Methanolobus

Methanolobus
Systematik
Abteilung:Euryarchaeota
ohne Rang:Stenosarchaea-Gruppe
Klasse:Methanomicrobia
Ordnung:Methanosarcinales
Familie:Methanosarcinaceae
Gattung:Methanolobus
Wissenschaftlicher Name
Methanolobus
König & Stetter 1983

Methanolobus ist eine Gattung methanogener Archaeen innerhalb der Familie Methanosarcinaceae.[1][2][3] Die Mitglieder der Gattung sind gramnegativ, strikt anaerob und leben ausschließlich von der Produktion von Methan. Sie verstoffwechseln dazu Verbindungen mit einer Methylgruppe, können also kein Acetat, Formiat oder Kohlendioxid mit Wasserstoff verwenden. Die Zellen haben eine unregelmäßige kokkoide (m. o. w. kugelförmige) Form und einen Durchmesser von etwa 1 μm. Sie bilden keine Endosporen. Einige Vertreter sind vermöge eines einzelnen Geißelchen motil (beweglich). Man findet sie typischerweise in sauerstoffarmen See- und Meeressedimenten.[4][5]

Etymologie

Das Präfix des Gattungsnamens leitet sich ab von neulateinisch methanum ‚Methan‘ bzw. methano, deutsch ‚Methan betreffend‘, englisch pertaining to methane und lat. lobus ‚Lappen‘, ‚Ball‘. Methanolobus meint also einen Methan(-produzierende) Balle oder Lappen (en. methane (-producing) lobe).[2]

Systematik

Die folgende Liste beruht in erster Linie auf den Informationen in der Genome Taxonomy Database (GTDB) – ausgenommen mit ‚¬G‘ („nicht GTDB“) gekennzeichnete Einträge. Informationen aus der List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN) sind mit ‚L‘, solche aus der Taxonomie des National Center for Biotechnology Information (NCBI) mit ‚N‘ gekennzeichnet und ‚C‘ steht für den Catalogue of Life (CoL).[6]

Gattung Methanolobus König & Stetter 1983(L) mit Schreibvariante Konig & Stetter 1983 (N)

  • Spezies Methanolobus bombayensis Kadam et al. 1994 (L,N,C)
  • Spezies Methanolobus chelungpuianus Wu & Lai 2015 (¬G,L,N), inklusive Methanolobus sp. St545Mb (N)
  • Spezies Methanolobus halotolerans (Shen et al. 2020 (¬G,L,N), syn. Methanolobus sp004745425 (G), inkl. Methanolobus sp. SY-01 (N)
  • Spezies Methanolobus oregonensis (Liu et al. 1990)Boone 2002 (¬G,L,N,C),[7][A 1] früher Methanohalophilus oregonensis corrig.Liu et al. 1990, Methanihalophilus oregonense, äquivalent: Methanihalophilus oregonensis
  • Spezies Methanolobus profundi Mochimaru et al. 2009 (L,N), inkl. Methanolobus sp. MobM (N)
  • Spezies Methanolobus psychrophilus Zhang et al. 2008 (L:‚not validly published‘,N)[8][A 2]
  • Spezies Methanolobus psychrotolerans Chen et al. 2018 (L,N), inkl. Methanolobus sp. YSF-03 (N)
  • Spezies Methanolobus taylorii Oremland & Boone 1994 (¬G,L,N,C)
  • Spezies Methanolobus tindarius König & Stetter 1983 (L,C)[9][10][11] mit Schreibvariante Konig & Stetter 1983 (N) - Typus (L)
  • Spezies Methanolobus vulcani Stetter et al. 1989 emend.Kadam & Boone 1995 (L,N)[12][13][14][A 3] bzw. Stetter et al. 1989 (C)
  • Spezies Methanolobus vulcani_A mit Methanolobus vulcani strain B1d (GTDB:abgetrennt in eigene Spezies;N:Stamm)[15]
  • Spezies Methanolobus zinderi Doerfert et al. 2009 (L,N), inkl. Methanolobus sp. SD1 (N), nach (G), inkl. Methanolobus sp. T82-4
  • Spezies Methanolobus sp002501695 syn. Methanolobus sp. UBA474 (N)
  • Spezies Methanolobus sp002507205 syn. Methanolobus sp. UBA32 (N)
  • Spezies Methanolobus sp002508635 syn. Methanolobus sp. UBA118 (N)
  • Spezies Methanolobus sp003565715 mit Methanosarcinaceae archaeon isolate CSSed10_236 (N:Stamm),[16][A 4]
  • Spezies Methanolobus sp016278365 mit Methanolobus sp. isolate Soudan_28 (N:Stamm),[17][A 5]
  • Spezies Methanolobus sp016278385 mit Methanolobus sp. isolate Soudan_27 (N:Stamm),[18][A 5]
  • Spezies Methanolobus sp016932675 mit Methanosarcinaceae archaeon isolate Zod_Metabat.1106 (N:Stamm),[19][A 6]
  • Spezies Methanolobus sp. 17PMc2 (¬G,N)
  • Spezies Methanolobus sp. AME1 (¬G,N)
  • Spezies Methanolobus sp. AME4 (¬G,N)
  • Spezies Methanolobus sp. HigM (¬G,N)
  • Spezies Methanolobus sp. M23 (¬G,N)
  • Spezies Methanolobus sp. enrichment culture clone 02-30 (¬G,N)
  • Spezies Methanolobus sp. enrichment culture clone 02-33 (¬G,N)
  • Spezies Methanolobus sp. enrichment culture clone 02-42 (¬G,N)
  • Spezies Methanolobus sp. enrichment culture clone A3-21 (¬G,N)
  • Spezies Methanolobus sp. enrichment culture clone A3-42 (¬G,N)
  • Spezies Methanolobus sp. enrichment culture clone CIBANICRA-13 (¬G,N)
  • Spezies Methanolobus sp. enrichment culture clone CIBANICRA-14 (¬G,N)

