Myoviren

Die Einteilung der Viren in Sys­te­matiken ist kontinuierlicher Gegen­stand der Forschung. So existieren neben- und nacheinander ver­schie­dene Virusklassifikationen sowie die offizielle Virus-Taxonomie des Inter­national Com­mit­tee on Taxo­nomy of Viruses (ICTV). Die hier behandelte Gruppe ist als Taxon durch neue For­schungen obsolet geworden oder aus anderen Gründen nicht Teil der offiziellen Virus-Taxonomie.

Myoviren
Bacteriophage P2.jpg

P2-Phagen im TEM

Systematik
Klassifikation:Viren
Realm:Duplodnaviria[1]
Reich:Heunggongvirae
Phylum:Uroviricota
Klasse:Caudoviricetes[1]
ohne Rang:„Myoviruses“
Taxonomische Merkmale
Genom:dsDNA linear
Baltimore:Gruppe 1
Symmetrie:ikosaedrisch, tailed
Hülle:keine
Wissenschaftlicher Name
„Myoviruses“
Links
ViralZone (Expasy, SIB):140
ICTV Taxon History:201900191
Typisches Aussehen eines Virusteilchens mit Myoviren-Morphologie

Die morphologisch begründete (nicht-taxonomische) Gruppe der Myoviren (englisch myoviruses, früher auch Morphotyp A genannt) umfasst eine Reihe von Familien, Unterfamilien und Gattungen von Viren mit einem linearen Molekül doppelsträngiger DNA (dsDNA) als Genom. Alle Mitglieder gehören zur Klasse der Caudoviricetes („Schwanzviren“ – Viren mit Kopf-Schwanz-Struktur): Ihre Mitglieder besitzen ein ikosaedrisches Kapsid und ein Schwanzteil; wegen dessen kontraktiler Eigenschaft leitet sich der Gruppenname von griechisch μυόςmyos, deutsch ‚Muskel‘ ab. Als Wirte dienen Prokaryoten, meist Bakterien (Bakteriophagen), aber teilweise auch Archaeen. Innerhalb der Klasse Caudoviricetes zeichnen sich die Myoviren außerdem durch besonders große, teilweise langgestreckte Kapside (z. B. T4-Phage: 111 × 78 nm) und ein sehr großes Genom (34–169 kBp) aus (siehe Riesenphagen). Der wichtigste Vertreter ist der schon früh entdeckte T4-Phage (Spezies Enterobacteria-Virus T4, Gattung Tequatrovirus), dessen besondere Morphologie und genetische Eigenschaften in der molekularbiologischen Forschung eine herausragende Rolle spielte. Die von diesem Phagen abgeleitete T4-DNA-Ligase findet heute noch Verwendung in der Molekularbiologie. Weitere Mitglieder von Bedeutung sind der Vibrio-Phage KVP40 (Spezies Vibrio-Virus KVP40, Gattung Schizotequatrovirus), der Pseudomonas-Phage phiKZ (Spezies Pseudomonas-Virus phiKZ, Gattung Phikzvirus), der Bakteriophage P1 (Spezies Escherichia-Virus P1, Gattung Punavirus, siehe P1 Artificial Chromosome) u. a.

Die Gruppe galt lange Zeit als ein Virustaxon im Rang einer Virusfamilie mit der Bezeichnung Myoviridae. Im März 2021 wurde vorgeschlagen, diese Familie mitsamt der Ordnung Caudovirales wegen fehlender Monophylie aufzulösen und (wie damals bereits z. T. geschehen) durch neu zu schaffende Familien zu ersetzen, damit neue Ergebnisse aus der Metagenomik in die Taxonomie aufgenommen werden können.[2] Das International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) hat dem im März 2022 entsprochen.[1] Gemäß Vorschlag bleibt die Bezeichnung „Myoviren“ (englisch myoviruses) aber als informeller Sammelbegriff morphologisch ähnlicher Prokaryotenviren mit einem linearen Doppelstrang-DNA-Genom erhalten.[2]

Systematik

Die folgende Systematik nach ICTV (Stand 13. Juni 2022)[3] umfasst nur einen Teil der zugehörigen Spezies:

Nicht-taxonomische Gruppe Myoviren (en. myoviruses, auch Caudoviricetes „Morphotyp A“)

