dobáková, Anastasiia Grybchuk-Ieremenko, Dalibor Váhala, Dmitri A. Maslov, Jan Votýpka, Julius Lukeš, Vyacheslav Yurchenko, Lizenz: CC BY-SA 3.0
Scanning electron microscopy (SEM) images of Novymonas esmeraldas and “Ca. Pandoraea novymonadis”.
(A) Free-swimming promastigote of N. esmeraldas;
(B) sessile forms (both pro- and choanomastigote-shaped, with or without modified flagellum);
(C) prominently modified flagellum of a sessile choanomastigote;
(D) bacilli in the axenic culture of “Ca. P. novymonadis.”
Scale bars are 5 µm (A), 2 µm (B), 400 nm (C), and 1 µm (D).
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Autor/Urheber: Alexei Y. Kostygov, Eva Dobáková, Anastasiia Grybchuk-Ieremenko, Dalibor Váhala, Dmitri A. Maslov, Jan Votýpka, Julius Lukeš, Vyacheslav Yurchenko, Lizenz: CC BY-SA 3.0
16S rRNA-based Bayesian phylogenetic tree of bacterial endosymbionts of trypanosomatids. Names of species for sequences retrieved from GenBank are indicated. The species „Ca. Pandoraea novymonadis“ is highlighted. “Ca. Kinetoplastibacterium” spp. (family Alcaligenaceae) are boxed and shaded. Bayesian posterior probabilities and bootstrap percentages for maximum likelihood analysis are shown at the nodes. Slashed branches are at 50 % of their original lengths. Dashes indicate bootstrap support below 50 % or different maximum-likelihood topology. Black dots represent 100 % bootstrap support and Bayesian posterior probability of 1.0. The tree was rooted with sequences of four species of the order Neisseriales. The scale bar denotes the number of substitutions per site.
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Autor/Urheber: Alexei Y. Kostygov, Eva Dobáková, Anastasiia Grybchuk-Ieremenko, Dalibor Váhala, Dmitri A. Maslov, Jan Votýpka, Julius Lukeš, Vyacheslav Yurchenko, Lizenz: CC BY-SA 3.0
Transmission electron microscopy (TEM) images of Novymonas esmeraldas and “Ca. Pandoraea novymonadis”
(A) General view of Novymonas cell showing typical features of trypanosomatids such as the nucleus (n), kinetoplast (k), mitochondrion (m), and flagellar pocket (fp), as well as the bacterial symbionts (b).
(B) Interaction between the bacteria and the trypanosomatid cell demonstrating fusion of lysosomes (ly) with bacterium-containing vacuoles in the cytoplasm of the host (ch). Intact and degrading bacteria are labeled ib and db, respectively.
(C) Magnification of boxed part of panel B showing the membrane (arrowhead) of the symbiontophorous vacuole (sv), bacterial cell wall (white asterisk), periplasmic space (black asterisk), and internal membrane (arrow).
(D) Cross section of Novymonas cell showing mitochondrial hypertrophy.
(E) The early stage of the fusion between a bacterium and a lysosome.
(F) Endosymbiotic bacillus in the axenic culture of “Ca. P. novymonadis” with the same structure of cell covering as is seen in panel C.
Scale bars are 1 µm (A, D), 500 nm (B), 100 nm (C), and 200 nm (E, F).
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Autor/Urheber: Alexandra Zakharova, Andreu Saura, Anzhelika Butenko, Lucie Podešvová, Sandra Warmusová, Alexei Yu. Kostygov, Anna Nenarokova, Julius Lukeš, Fred R. Opperdoes, Vyacheslav Yurchenko, Lizenz: CC BY 4.0
Live Novymonas esmeraldas cells expressing mCherry (fluorescence microscopy). Bright field, SYTO 24, mCherry and the merged image are presented in the corresponding columns. The mCherry-expressing and wild-type N. esmeraldas cells are shown in the upper and lower panels, respectively. Bar, 5 μm.