In der LPSN gelistete Vertreter sind, wo nicht anders angegeben, gültig veröffentlicht. Für in der GTDB gelistete Vertreter müssen DNA-Sequenzen ausreichend hoher Qualität vorliegen. In der GTDB geführte Einträge ohne Veröffentlichung stammen daher üblicherweise aus der Metagenomik.

Verschiebungen:

  • Spezies Methanolobus siciliae Stetter & König 1989 ⇒ Methanosarcina siciliae (Stetter & König 1989) Ni et al. 1994 (L,C)

Literatur

Journale

Journal-Datenbanken

Weblinks

Anmerkungen

  1. ↑ Erstmals isoliert aus Sedimenten, die sich drei Meter unter einem alkalischen, salzhaltigen Grundwasserleiter (Aquifer) im US-Bundesstaat Oregon befanden (MicrobeWiki).
  2. ↑ Fundort: Zoigê-Feuchtgebiet im Hochland von Tibet, Provinz Sichuan (China). psychrophil (Kühle liebend, 15–30 °C).
  3. ↑ Erstmals isoliert von einer Unterwasserfumarole bei Porto di Levante (MapCarta) auf der Insel Vulcano (Italien). Näheres siehe: Methanolobus vulcani DSM 3029 (Type strain), DSMZ.
  4. ↑ Metagenom; Entnahmeort und -zeit: Russland, Kulundasteppe, Juli 2010, hypersalines Natronsee-Sediment, Höhe: 140 m.
  5. ↑ a b Metagenom; Entnahmeort und -zeit: USA: Soudan Iron Mine (Minnesota), 10. November 2014, Sole aus der Minenentwässerung.
  6. ↑ Metagenom; Ausläufer der Anadarko Mountains, Zodletone Spring (Oklahoma), September 2017, (anoxisches) Süßwasser. Zur Quelle siehe: A Microbial observatory at Zodletone Spring.