  • Ordnung Thumleimavirales (Archaeen-Viren mit Kopf-Schwanz-Struktur mit Myo- und Siphoviren-Morphologie, hier nur die Myoviren-Familie(n))[4]
  • Familie Druskaviridae (früher Queuoviridae, Myoviren)
    • ohne zugewiesene Unterfamilie
      • Gattung Hacavirus
        • Spezies Hacavirus HCTV1
      • Gattung Tredecimvirus
        • Spezies Tredecimvirus HVTV1
  • Familie Hafunaviridae (früher zu Myoviridae, Myoviren)
    • ohne zugewiesene Unterfamilie
      • Gattung Haloferacalesvirus (früher Hfunalikevirus, 7 Spezies)
        • Spezies Haloferacalesvirus HF1 (mit Haloferax virus HF1, HF2 alias Halovirus HF1, HF2, Halorubrum coriense virus Hardycor2)
        • Spezies Haloferacalesvirus HJTV2
        • Spezies Haloferacalesvirus HRTV5 (früher Halorubrum tailed virus 5, 9, 13, 16, 21; HRTV-5, -9, -13, -16 -21; sowie Haloarcula californiae tailed virus 7 syn. 12, 8, 9, 10; HCTV-7 = HCTV-12, -8, -9, -10; und Haloarcula japonica tailed virus 1; HJTV-1)
        • Spezies Haloferacalesvirus HRTV8 (mit Halorubrum tailed virus 8, 14, 17, 19, 23; HRTV-8, -14, -17, -23)
        • Spezies Haloferacalesvirus HRTV10 (mit Halorubrum tailed virus 10, 18, 20, 22, 26; HRTV-10, -18, -20, -26)
        • Spezies Haloferacalesvirus HSTV4 (mit Halorubrum sodomense tailed virus 4; HSTV-4)
        • Spezies Haloferacalesvirus Serpecor1 (mit Halorubrum coriense virus Serpecor1)
      • Gattung Laminvirus
        • Spezies Laminvirus HRTV25
      • Gattung Mincapvirus
        • Spezies Mincapvirus HSTV2
      • Gattung Minorvirus
        • Spezies Minorvirus HRTV27
  • Familie Halomagnusviridae (Myoviren)
    • ohne zugewiesene Unterfamilie
      • Gattung Hagravirus
        • Spezies Hagravirus HGTV1
  • Familie Soleiviridae (Myoviren)
    • ohne zugewiesene Unterfamilie
      • Gattung Eilatmyovirus
        • Spezies Eilatmyovirus HATV2
  • Myoviren ohne aktuelle Ordnungszuweisung
  • Unterfamilie Aglimvirinae
  • Unterfamilie Cvivirinae
  • ohne zugewiesene Unterfamilie (7 Gattungen)
  • Unterfamilie Cleopatravirinae[6]
  • Unterfamilie Nefertitivirinae[6]
  • Familie Kyanoviridae (45 Gattungen) – eine Familie von Cyanophagen
  • ohne zugewiesene Unterfamilie
  • Gattung Acionnavirus
  • Gattung Ahtivirus
  • Gattung Alisovirus
  • Gattung Anaposvirus
  • Gattung Atlauavirus
  • Gattung Bellamyvirus
  • Gattung Bristolvirus
  • Gattung Brizovirus
  • Gattung Chalconvirus
  • Gattung Charybdisvirus
  • Gattung Cymopoleiavirus
  • Gattung Emcearvirus
  • Gattung Galenevirus
  • Gattung Gibbetvirus
  • Gattung Glaucusvirus
  • Gattung Greenvirus
    • Spezies Prochlorococcus-Phage P-SSM4 (wiss. Greenvirus ssm4, früher Prochlorococcus phage P-SSM4 alias Cyanophage P-SSM4)[7][8]
  • Gattung Haifavirus
  • Gattung Kanaloavirus
  • Gattung Leucotheavirus
  • Gattung Libanvirus
  • Gattung Lipsvirus
  • Gattung Lowelvirus
  • Gattung Macariavirus
  • Gattung Makelovirus
  • Gattung Mazuvirus
  • Gattung Namakavirus
  • Gattung Neptunevirus
    • Spezies Synechococcus-Virus SRIM8 (wiss. Neptunevirus srim18, früher Synechococcus virus SRIM8)
    • Spezies Synechococcus-Virus SRIM50 (wiss. Neptunevirus srim50, früher Synechococcus virus SRIM50)
  • Gattung Nereusvirus
    • Spezies Synechococcus-Virus ACG2014bSyn7803C61 (wiss. Nereusvirus tusconc61, früher Synechococcus virus ACG2014bSyn7803C61)
    • Spezies Synechococcus-Virus ACG2014bSyn9311C4 (wiss. Nereusvirus tusconc4, früher Synechococcus virus ACG2014bSyn9311C4)
  • Gattung Neritesvirus
  • Gattung Nerrivikvirus
  • Gattung Nilusvirus
    • Spezies Synechococcus-Virus SRIM2 (wiss. Nerrivikvirus srim2, früher Synechococcus virus SRIM2)
TEM-Aufnahme eines Virions von Synechococcus-Virus SPM2
  • Gattung Nodensvirus
    • Spezies Synechococcus-Virus SPM2 (wiss. Nodensvirus spm2, früher Synechococcus virus SPM2, mit Synechococcus-Phage S-PM2 alias Bacteriophage S-PM, Referenzstamm)[9][8]
  • Gattung Ormenosvirus
    • Spezies Ormenosvirus syn9, mit Synechococcus-Phage syn9 (alias Bacteriophage Syn9 oder Cyanophage Syn9)[10][11]
  • Gattung Palaemonvirus
  • Gattung Pontusvirus
  • Gattung Potamoivirus
  • Gattung Ronodorvirus
Salacisavirus pssm2 (Gattung Salacisavirus) mit (A) nicht kontrahiertem und (B) kontrahiertem Schwanz, und „Myovirus P-SSM4“ (informelle Gattung „Cyanomyovirus“) mit (C) kontrahiertem und (D) nicht kontrahiertem Schwanz. Man beachte die T4-ähnliche Kapsid-, Grundplatten- und Schwanzstruktur in beiden Myoviren. Skalenbalken 100 nm.
Wenn der Phage P-SSM2 Fd (rosa) das Cyanobakterium Prochlorococcus marinus infiziert, produziert er ein Ferredoxin-Protein, das sich in die bestehende elektrische Struktur des Bakteriums einhakt und seinen Stoffwechsel verändert.[12][13][14]
