Mininucleoviridae

„Mininucleoviridae“
MBio-2020-Subramaniam-e02938-19.F5.large.TMEjpg.jpg

TEM-Aufnahme von
PaV1 (A,B) und CmV1 (C)

Systematik
Klassifikation:Viren
Realm:Varidnaviria[2]
Reich:Bamfordvirae[2]
Phylum:Nucleocytoviricota[2]
Klasse:?Megaviricetes[1]
Ordnung:?Pimascovirales[1]
Familie:„Mininucleoviridae“[1]
Taxonomische Merkmale
Genom:dsDNA
Baltimore:Gruppe 1
Symmetrie:ikosaedrisch
Wissenschaftlicher Name
„Mininucleoviridae“

Mininucleoviridae“ ist die von K. Subramaniam et al. im Januar 2020 vorgeschlagene Bezeichnung für eine Gruppe (Klade, mit avisiertem taxonomischem Rang einer Familie) von Riesenviren des Phylums Nucleocytoviricota[2] (NCLDV, ursprünglich als Ordnung „Megavirales“ vorgeschlagen), die sich in Krustentieren replizieren.[1] Die „Mininucleoviridae“ gehören nach den Analysen vermutlich der vom International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) bestätigten Ordnung Pimascovirales an, der bis dato die bestätigten Familien Ascoviridae, Iridoviridae, Marseilleviridae, sowie die ebenfalls noch unbestätigten „Pithoviridae“ (Pithoviren) angehören.

Beschreibung

TEM-Aufnahmen von Virionen in der Karibik-Languste (Panulirus argus: PaV1), dem Kleinen Höcker­floh­krebs (Dikerogammarus haemobaphes: DhV1) und der Gemeinen Strand­krabbe (Carcinus maenas: CmV1).[1][Anm. 1]
(D–F) Die Aufnahmen zeigen vergrößerte Zell­kerne mit sich entwickelnden Viroplasmen.
(G–I) Die Morphologien der drei Viren umfassen einen Genom-Kern, umgeben von einem ikosaedrischen Nukleokapsid.

Die vorgeschlagenen Mitglieder der Gruppe sind:

Die Morphologien der drei vorgeschlagenen Spezies umfassen einen Genom-Kern, umgeben von einem ikosaedrischen Nukleokapsid. Sie replizieren wie die anderen Vertreter der Pimascovirales im Zytoplasma. Es wurden in der Zeit bis zum Jahr 2020 mehrere potenzielle NCLDVs aus Krustentierwirten identifiziert, diese scheinen sich aber nicht im Zytoplasma zu replizieren (wie allgemein von NCLDVs erwartet), sondern entwickeln sich im Zellkern von Hämozyten (Blutkörperchen) bzw. im hämopoetischen (blutkörperchen-erzeugendem) Gewebe ihrer Krustentier-Wirte, was bei diesen zur Anämie und anschließendem Tod führt. Genauere Untersuchungen standen aber anfangs 2020 noch aus.[1]

Genomkarten der Krustentierviren PaV1, DhV1 und CmV1.[1][Anm. 1]


Die „Mininucleoviridae“ besitzen ein Genom aus Doppelstrang-DNA; mit einer Länge von 70 bis 74 kbp (Kilobasenpaaren) sind dies die kleinsten bisher identifizierten NCLDV-Genome. Ein weitreichender Genverlust, Divergenz der Gensequenzen und die Anhäufung von Sequenzen mit geringer Komplexität erscheinen aber eher als Resultat einer extremen Degradation (Verkleinerung) der Genome dieser "minimalen" NCLDVs, nicht aber als eine direkte Verwandtschaft mit dem gemeinsamen NCLDV-Vorfahren[1] (LGA, letzter gemeinsamer Ahn; en. LCA oder MRCA).

Systematik

Phylogenetischer Baum der vorgeschlagenen Familie „Mininucleoviridae

Die nach Subramaniam (2020) vorgeschlagene innere Systematik ist wie folgt:[1]

  • Phylum Negarnaviricota (NCLDV)
  • Klasse Megaviricetes
  • Ordnung Pimascovirales
  • Familie „Mininucleoviridae
  • Spezies „Carcinus maenas virus 1“ (CmV1)[4]
  • Spezies „Dikerogammarus haemobaphes virus 1“ (DhV1),[5] alias „Dikerogammarus haemobaphes bi-facies-like virus“ (DhbflV)
  • Spezies „Panulirus argus virus 1“ (PaV1),[6] veraltet „Herpes-like virus“ (HLV)

Anmerkungen

  1. a b Das Material wurde von dieser Quelle kopiert, die unter einer Creative Commons Attribution 4.0 International License verfügbar ist.