Einzelnachweise

  1. ↑ GTDB: Methanolobus (genus).
  2. ↑ a b LPSN: Methanolobus König and Stetter 1983 (Genus)
  3. ↑ NCBI Taxonomy Browser: Methanolobus, Detail: Methanolobus Konig and Stetter 1983 (genus); graphisch: Methanolobus, Lifemap NCBI Version. Datenquelle NCBI taxonomy resources. NCBI..
  4. ↑ John G. Holt (Hrsg.): Bergey's Manual of Determinative bacteriology. Lippincott Williams and Wilkins, 1994, ISBN 0-683-00603-7, S. 724 (Abgerufen am 8. August 2016).
  5. ↑ Stanley Falkow, Eugene Rosenberg, Karl-Heinz Schleifer, Erko Stackebrandt (Hrsg.): The Prokaryotes, Band 3. Springer Science and Business Media, 10. Oktober 2016, ISBN 978-0-387-25493-7, S. 252 (Abgerufen am 8. August 2016).
  6. ↑ CoL: Search: Methanolobus, auf: Species2000.
  7. ↑ Andrea Shilling, Ashley Rider: Methanolobus oregonensis. Auf: MicrobeWiki, Kenyon College, Department of Biology. Mit Foto und ausführlicher Beschreibung.
  8. ↑ Guishan Zhang, Na Jiang, Xiaoli Liu, Xiuzhu Dong: Methanogenesis from Methanol at Low Temperatures by a Novel Psychrophilic Methanogen, “Methanolobus psychrophilus” sp. nov., Prevalent in Zoige Wetland of the Tibetan Plateau. In: ASM Journals: Applied and Environmental Microbiology, Band 74, Nr. 19, 1. August 2008; doi:10.1128/AEM.01146-08.
  9. ↑ Helmut König, Karl Otto Stetter: Isolation and characterization of Methanolobus tindarius, sp. nov., a coccoid methanogen growing only on methanol and methylamines. In: Zentralblatt für Bakteriologie Mikrobiologie und Hygiene: I. Abt. Originale C: Allgemeine, angewandte und ökologische Mikrobiologie; Band 3, Nr. 4, November 1982, S. 478-490: doi:10.1016/S0721-9571(82)80005-7.
  10. ↑ Helmut König, Elisabeth Nusser, Karl O. Stetter: Glycogen in Methanolobus and Methanococcus. In: FEMS Microbiology Letters, Band 28, Nr. 3, 1. Juli 1985, S. 265–269; doi:10.1111/j.1574-6968.1985.tb00803.x.
  11. ↑ Peter Willekens, Karl O.Stetter, Antoon Vandenberghe, Erik Huysmans, Rupert De Wachter: The structure of 5 S ribosomal RNA in the methanogenic archaebacteria Methanolobus tindarius and Methanococcus thermolithotrophicus. In: FEBS Letters, Band 204, Nr. 2, 18. August 1986, S. 273-278; doi:10.1016/0014-5793(86)80827-4.
  12. ↑ Priya C. Kadam, David R. Boone: Physiological Characterization and Emended Description of Methanolobus vulcani. Physiological Characterization and Emended Description of Methanolobus vulcani. In: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Band 45, Nr. 2, 1. April 1995, S. 400–402; doi:10.1099/00207713-45-2-400.
  13. ↑ Alexander Smelcer: Methanolobus vulcani. Auf: MicrobeWiki, Kenyon College, Department of Biology. Mit Foto und ausführlicher Beschreibung.
  14. ↑ T. Wilharm, Michael Thomm, Karl O. Stetter: Genetic analysis of plasmid pMP1 from Methanolobus vulcani (Kurzfassung). In: Archaebacteria '85. Proceedings of the EMBO Workshop on Molecular Genetics of Archaebacteria and the International Workshop on Biology and Biochemistry of Archaebacteria, München, Juni 1985 (Hrsg.: O. Kandler, W. Zillig), S. 401, Gustav Fischer Verlag, Stuttgart, New York (1986).
  15. ↑ NCBI Nucleotide: Methanolobus vulcani B1d
  16. ↑ NCBI Nucleotide: MAG: Methanosarcinaceae archaeon isolate CSSed10_236, ….
  17. ↑ NCBI Nucleotide: MAG: Methanolobus sp. isolate Soudan_28, ….
  18. ↑ NCBI Nucleotide: MAG: Methanolobus sp. isolate Soudan_27, ….
  19. ↑ NCBI Nucleotide: MAG: Methanosarcinaceae archaeon isolate Zod_Metabat.1106, ….