  • Gattung Salacisavirus
    • Spezies Prochlorococcus-Virus PSSM2 (wiss. Salacisavirus pssm2, früher Myovirus P-SSM2,[15][16][17] mit Prochlorococcus-Phage P-SSM2 alias Cyanophage P-SSM2[8] und Phage P-SSM2 Fd – Fd wie Ferredoxin, Wirt: Prochlorococcus marinus)[18][19]
  • Gattung Sedonavirus
  • Gattung Shandvirus
  • Gattung Sokavirus
  • Gattung Tefnutvirus
  • Gattung Thaumasvirus
  • Gattung Thetisvirus
    • Spezies Synechococcus-Virus SSM1 (wiss. Thetisvirus ssm1, mit Synechococcus-Phage S-SM1 alias Cyanophage S-SM1)[20][16][17]
  • Gattung Vellamovirus
  • Familie Peduoviridae (52 Gattungen, ehemalige Myoviridae-Unterfamilie Peduovirinae)
  • ohne zugewiesene Unterfamilie:
  • Gattung Aptresvirus
  • Gattung Aresaunavirus
  • Gattung Arsyunavirus
  • Gattung Baylorvirus
  • Gattung Bielevirus
  • Gattung Bracchivirus
  • Gattung Canoevirus
  • Gattung Catalunyavirus
  • Gattung Citexvirus
  • Gattung Dagavirus
  • Gattung Duodecimduovirus
  • Gattung Eganvirus
  • Gattung Elveevirus
  • Gattung Entnonagintavirus
  • Gattung Evevirus
  • Gattung Felsduovirus
  • Gattung Finvirus
  • Gattung Gegevirus
  • Gattung Gemsvirus
  • Gattung Hpunavirus (früher Hp1virus, Hpunalikevirus, Hp1likevirus)
    • Spezies Haemophilus-Virus HP1 (wiss. Hpunavirus HP1)
    • Spezies Hpunavirus HP2
  • Gattung Irrigatiovirus
  • Gattung Irtavirus
    • Spezies Pasteurella-Virus F108 (wiss. Irtavirus F108, früher Pasteurella virus F108, mit Bacteriophage F108)[24][25]
  • Gattung Kapieceevirus
  • Gattung Kayeltresvirus
  • Gattung Kisquattuordecimvirus
  • Gattung Kisquinquevirus
  • Gattung Longwoodvirus
  • Gattung Maltschvirus
  • Gattung Mersinvirus
  • Gattung Nampongvirus
  • Gattung Novemvirus
  • Gattung Peduovirus (früher P2virus, P2likevirus, P2-ähnliche Viren, 13 Spezies)
    • Spezies Escherichia-Virus P2 (wiss. Peduovirus P2, früher Escherichia virus P2, mit Enterobacteria-Phage P2 alias P2-Phage)[Anmerkung 1][26]
  • Gattung Phitrevirus
  • Gattung Playavirus
  • Gattung Plazymidvirus
  • Gattung Quadragintavirus
  • Gattung Reginaelenavirus
  • Gattung Reipivirus
  • Gattung Sanguivirus
  • Gattung Senquatrovirus
  • Gattung Seongnamvirus
  • Gattung Simpcentumvirus
  • Gattung Stockinghallvirus
  • Gattung Tigrvirus
  • Gattung Valbvirus
  • Gattung Vimunumvirus
  • Gattung Vulnificusvirus
  • Gattung Wadgaonvirus
  • Gattung Xuanwuvirus
  • Gattung Yongunavirus
  • Gattung Yulgyerivirus
  • Familie Straboviridae
  • Unterfamilie Emmerichvirinae
  • Gattung Ceceduovirus
  • Gattung Ishigurovirus
  • Gattung Dhakavirus (früher Js98virus)
  • Gattung Gaprivervirus (früher Sp18virus)
  • Gattung Gelderlandvirus (früher S16virus)
  • Gattung Jiaodavirus (früher Jd18virus)
  • Gattung Kagamiyamavirus
  • Gattung Kanagawavirus
  • Gattung Karamvirus (früher Cc31virus)
  • Gattung Moonvirus
  • Gattung Mosigvirus (früher Rb69virus)
  • Gattung Mosugukvirus
  • Gattung Roskildevirus
  • Gattung Tegunavirus (früher Tg1virus)
  • Spezies Tegunavirus fheyen901
  • Spezies Yersinia-Virus R1RT (wiss. Tegunavirus r1rt, früher Yersinia virus R1RT)
  • Spezies Tegunavirus yenmtg1
  • Gattung Tequatrovirus (früher T4virus, T4likevirus, T4-ähnliche Viren)
  • Gattung Winklervirus
  • Unterfamilie Twarogvirinae
  • Gattung Acajnonavirus
  • Gattung Hadassahvirus
  • Gattung Lasallevirus
  • Gattung Lazarusvirus
  • Gattung Zedzedvirus
  • ohne zugewiesene Unterfamilie (14 Gattungen)
  • Gattung Angelvirus
  • Gattung Biquartavirus
  • Gattung Bragavirus
  • Gattung Carettavirus
  • Gattung Chrysonvirus
  • Gattung Cinqassovirus
  • Gattung Gualtarvirus
  • Gattung Jiangsuvirus
  • Gattung Krischvirus (früher Rb49virus)
  • Gattung Mylasvirus (ausgegliedert aus Schizotequatrovirus)
    • Spezies Vibrio-Virus nt1 (wiss. Mylasvirus persius, früher Vibrio virus nt1), mit Vibrio-Phage nt-1
  • Gattung Pseudotevenvirus
  • Gattung Schizotequatrovirus (früher Schizot4virus)
  • Gattung Slopekvirus (früher Kp15virus, nicht zu verwechseln mit der Unterfamilie Slopekvirinae in Familie Autographiviridae):::* Gattung Slopekvirus (früher Kp15virus, nicht zu verwechseln mit der Unterfamilie Slopekvirinae in Familie Autographiviridae)
  • Gattung Tulanevirus (früher Secunda5virus)
  • Gattung Pormufvirus
  • Familie Vertoviridae (2 Gattungen)
    • ohne zugewiesene Unterfamilie
  • Gattung Myohalovirus (früher Phihlikevirus, phiH-like viruses, PhiH-ähnliche Viren)
    • Spezies Halobacterium-Virus phiH (wiss. Myohalovirus phiH, früher Halobacterium virus phiH, mit Halobacterium-Phage PhiH, Phage ϕH – Akronym ΦH, Fehlschreibung: Phage øH – und Variante phiH1)