Einzelnachweise

  1. a b c d e f g h i Kuttichantran Subramaniam, Donald C. Behringer, Jamie Bojko, Natalya Yutin, Abigail S. Clark, Kelly S. Bateman, Ronny van Aerle, David Bass, Rose C. Kerr, Eugene V. Koonin, Grant D. Stentiford, Thomas B. Waltzek; Vincent R. Racaniello (Hrsg.): A New Family of DNA Viruses Causing Disease in Crustaceans from Diverse Aquatic Biomes. In: mBio. 11, Nr. 1, 14. Januar 2020. doi:10.1128/mBio.02938-19. PMID 31937645. PMC 6960288 (freier Volltext).
  2. a b c d ICTV: ICTV Master Species List 2019.v1, New MSL including all taxa updates since the 2018b release, March 2020 (MSL #35)
  3. Ökologie und Biodiversität des Kulkwitzer Sees, auf: Landessportbund Sachsen
  4. NCBI: Carcinus maenas virus 1 (species)
  5. NCBI: Dikerogammarus haemobaphes virus 1' (species)
  6. NCBI: Panulirus argus virus 1 (species)

Auf dieser Seite verwendete Medien

MBio-2020-Subramaniam-e02938-19.F4 (D-I).large.TMEs.jpg
Autor/Urheber: Kuttichantran Subramaniam, Donald C. Behringer, Jamie Bojko, Natalya Yutin, Abigail S. Clark, Kelly S. Bateman, Ronny van Aerle, David Bass, Rose C. Kerr, Eugene V. Koonin, Grant D. Stentiford, Thomas B. Waltzek, Lizenz: CC BY-SA 4.0
Transmission electron micrographs of the viruses in Panulirus argus (PaV1), Dikerogammarus haemobaphes (DhV1), and Carcinus maenas (CmV1).
(D to F) The micrographs reveal enlarged cell nuclei with developing viroplasms and margination of the host chromatin.
(G to I) The virion morphologies of the three viruses include an electron-dense genomic core surrounded by a (typically icosahedral) nucleocapsid.
MBio-2020-Subramaniam-e02938-19.F1.large.Genomes.jpg
Autor/Urheber: Kuttichantran Subramaniam, Donald C. Behringer, Jamie Bojko, Natalya Yutin, Abigail S. Clark, Kelly S. Bateman, Ronny van Aerle, David Bass, Rose C. Kerr, Eugene V. Koonin, Grant D. Stentiford, Thomas B. Waltzek, Lizenz: CC BY-SA 4.0
Genome maps of the crustacean viruses PaV1 (Panulirus argus virus 1), DhV1 (Dikerogammarus haemobaphes virus 1), and CmV1 (Carcinus maenas virus 1). Predicted orthologous genes are marked with the same colors. nt, nucleotides. Gene abbreviations: DNAp, family B DNA polymerase; MCP, major capsid protein; D5 hel, D5-like primase-helicase; ATP, packaging ATPase; RNApB, DNA-dependent RNA polymerase subunit RPB2; RNApA, DNA-dependent RNA polymerase subunit RPB1; Pox_G9-A16, poxvirus entry-fusion complex G9-A16; divDNAp, divergent family B DNA polymerase; L1R_F9L, lipid membrane protein of large eukaryotic DNA viruses; Erv1, sulfhydryl/thiol oxidoreductase (ERV1/ALR/poxvirus E10 family).
MBio-2020-Subramaniam-e02938-19.F3.large.Tree.jpg
Autor/Urheber: Kuttichantran Subramaniam, Donald C. Behringer, Jamie Bojko, Natalya Yutin, Abigail S. Clark, Kelly S. Bateman, Ronny van Aerle, David Bass, Rose C. Kerr, Eugene V. Koonin, Grant D. Stentiford, Thomas B. Waltzek, Lizenz: CC BY-SA 4.0
Phylogenetic tree of nucleocytoplasmic large DNA viruses (Nucleocytoviricota, NCLDVs). The maximum likelihood (ML) tree depicting the relationship of the viruses PaV1, DhV1, and CmV1 to the rest of the NCLDVs is based on the concatenated amino acid sequence alignments of three core genes (major capsid protein, DNA polymerase, and primase-helicase). The bootstrap values are indicated at each node, and the branch lengths reflect the number of inferred substitutions, as indicated by the bar. Virus abbreviations: PaV1, Panulirus argus virus 1; DhV1, Dikerogammarus haemobaphes virus 1; CmV1, Carcinus maenas virus 1.
MBio-2020-Subramaniam-e02938-19.F5.large.TMEjpg.jpg
Autor/Urheber: Kuttichantran Subramaniam, Donald C. Behringer, Jamie Bojko, Natalya Yutin, Abigail S. Clark, Kelly S. Bateman, Ronny van Aerle, David Bass, Rose C. Kerr, Eugene V. Koonin, Grant D. Stentiford, Thomas B. Waltzek, Lizenz: CC BY-SA 4.0
Transmission electron micrographs of Panulirus argus virus 1 (PaV1) (A and B) and Carcinus maenas virus 1 (CmV1) (C). (A) PaV1-infected hemocyte with the viroplasm observed at the periphery of the enlarged nucleus. The assembling virus particles are present with an electron-dense inner membrane surrounded by the nucleocapsid. (B and C) Higher-magnification images permit the visualization of the inner membrane (yellow arrows).