Globuloviridae

Globuloviridae

Alphaglobulovirus-Virion (Schemazeichnung)

Systematik
Klassifikation:Viren
Realm:nicht klassifiziert[1]
Reich:nicht klassifiziert[1]
Phylum:nicht klassifiziert[1]
Klasse:nicht klassifiziert[1]
Ordnung:nicht klassifiziert[1]
Familie:Globuloviridae[1]
Gattung:Globulovirus
Taxonomische Merkmale
Genom:dsDNA linear
Baltimore:Gruppe 1
Symmetrie:sphärisch
Hülle:behüllt?
Wissenschaftlicher Name
Globuloviridae
Links
ICTV Taxon History:201903634 (Familie),
201903636 (Gattung)
NCBI Taxonomy:573053 (Familie),
564645 (Gattung)
ViralZone (Expasy, SIB):535 (Familie),
536 (Gattung)
Negativkontrast-EM-Aufnahmen von Virionen des Pyrobaculum spherical virus (PSV, Gattung Alphaglobulovirus). Links: Intakte Virionen mit kugelförmigen Ausstülpungen (Pfeile). Rechts: Teilweise beschädigte Virionen, einen ungeordneten Nukleoproteinkern ausstoßend. Balken 100 nm dar. ICTV, modifiziert nach Häring et al.

Globuloviridae ist die Bezeichnung für eine Familie hyperthermophiler Viren. Als natürliche Wirte dienen Archaeen Gattungen Pyrobaculum und Thermoproteus (beide Crenarchaeota).[2][3] Zu den früher schon anerkannten Mitgliedern Alpha­globulo­virus pozzuoliense (syn. Alpha­globulo­virus PSV, mit Pyrobaculum spherical virus, PSV) und Alphaglobulovirus cinderense (syn. Alphaglobulovirus TTSV1, mit Thermo­proteus tenax spherical virus 1, TTSV-1) sind inzwischen noch zwei weitere hin­zu­ge­kom­men, Alphaglobulovirus obsidianense (syn. Alphaglobulovirus PSV2, mit Pyrobaculum spherical virus 2, PSV-2)[4] und Alpha­globulo­virus sileriense (syn. Alphaglobulovirus TSPV1, mit Thermoproteus spherical piliferous virus 1, TSPV1).[5]

Aufbau

Die Virionen der Globuloviridae sind kugelförmig (sphärisch) und (vermutlich) umhüllt. Der Durchmesser beträgt etwa 100 nm.[2][3]

Genomorganisation von PSV mit Darstellung von Lage, Größe und Richtung der mutmaßlichen Gene

Das Genom der Globuloviridae ist ein einzelnes, lineares Doppelstrang-DNA-Molekül (unsegmentiert, d. h. monopartit). Es hat eine Länge von etwa 20–30 kbp (Kilobasenpaare).[2][3]

Reproduktionszyklus

Globuloviren reproduzieren im Zytoplasma der Wirtszellen. Die Transkription erfolgt anhand der genomischen DNA als Vorlage. Als natürliche Wirte dienen Archaeen der Gattungen Pyrobaculum und Thermoproteus (beide Thermoproteaceae, Crenarchaeota). Die Übertragung geschieht durch passive Diffusion.[2][3]

Systematik

Die Systematik der Globuloviridae ist nach ICTV (ergänzt durch Vorschläge in doppelten Anführungszeichen nach NCBI) mit Stand Mai 2024 wie folgt:[6][7][2]

Gruppe: dsDNA

  • Ordnung: nicht klassifiziert
    • Familie Globuloviridae
      • Gattung Alphaglobulovirus (früher Globulovirus)
        • Spezies Alphaglobulovirus cinderense (früher Alphaglobulovirus TTSV1) mit Thermoproteus tenax spherical virus 1 (TTSV1)
        • Spezies Alphaglobulovirus obsidianense (früher Alphaglobulovirus PSV) mit Pyrobaculum spherical virus (PSV[-1])
        • Spezies Alphaglobulovirus pozzuoliense (früher Alphaglobulovirus PSV2) mit Pyrobaculum spherical virus 2 (PSV-2)
        • Spezies Alphaglobulovirus sileriense (früher Alphaglobulovirus TSPV1) mit Thermoproteus spherical piliferous virus 1 (TSPV1)