    • Spezies Myohalovirus phiCh1 (mit Natrialba phage PhiCh1)
    • Spezies „Halobacterium-Phage Hs1“ (en. „Halobacterium phage Hs1“)[27]
  • Familie Winoviridae (2 Gattungen)
    • ohne zugewiesene Unterfamilie
  • Gattung Peternellavirus
  • Gattung Pippivirus
  • keiner Familie zugeordnet:
  • Unterfamilie Ceeclamvirinae
  • Gattung Bixzunavirus (früher Bxzunalikevirus, Bxz1virus, I3likevirus, I3-like viruses, I3-ähnliche Viren)
    • Spezies Bixzunavirus alice
    • Spezies Bixzunavirus charlieB
    • Spezies Bixzunavirus hyro
    • Spezies Bixzunavirus nappy
    • Spezies Bixzunavirus noodletree
    • Spezies Bixzunavirus quasimodo
    • Spezies Bixzunavirus sauce
    • Spezies Mycobacterium-Virus Bxz1 (wiss. Bixzunavirus Bxz1, früher Mycobacterium virus Bxz1, mit Mycobacterium-Phage Bxz1, Mycobacterium-Phage Cali, Mycobacterium-Phage Catera, Mycobacterium-Phage Rizal, Mycobacterium-Phage ScottMcG, Mycobacterium-Phage Spud)
    • Spezies Mycobacterium-Virus I3 (wiss. Bixzunavirus I3, früher Mycobacterium virus I3, mit Mycobacterium-Phage I3)
    • Spezies „Mycobacterium-Phage Nidhogg“ (en. „Mycobacterium phage Nidhogg“) (Vorschlag, wohl zu unterscheiden von Asgardviren mit vorgeschlagener Bezeichnung Nidhogg-Viren, en. Nidhogg viruses)[28]
    • Spezies „Mycobacterium-Phage ChickenPhender“ (en. „Mycobacterium phage ChickenPhender)“ (Vorschlag)
  • Gattung Myrnavirus
    • Spezies Mycobacterium-Virus Myrna (wiss. Myrnavirus myrna, mit Mycobacterium-Phage Myrna)
  • Unterfamilie Eucampyvirinae
  • Gattung Firehammervirus (früher Cp220virus, Cp220likevirus, Cp220-ähnliche Viren)
    • Spezies Campylobacter-Virus IBB35 (wiss. Campylobacter virus IBB35)
    • Spezies Campylobacter-Virus CP21 (wiss. Firehammervirus CP21)
    • Spezies Campylobacter-Virus CP220 (wiss. Firehammervirus CP220)
    • Spezies Campylobacter-Virus CPt10 (wiss. Firehammervirus CPt10)
    • Spezies „Campylobacter-Phage F379“ (en. „Campylobacter phage F379“)[29]
  • Gattung Fletchervirus (früher Cp8virus, Cp8unalikevirus)
    • Spezies Campylobacter-Virus CP81 (wiss. Fletchervirus CP81)
    • Spezies Fletchervirus CP30A
    • Spezies Fletchervirus CPX
    • Spezies Fletchervirus Los1
    • Spezies Fletchervirus NCTC12673
  • Unterfamilie Gorgonvirinae
  • Gattung Aphroditevirus
  • Gattung Tidunavirus
  • Unterfamilie Kantovirinae
  • Gattung Beograduvirus
  • Gattung Tsukubavirus
    • Spezies Xanthomonas-Virus OP2 (wiss. Tsukubavirus OP2 früher in Gattung Naesvirus)
  • Unterfamilie Ounavirinae
  • Gattung Felixounavirus (früher Felixo1virus, Felixounalikevirus)
    • Spezies Salmonella-Virus FelixO1 (wiss. Felixounavirus felixO1)
  • Gattung Kolesnikvirus (früher Ea214virus)
    • Spezies Kolesnikvirus Ea214
  • Gattung Mooglevirus
    • Spezies Citrobacter-Virus Moogle (wiss. Mooglevirus moogle)
  • Gattung Suspvirus
    • Spezies Suspvirus SUSP1
    • Spezies Suspvirus SUSP2
  • Unterfamilie Stephanstirmvirinae
  • Gattung Justusliebigvirus (6 Spezies)
  • Spezies Justusliebigvirus muut (mit Escherichi-Phage muut)
  • Spezies Justusliebigvirus phi92 (mit Enterobacteria-Phage phi92, en. Enterobacteria phage phi92)[30][31]
  • Gattung Phapecoctavirus (13 Spezies)
    • Spezies Escherichia-Phage ESCO13 (wiss. Escherichia phage ESCO13)
    • Spezies Escherichia-Virus ESCO5 (wiss. Escherichia virus ESCO5)
    • Spezies Escherichia-Virus phAPEC8 (wiss. Escherichia virus phAPEC8)
    • Spezies Escherichia-Virus Schickermooser (wiss. Escherichia virus Schickermooser)
    • Spezies Klebsiella-Virus ZCKP1 (wiss. Klebsiella virus ZCKP1)
    • Spezies Phapecoctavirus anhysbys (mit Escherichia-Phage anhysbys)
  • Unterfamilie Vequintavirinae
  • Gattung Avunavirus
  • Gattung Certrevirus (früher Cr3virus)
  • Gattung Henunavirus
  • Gattung Mydovirus
  • Gattung Seunavirus (früher Se1virus)
    • Spezies Seunavirus 4MG
    • Spezies Seunavirus GAP31
    • Spezies Salmonella-Virus PVPSE1 (wiss. Seunavirus PVPSE1, mit Salmonella-Phage PVP-SE1)[32]
    • Spezies Seunavirus SSE121
  • Gattung Vequintavirus (früher V5virus, Rv5likevirus, rV5-like viruses)[31]
    • Spezies Escherichia-Virus APECc02 (wiss. Vequintavirus APECc02, früher Escherichia virus APECc02)
    • Spezies Escherichia-Virus FFH2 (wiss. Vequintavirus FFH2, früher Escherichia virus FFH2)
    • Spezies Escherichia virus FV3 (wiss. Vequintavirus FV3, früher Escherichia virus FV3, mit Escherichia-Phage vB_EcoM_FV3)[33]
    • Spezies Escherichia-Virus JES2013 (wiss. Vequintavirus JES2013, früher Escherichia virus JES2013)
