Iridovirus
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 Parakristalline Anordnung von Iridovirus. Balkenlänge 200 µm. | ||||||||||||||||||
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Iridovirus ist eine Gattung von Riesenviren (Nucleocytoviricota, NCLDVs) aus der Familie der Iridoviridae, Unterfamilie Betairidovirinae.[2] Die natürlichen Wirte von Iridovirus sind Insekten.
Mit Stand Februar 2019 gibt es nur zwei vom International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) bestätigte Arten (Spezies) in dieser Gattung. Dies ist die ehemalige Typusart Iridovirus chilo1 mit Invertebrate iridescent virus 6 (IIV-6). Bei Stechfliegen verursacht IIV-6 gewöhnlich eine verdeckte (inapparente) Infektion, die die Fitness beeinträchtigt.[2][3] Dazu kommt die Art Iridovirus armadillidium1 mit Invertebrate iridescent virus 31 (IIV-31).[4][5]
Aufbau
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Die Viruspartikel (Virionen) der Gattung Iridovirus sind umhüllt und haben ikosaedrische und polyedrische Geometrie (T=147-Symmetrie). Der Durchmesser liegt bei 185 nm.
Genom
Das Genom ist unsegmentiert und linear mit einer Länge von ungefähr 213 kb. Es kodiert 211 Proteine.[2][3]
Bei Invertebrate iridescent virus 6 (IIV-6) beträgt die genaue Genomlänge 212.482 bp, es werden vorhergesagt 468 Proteine kodiert, und der GC-Gehalt beträgt 29 %.[6]
Vermehrungszyklus
Die Replikation der Viren ist nukleozytoplasmatisch (Zugehörigkeit zur Gruppe der NCLDV). Der Eintritt in die Wirtszelle geschieht durch Anlagerung der viralen Proteine an Rezeptoren auf der Oberfläche der Wirtszelle, wodurch eine Endozytose bewirkt wird. Die Replikation folgt dem DNA-Strang-Verdrängungsmodell (englisch DNA strand displacement model). Die Methode der Transkription ist DNA-gestützt. Der Austritt aus der Wirtszelle erfolgt durch Lyse[3]
Systematik
Die Systematik der Gattung Iridovirus ist mit Stand Mai 2024 nach ICTV wie folgt:[4][5]
Familie Iridoviridae
- Unterfamilie Betairidovirinae
- Gattung Iridovirus
- Spezies Iridovirus armadillidium1 mit
- Invertebrate iridescent virus 31 (IIV31, IIV-31) inklusive
- Armadillidium vulgare iridescent virus
- Popillia japonica iridescent virus
- Porcellio scaber iridescent virus
- Invertebrate iridescent virus 31 (IIV31, IIV-31) inklusive
- Spezies Iridovirus armadillidium1 mit
- Spezies Iridovirus chilo1 (ehem. Typusart) mit
- Invertebrate iridescent virus 6 (IIV-6, IIV6) inklusive Gryllus bimaculatus iridovirus (GbIV)
- Chilo iridescent virus (CIV)
- Spezies Iridovirus chilo1 (ehem. Typusart) mit
- Dazu kommen nach ICTV folgende noch nicht klassifizierten Mitglieder:[2]
- Spezies „Invertebrate iridescent virus 2“ (IIV-2)
- Spezies „Invertebrate iridescent virus 16“ (IIV-16)
- Spezies „Invertebrate iridescent virus 23“ (IIV-23)
- Spezies „Invertebrate iridescent virus 24“ (IIV-24)
- Spezies „Invertebrate iridescent virus 29“ (IIV-29)
- Spezies „Armadillidium decorum iridescent virus“[7]
Nach ICTV möglicherweise zu Chloriridovirus, nach NCBI eher hier zu Iridovirus gruppiert wird der Kandidat:
- Spezies „Invertebrate iridescent virus 1“ (IIV-1)[8]
- Tipula iridescent virus
- Spezies „Invertebrate iridescent virus 1“ (IIV-1)[8]
Einzelnachweise
- ↑ a b c d e ICTV: ICTV Taxonomy history: Frog virus 3, EC 51, Berlin, Germany, July 2019; Email ratification March 2020 (MSL #35)
- ↑ a b c d ICTV: Iridoviridae. In: ICTV Online (10th) Report. (englisch).
- ↑ a b c ViralZone: Iridovirus. ExPASy, abgerufen am 21. Juli 2019 (englisch).
- ↑ a b ICTV: Taxonomy Browser.
- ↑ a b ICTV: Virus Metadata Resource (VMR).