Literatur

  • Monika Häring, Xu Peng, Kim Brügger, Reinhard Rachel, Karl O. Stetter, Roger A Garrett, David Prangishvili: Morphology and genome organization of the virus PSV of the hyperthermophilic archaeal genera Pyrobaculum and Thermoproteus: a novel virus family, the Globuloviridae. In: Virology. 323. Jahrgang, Nr. 2, 2004, S. 233–242, doi:10.1016/j.virol.2004.03.002, PMID 15193919 (englisch).

Einzelnachweise

  1. ↑ a b c d e f ICTV: ICTV Master Species List 2019.v1, New MSL including all taxa updates since the 2018b release, March 2020 (MSL #35)
  2. ↑ a b c d e D Prangishvili, M Krupovic, ICTV Report Consortium: ICTV Virus Taxonomy Profile: Globuloviridae. In: The Journal of General Virology. 99. Jahrgang, Nr. 10, 2018, S. 1357–1358, doi:10.1099/jgv.0.001123, PMID 30091697 (englisch).
  3. ↑ a b c d Viral Zone. ExPASy, abgerufen am 23. Februar 2021 (englisch).
  4. ↑ DP Baquero, P Contursi, M Piochi, S Bartolucci, Y Liu, V Cvirkaite-Krupovic, D Prangishvili, M Krupovic: New virus isolates from Italian hydrothermal environments underscore the biogeographic pattern in archaeal virus communities. In: The ISME Journal. 2020, doi:10.1038/s41396-020-0653-z, PMID 32322010 (englisch).
  5. ↑ R Hartman, L Biewenga, J Munson-McGee, M Refai, ES Boyd, B Bothner, CM Lawrence, M Young: Discovery and Characterization of TSPV1: A Spherical Archaeal Virus Decorated with Unusual Filaments. In: Journal of Virology. 94. Jahrgang, Nr. 11, 2020, doi:10.1128/JVI.00036-20, PMID 32213609 (englisch).
  6. ↑ ICTV: Taxonomy Browser.
  7. ↑ ICTV: Virus Metadata Resource (VMR).

Auf dieser Seite verwendete Medien

ODD.Globulo.Fig1.v2.png
Autor/Urheber: Häring et al., 2004; provided by Andrew M. Kropinski, Stuart G. Siddell, Lizenz: CC BY-SA 4.0
Globuloviridae. Negative-contrast electron micrographs of virions of Pyrobaculum spherical virus (PSV). (Left) Intact virions; arrows indicate spherical protrusions. (Right) Partially disrupted virions extruding disordered nucleoprotein core. The bars represent 100 nm. Modified from (Häring et al., 2004).
ODD.Globulo.Fig2.v1.png-1280x960.png
Autor/Urheber: Krupovic et al., provided by Andrew M. Kropinski, Stuart G. Siddell, Lizenz: CC BY-SA 4.0
Genome organization of Pyrobaculum spherical virus (PSV) showing location, sizes and direction of putative genes. Genes encoding the three major structural proteins, VP1-3, are shown in black. Paralogous genes are indicated with the same colors. The available protein X-ray structures are shown beneath the genome map and are shaded with distinct colours that follow the shading of their corresponding genes. The winged helix-turn-helix (wHTH) domain of ORF165a is circled (modified from Krupovic et al., 2012).
Alphaglobulovirus image.svg
Autor/Urheber: ViralZone, SIB Swiss Institute of Bioinformatics, Philippe Le Mercier et al., Lizenz: CC BY 4.0
Schemazeichnung eines Virions der Gattung Alphagglobulovirus (früher Globulovirus), Fam. Globuloviridae, Querschnitt