    • Spezies Escherichia-Virus Murica (wiss. Vequintavirus murica, früher Escherichia virus Murica)
    • Spezies Escherichia-Virus slur16 (wiss. Vequintavirus slur16, früher Escherichia virus slur16)
    • Spezies Escherichia-Virus V5 (Vequintavirus V5, früher Escherichia virus V5, mit Escherichia-Phage rV5)[34]
    • Spezies Escherichia-Virus V18 (Vequintavirus V18, früher Escherichia virus V18)
  • small myoviruses (auch dwarf myoviruses, φPLPE-like phages, französisch myovirus nains, Plpelikevirus-Gruppe – informelle Gruppe kleiner Myoviren)[35]
  • Gattung Iodovirus
    • Spezies Iodobacter-Virus PLPE (wiss. Iodovirus PLPE, mit Iodobacter-Phage phiPLPE)
  • Gattung Popoffvirus
    • Spezies Aeromonas-Virus 56 (wiss. Popoffvirus pv56, mit Aeromonas-Phage 56, Akronym φPLPE, früher in Plpelikevirus alias Dwarf myoviruses)[35]
  • keiner Gattung zugeordnet
    • Spezies „Aggregatibacter-Phage Aaphi23“ (alias „Bacteriophage Aaphi23“, „Haemophilus-Phage Aaphi23“, Akronym AaΦ23, vorgeschlagen)[36][37][35]
    • Spezies „Bdellovibrio-Phage phi1402“ (englisch „Bdellovibrio phage phi1402“)
    • Spezies „Bdellovibrio-Phage phi1422“ (englisch „Bdellovibrio phage phi1422“)[35]
    • Spezies „Pectobacterium-Phage ZF40“ (englisch „Pectobacterium phage ZF40“)[38][35]
    • Spezies „Vibrio-Phage 138“[35]
    • Spezies „Vibrio-Phage CP-T1“[35]
    • Spezies „Yersinia-Phage PY100“[35]
  • weitere Vertreter, keiner Unterfamilie zugeordnet:
  • Gattung Abouovirus
  • Gattung Agricanvirus (früher Agrican357virus)
  • Gattung Alcyoneusvirus
  • Gattung Alexandravirus
  • Gattung Anamdongvirus
  • Gattung Aokuangvirus
  • Gattung Asteriusvirus
  • Gattung Aurunvirus
  • Gattung Ayohtrevirus
  • Gattung Baikalvirus
  • Gattung Bakolyvirus
  • Gattung Barbavirus
  • Gattung Bcepfunavirus
  • Gattung Bcepmuvirus (alias Bcepmulikevirus, Bcepmu-ähnliche Viren)
    • Spezies Burkholderia-Virus BcepMu (wiss. Bcepmuvirus bcepMu, früher Burkholderia virus BcepMu, Typus)
  • Gattung Becedseptimavirus
  • Gattung Bendigovirus
  • Gattung Borockvirus
  • Gattung Brigitvirus
  • Gattung Brunovirus
  • Gattung Busanvirus
  • Gattung Carpasinavirus
  • Gattung Chakrabartyvirus
  • Gattung Chiangmaivirus (früher Rsl2virus)
  • Gattung Colneyvirus (5 Spezies)
    • Spezies Clostridioides-Virus phiCD27 (wiss. Colneyvirus CD27, früher Clostridioides virus phiCD27; als Clostridium virus phiCD27 offenbar in der NCBI-Taxonomie fehlerhaft der Gattung Lubbockvirus zugeordnet; mit Clostridium phage phiCD27, ΦCD27)[39]
    • Spezies Colneyvirus CD505
    • Spezies Colneyvirus CDKM9
    • Spezies Colneyvirus CDKM15
    • Spezies Colneyvirus MMP02
  • Gattung Derbicusvirus
  • Gattung Dibbivirus
  • Gattung Donellivirus
    • Spezies Bacillus virus G
  • Gattung Elmenteitavirus
  • Gattung Elvirus (früher Ellikevirus)
    • Spezies Pseudomonas-Virus EL (wiss. Elvirus EL, früher Pseudomonas virus EL mit Pseudomonas-Phage EL, phiEL[40][41] und Pseudomonas-Phage ELvir, phiELvir, einer virulenten Mutante)[40]
  • Gattung Emdodecavirus (früher M12virus)
  • Gattung Eneladusvirus
  • Gattung Eponavirus
  • Gattung Erskinevirus (früher Eah2virus)
  • Gattung Eurybiavirus
  • Gattung Ficleduovirus
  • Gattung Flaumdravirus
  • Gattung Fukuivirus
    • Spezies Microcystis-Virus Ma-LMM01 (wiss. Fukuivirus LMM01, früher Microcystis virus LMM01, Microcystis virus Ma-LMM01)
    • Spezies Microcystis virus MVDC (wiss. Fukuivirus MVDC)
  • Gattung Gofduovirus
  • Gattung Goslarvirus
    • Spezies Goslarvirus goslar
  • Gattung Hapunavirus (früher Hapunalikevirus, Hap1likevirus)
    • Spezies Halomonas-Virus HAP1 (wiss. Hapunavirus HAP1)
  • Gattung Heilongjiangvirus
  • Gattung Iapetusvirus
  • Gattung Ionavirus
  • Gattung Jedunavirus
  • Gattung Jilinvirus (früher Cvm10virus)
  • Gattung Jimmervirus
  • Gattung Klausavirus (früher Radnorvirus, Arv1virus)
  • Gattung Kleczkowskavirus (früher Rheph4virus)
  • Gattung Kungbxnavirus
  • Gattung Kylevirus
  • Gattung Lagaffevirus
  • Gattung Llyrvirus
  • Gattung Loughboroughvirus
    • Spezies Salmonella-Virus ZCSE2 (wiss. Salmonella virus ZCSE2, früher Rosemountvirus ZCSE2, ehem. Gattung Rosemountvirus)
  • Gattung Lubbockvirus (früher Cd119virus, Phicd119likevirus)
    • Spezies Clostridium-Virus phiCD119 (wiss. Lubbockvirus CD119)
    • Spezies Lubbockvirus CDHM19
TEM-Aufnahme eines Virions der Kandidatenspezies „Salmonella phage pSal-SNUABM-04“, Gattung Machinavirus. Balken 100 nm.[42]
  • Gattung Machinavirus
    • Spezies Erwinia-Virus Machina (wiss. Machinavirus machina, früher Erwinia virus Machina)