- ↑ David M. Needham, Alexandra Z. Worden et al.: A distinct lineage of giant viruses brings a rhodopsin photosystem to unicellular marine predators, in: PNAS, 23. September 2019, doi:10.1073/pnas.1907517116, ISSN 0027-8424, hier: Supplement 1 (xlsx)
- ↑ NCBI: Armadillidium decorum iridescent virus (species)
- ↑ ICTV: ICTV Taxonomy history: Invertebrate iridescent virus 1 (ZIP)
Weblinks
Auf dieser Seite verwendete Medien
Autor/Urheber: ViralZone, SIB Swiss Institute of Bioinformatics, Philippe Le Mercier et al., Lizenz: CC BY 4.0
Schemazeichnung eines Virions der Unterfamilie Alphairidovirinae, Familie Iridoviridae, Querschnitt ohne und mit Hülle, sowie Seitenansicht
Autor/Urheber: ICTV: Jancovich, J.K., Chinchar, V.G., Hyatt, A., Miyazaki, T., Williams, T., Zhang, Q.Y. — Original authors: Yan et al., Lizenz: CC BY-SA 4.0
Three-dimensional reconstruction of an Invertebrate iridescent virus 6 (IIV-6, genus Iridovirus) particle at a resolution of 1.3 nm. (A) 3-D density map of particle viewed along an icosahedral two-fold axis. The external fringe of filaments has been blurred away due to their varying position in relation to the symmetry of the capsid. (B) Central cross-section, one pixel thick. A lipid bilayer follows the inner contour and icosahedral symmetry of the capsid shell whereas the core appears to lack any structures that are arranged following icosahedral symmetry. (C) Magnified view of the central region outlined in (A). The diagonal white line indicates the cleavage plane between adjacent trisymmetrons. (D) Magnified view of the propeller-like pentamer complex at the five-fold vertex. This complex differs from the trimeric capsomers in that it is larger, has a small axial hole, and lacks an external fibre. (E) Magnified view of boxed region in (B) showing transverse section of the pentamer complex and adjacent trisymmetrons. (F) Same as (E) but with the pentamer complex, three capsomers, and their fibres individually outlined. (G) Transmembrane anchor proteins beneath the pentasymmetrons showing two sticklike entities. The longer of the two (long arrow) crosses both leaflets of the bilayer, whereas the other (short arrow) stops at the outer leaflet of the internal lipid membrane. (From Yan et al. (2009). J. Mol. Biol., 385, 1287–1299; with permission.)
Transmission electron micrographs of iridovirus cultured from the liver of a naturally diseased common frog (Rana temporaria) by using a fathead minnow epithelial cell line. 4a. Virus-infected cell. Large isocahedral viruses are conspicuous within the cytoplasm (arrows). Bar = 2 µm. 4b. Paracrystalline array of iridovirus. Bar = 200 µm.
Autor/Urheber: V. Gregory Chinchar, Paul Hick, Ikbal Agah Ince, James K Jancovich, Rachel Marschang, Qiwei Qin, Kuttichantran Subramaniam, Thomas B Waltzek, Richard Whittington, Trevor Williams and Qi-Ya Zhang. Original by Wrigley, Lizenz: CC BY-SA 4.0
Iridoviridae. Outer shell of Invertebrate iridescent virus 2 (IIV2). Shown are trisymmetrons (orange) comprising the 20 icosahedral faces and pentrasymmetrons (red) located at the 12 vertices, and disymmetrons (blue) located at the edges of the icosahedral faces (Adapted from (Wrigley 1969) with permission).
Autor/Urheber: V. Gregory Chinchar, Paul Hick, Ikbal Agah Ince, James K Jancovich, Rachel Marschang, Qiwei Qin, Kuttichantran Subramaniam, Thomas B Waltzek, Richard Whittington, Trevor Williams and Qi-Ya Zhang. Original by I. A. Ince, J. van Lent, Lizenz: CC BY-SA 4.0
Iridoviridae. Cryo-transmission electron micrograph of IIV6 displaying a fringe of hair-like fibers surrounding the viral particle (figure provided by IA Ince and J van Lent).
Autor/Urheber: ICTV: Jancovich, J.K., Chinchar, V.G., Hyatt, A., Miyazaki, T., Williams, T., Zhang, Q.Y. (caption moved down, resized), Lizenz: CC BY-SA 4.0
Schematic planar diagram of the Invertebrate iridescent virus 6 (IIV-6, genus Iridovirus) capsid structure with the central pentamer complex (white pentagon) omitted for clarity. The centrally located white ellipse, triangle and pentagon symbols highlight the positions of 2-, 3-, and 5-fold icosahedral axes, respectively. All major capsid protein trimers are shown as three small grey disks enclosed by a hexagon. The icosahedral asymmetric unit contains 24 and one-third of these capsomers (numbered 1–25). Each trisymmetron contains 55 capsomers, all oriented similarly and rotated by 60° relative to those in the adjacent trisymmetron. Finger proteins bind to each trisymmetron (nine within one asymmetric unit are numbered in white), a total of 27 in each trisymmetron. A total of 18 Zip dimers are present at the interface between one trisymmetron and its adjacent trisymmetrons. Zip monomers are located at the interface between a trisymmetron and its neighbouring pentasymmetrons. The transmembrane anchor proteins (shown in Figure 2G) are located under capsomers 2 and 3 beneath the pentasymmetron. (From Yan et al. (2009). J. Mol. Biol., 385, 1287–1299; with permission.