    • Spezies „Salmonella-Phage pSal-SNUABM-04“ (en. „Salmonella phage pSal-SNUABM-04“)[43][42][Anmerkung 2]
  • Gattung Marthavirus
  • Gattung Menderavirus
  • Gattung Metrivirus
  • Gattung Mieseafarmvirus (früher Rslunavirus)
  • Gattung Mimasvirus
  • Gattung Moabitevirus
  • Gattung Moturavirus
  • Gattung Muldoonvirus
  • Gattung Mushuvirus
  • Gattung Muvirus (früher Mulikevirus, Mu-like viruses, Mu-like phages, Mu-ähnliche Viren, 2 Spezies)
TEM-Aufnahme zweier Virionen von Alteromonas-Myovirus V22.
  • Spezies Shigella-Virus SfMu (wiss. Muvirus SfMu)
  • Gattung Myoalterovirus
    • Spezies Alteromonas-Myovirus V22 (wiss. Myoalterovirus PT11V22, früher Alteromonas virus AltPT11-V22, mit Alteromonas phage AltPT11-V22)[45]
  • Gattung Myosmarvirus
  • Gattung Naesvirus (früher Vidavervirus, Bcep78virus, Bcep78likevirus, Bcep78-ähnliche Viren)
    • Spezies Naesvirus bcep1 (früher Burkholderia virus Bcep1)
    • Spezies Naesvirus bcep43 (früher Burkholderia virus Bcep43)
    • Spezies Naesvirus bcep781 (früher Burkholderia virus Bcep781)
    • Spezies Naesvirus bcepNY3
Reproduktionszyklus von Pseudomonas-Phage PAK_P3
  • Gattung Nankokuvirus (früher Kpp10virus)
    • Spezies Nankokuvirus Ab03
    • Spezies Nankokuvirus G1
    • Spezies Nankokuvirus KPP10
    • Spezies Pseudomonas-Virus PAKP3 (wiss. Nankokuvirus PAKP3, mit Pseudomonas-Phage PAK_P3)
    • Spezies Nankokuvirus PS24
  • Gattung Noxifervirus
  • Gattung Nylescharonvirus
  • Gattung Obolenskvirus (früher Ap22virus)
  • Gattung Otagovirus
EM-Aufnahmen von Phagenpartikel der Kandidatenspezies „Pseudomonas-Phage K8“, Balken 50 nm.[46]
  • Gattung Pakpunavirus
    • Spezies Pakpunavirus CAb1
    • Spezies Pakpunavirus CAb02
    • Spezies Pakpunavirus JG004
    • Spezies Pakpunavirus MAG1
    • Spezies Pseudomonas-Virus phiMK (wiss. Pakpunavirus MK, früher Pseudomonas virus phiMK)
    • Spezies Pakpunavirus PA10
    • Spezies Pseudomonas-Virus PAKP1 (wiss. Pakpunavirus PAKP1, früher Pseudomonas virus PAKP1)
    • Spezies Pseudomonas-Virus PAKP2 (wiss. Pakpunavirus PAKP2, früher Pseudomonas virus PAKP2)
    • Spezies Pseudomonas-Virus PAKP4 (wiss. Pakpunavirus PAKP4, früher Pseudomonas virus PAKP4)
    • Spezies Pakpunavirus PaP1
    • Spezies Pseudomonas-Virus Zigelbrucke (wiss. Pakpunavirus zigelbrucke, früher Pseudomonas virus Zigelbrucke)
    • Spezies „Pseudomonas-Phage K5“ (en. „Pseudomonas phage K5“)[47]
    • Spezies „Pseudomonas-Phage K8“ (en. „Pseudomonas phage K8“)[48][46]
  • Gattung Pbunavirus (früher Pbunalikevirus, PB1likevirus)
    • Spezies Pseudomonas-Virus PB1 (wiss. Pbunavirus PB1, mit Pseudomonas-Phage PB1)
  • Gattung Peatvirus
  • Gattung Pemunavirus
  • Gattung Petsuvirus
  • Gattung Phabquatrovirus
  • Gattung Phikzvirus (früher Phikzlikevirus, PhiKZ-like viruses, PhiKZ-ähnliche Viren)[49]
    • Spezies Pseudomonas-Virus PA7 (wiss. Phikzvirus PA7)
    • Spezies Pseudomonas-Virus phiKZ (wiss. Phikzvirus phiKZ, ehem. Typus, mit Pseudomonas-Phage PhiKZ alias Bacteriophage ϕKZ; Akronym ΦKZ oder φKZ)[40]
    • Spezies Pseudomonas-Virus SL2 (wiss. Phikzvirus SL2)
    • Spezies „Pseudomonas-Phage 201phi2-1“ (en. „Pseudomonas chlororaphis phage 201phi2-1“)[50][51][52]
  • Gattung Plaisancevirus
  • Gattung Plateaulakevirus
  • Gattung Polybotosvirus
  • Gattung Punavirus (früher P1virus, Punalikevirus, P1likevirus, P1-ähnliche Viren, 2 Spezies)
    • Spezies Aeromonas-Virus 43 (wiss. Aeromonas virus 43, mit Aeromonas-Phage 43)
    • Spezies Escherichia-Virus P1 (wiss. Punavirus P1, mit Referenzstamm Enterobacteria-Phage P1 alias P1-Phage) — siehe P1 Artificial Chromosome (PAC)[53]
    • Spezies Punavirus RCS47
    • Spezies Punavirus SJ46
  • Gattung Qingdaovirus
  • Gattung Ripduovirus
  • Gattung Risingsunvirus
Virionen von LPSEYT[54]
Genomkarte von LPSEYT[54]
  • Gattung Rosemountvirus (früher LPSEYTvirus)[54][55]
    • Spezies Salmonella-Virus birk (wiss. Rosemountvirus birk, früher Salmonella virus birk)
    • Spezies Salmonella-Virus BP63 (wiss. Rosemountvirus BP63, früher Salmonella virus BP63)
    • Spezies Salmonella-Virus SE13 (wiss. Rosemountvirus SE13, früher Salmonella virus SE13)
    • Spezies Salmonella-Virus UPFBP2 (wiss. Rosemountvirus UPFBP2, früher Salmonella virus UPFBP2)
    • Spezies Salmonella-Virus yarpen (wiss. Rosemountvirus yarpen, früher Salmonella virus yarpen)
    • Spezies „Salmonella-Phage LPSEYT“ (en. „Salmonella phage LPSEYT“ alias „Salmonella phage vB_SalM-LPSEYT“)[54][56]
  • Gattung Saclayvirus
  • Gattung Saintgironsvirus
  • Gattung Salmondvirus
  • Gattung Sarumanvirus
  • Gattung Sasquatchvirus
  • Gattung Schmittlotzvirus

Rekonstruktion des doppelschaligen gesprenkelten Kapsids des Salmonella-Phagen SPN3US,[57] Gattung Seoulvirus
Mikrophotographie von Phage SPN3US mit DNA-gefülltem Kopf und kontrahiertem Schwanz.[57][Anmerkung 2]
  • Gattung Seoulvirus (früher Spn3virus), zu unterscheiden vom Seoul-Virus (Spezies Seoul orthohantavirus, Gattung Orthohantavirus)
    • Spezies Salmonella-Virus SPN3US (wiss. Seoulvirus SPN3US), mit Salmonella-Phage SPN3US[57][41]
  • Gattung Shandongvirus
  • Gattung Sherbrookevirus
  • Gattung Shirahamavirus
  • Gattung Svunavirus
  • Gattung Tabernariusvirus
  • Gattung Takahashivirus
    • Spezies Bacillus-Virus PBS1 (wiss. Takahashivirus PBS1, früher Bacillus virus PBS1, mit Bacillus subtilis phage PBS1)[58][59][60]
  • Gattung Tamkungvirus
  • Gattung Taranisvirus
  • Gattung Thornevirus
  • Spezies Bacillus-Virus SP15 (wiss. Thornevirus SP15), mit Bacillus-Phage SP-15
  • Gattung Tijeunavirus
  • Gattung Toutatisvirus
  • Gattung Vhmlvirus (3 Spezies)
    • Spezies Vibrio-Virus VHML (wiss. Vhmlvirus VHML)
  • Gattung Vibakivirus
  • Gattung Wellingtonvirus
  • Gattung Wifcevirus
  • Gattung Yokohamavirus (früher Msw3virus)
  • Gattung Yoloswagvirus
  • Gattung Yongloolinvirus
  • Gattung „Cbasmlikevirus“ (vorgeschlagen)[61]
    • Spezies „Cellulophaga-Phage phiSM“
    • Spezies „Cellulophaga-Phage phi3:1“
    • Spezies „Cellulophaga-Phage phi3ST:2“
    • Spezies „Cellulophaga-Phage phi38:2“
    • Spezies „Cellulophaga-Phage phi47:1“
  • Gattung „Cyanomyovirus“ (informell, nicht zugeordnete Cyanophagen mit Myoviren-Morphologie)
    • Spezies „Synechococcus-Phage S-RSM2“ (en. „Synechococcus phage S-RSM2“ alias „Bacteriophage S-RSM2“)[62][8]
    • Spezies „Synechococcus-Phage S-BM4“ (en. „Synechococcus phage S-BM4“ alias „Cyanophage S-BM4“, „Bacteriophage S-BM4“)[63][8]
    • Spezies „Synechococcus-Phage S-WHM1“ (en. „Synechococcus phage S-WHM1“ alias „Cyanophage S-WHM1“)[64][8]
    • Spezies „Synechococcus-Phage S-RSM88“ (en. „Synechococcus phage S-RSM88“ alias „Cyanophage S-RSM88“, „Bacteriophage S-RSM88“)[65][8]
    • Spezies „Anabaena-Phage N-1“ (alias „Cyanophage N1“)[66][67]
    • Spezies „Cyanophage A-1(L)“ (alias „Cyanophage A-1“)[68][67]
  • Gattung „Shigella phage Sfv and relatives“ (informell, zu unterscheiden von Spezies Rabbit fibroma virus alias Shope fibroma virus,[69] Gattung Leporipoxvirus, Poxviridae und Sulfolobus filamentous virus 1, Tristromaviridae)
    • Spezies „Enterobacteria-Phage SfV“ (alias „Shigella-Phage SfV“, „Shigella flexneri bacteriophage V“)[70]
  • ohne Gattungszuweisung
TEM-Aufnahem eines Virions des Acinetobacter-Phagen SH-Ab 15708[71]
  • Spezies „Ochrobactrum-Phage vB_OspM_OC“ (englisch „Ochrobactrum phage vB_OspM_OC“)[72][73]
  • Spezies „Pseudomonas-Phage OBP“ (alias Pseudomonas fluorescens bacteriophage OBP, vorgeschlagen)[41][49][74]
  • Spezies „Sphingomonas-Phage PAU“[75][76]
  • Spezies „Bacillus-Phage PBS2“ (en. „Bacillus phage PBS2“) mit Bacteriophage PBS2.[77]
  • Spezies „Staphylococcus-Phage S6“ (en. „Staphylococcus phage S6“) mit Staphylococcus aureus Bacteriophage 15[78]
  • Spezies „Acinetobacter-Phage SH-Ab 15708“ (en. „Acinetobacter phage SH-Ab 15708“)[71][79]
TEM-Aufnahme von vB_OspM_OC; Balken 50 nm. Inset: Phage Plaques; Balken 1 mm.
  • Spezies „Shigella-Phage A1-1“ (en. „Shigella phage A1-1“)[80]
0 ● Riesenphagen (eng. „huge phages“: Jumbo- und Megaphagen ohne Rang):[81][82]
  • „Kabirphage“
  • „Mahaphage“ mit der Untergruppe
    • „Lak-Phagen“ mit den Vertretern Lak-A1, Lak-A2, Lak-B1 bis Lak-B9 und Lak-C1[83][84]
  • „Biggiephage“
  • „Dakhmphage“
  • „Kyodaiphage“
  • „Kaempephage“
  • „Jabbarphage“
  • „Enormephage“
  • „Judaphage“
  • „Whopperphage“

Anmerkungen

  1. ↑ P2 ist ein temperenter Phage. Der „Escherichia-Phage P4“ (ein Coliphage ebenfalls in der Ordnung Caudovirales, aber bisher nicht näher klassifiziert) ist ein Satellitenvirus (d. h. Satellitenphage), das den Phagen P2 als Helfervirus benötigt. Siehe Cruz (2013) und NCBI: Phage P4 satellite (no rank)
  2. ↑ a b Das Material wurde von dieser Quelle kopiert, die unter einer Creative Commons Attribution 4.0 International License verfügbar ist.

Literatur

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Weblinks

Einzelnachweise

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  3. ↑ ICTV: ICTV Master Species List 2021.v2, New MSL including some corrections.
  4. ↑ Y. Liu et al. (ICTV Archaeal Viruses Subcommittee): Proposal 2021.001A. Create three new orders and 14 new families in the class Caudoviricetes (Duplodnaviria, Uroviricota) for classification of archaeal tailed viruses. Oktober 2020. Siehe insbes. Tbl. 1.
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  14. ↑ Ocean virus hijacks carbon-storing bacteria, auf: National Science Foundation (NSF) vom 29. Mai 2020
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Structure of a Myoviridae bacteriophage 2.jpg
Autor/Urheber: Chelsea Bonnain, Mya Breitbart and Kristen N. Buck, Lizenz: CC BY-SA 4.0
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Transmission electron microscopy of the V22 (Alteromonas Myovirus ) phage. The morphology of V22 is distinctly myoviral featuring. V22 has an icosahedral capsid (ø79 ± 5 nm) and a noncontracted tail length of 121 ± 11 nm with a fiberless baseplate complex (20 ± 3.7 nm height). Dimensions calculated as mean ± SD, n = 6. Bar, 100 nm.
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Autor/Urheber: J. Bernard Heymann, Bing Wang, William W. Newcomb, Weimin Wu, Dennis C. Winkler, Naiqian Cheng, Erin R. Reilly, Ru-Ching Hsia, Julie A. Thomas, Alasdair C. Steven, Lizenz: CC BY-SA 4.0
The double shell mottled capsid of Salmonella phage SPN3US. Credit: J. Bernard Heymann et al. (2020)
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Morphological and biological features of phage pSal-SNUABM-04: Transmission electron micrograph of pSal-SNUABM-04. Scale bar = 100 nm. Credit: Jun Kwon at al. (2020)
118913 web phage PAK P3.jpg
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Reproduktionszyklus von Pseudomonas-Phage PAK_P3
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Genome organization of proposed Salmonella phage LPSEYT, Myoviridae genus LPSEYTvirus (now Rosemountvirus). Patterns are divided into four circles: the full length of the genome is indicated in the first circle; the open reading frame is indicated in the second circle, and ORFs are transcribed in the clockwise or the counterclockwise direction; GC content is indicated in the third circle; while on the fourth circle, GC skew of G-C/G+C is indicated as green and purple, and green means that the value of GC skew is greater than 0 and purple means that the value is less than 0. The open reading frames marked with red, blue, yellow and orange indicate genes encoding structural proteins, cell lysis proteins, nucleotide metabolism and genome replication proteins, and Ig-like proteins, respectively; ORFs with homology to unannotated proteins or hypothetical proteins in the database are indicated in grey.
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Phage S-PM2.png
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Autor/Urheber: Illustration by Ian Campbell/Rice University, Lizenz: CC BY-SA 4.0
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