Finnlakeviridae

Finnlakeviridae

TEM-Aufnahme von Virionen der Spezies Flavobacterium phage FLiP. Balken 100 nm.[2]

Systematik
Klassifikation:Viren
Realm:nicht klassifiziert[1]
Reich:nicht klassifiziert[1]
Phylum:nicht klassifiziert[1]
Klasse:nicht klassifiziert[1]
Ordnung:nicht klassifiziert[1]
Familie:Finnlakeviridae[1]
Gattung:Finnlakevirus
Taxonomische Merkmale
Genom:ssDNA zirkulär
Baltimore:Gruppe 2
Symmetrie:ikosaedrisch
Hülle:behüllt?
Wissenschaftlicher Name
Finnlakeviridae
Links
NCBI Taxonomy:2732901 (Familie),
2733303 (Gattung)
ICTV Taxon History:201907846 (Familie),
201907847 (Gattung)
Kryo-EM-Rekonstruktion eines Virions von Flavobacterium phage FLiP.[2]
Finnlakeviridae-Partikel im Querschnitt (Schema)

Finnlakeviridae ist die Bezeichnung für eine Familie von Viren, die noch keinem höheren taxonomischen Rang zugeordnet ist. Die Familie enthält eine einzige Gattung, Finnlakevirus, und die eine einzige Spezies (Art), Flavobacterium virus FLiP. Die natürlichen Wirte sind gramnegative Bakterien, daher werden die Finnlakeviridae nicht-taxonomisch als Bakteriophage klassifiziert.[2][3]

Der Phage FLiP wurde 2010 mit seinem Wirtsbakterium aus einem borealen Süßwasserhabitat in Mittelfinnland isoliert. Phage FLiP ist das erste beschriebene einzelsträngige DNA-Virus mit einer internen Membran. Das Kapsid ist ikosaedrisch mit der Triangulationszahl pseudo T = 21 dextro. Das Hauptkapsidprotein (englisch major capsid protein, MCP) ähnelt dabei dem von Pseudoalteromonas phage PM2 (Spezies Pseudoalteromonas virus PM2, Gattung Corticovirus).[4][3]

Genom

Genomekarte von Flavobacterium phage FLiP.[2]

Das Genom von Phage FLiP ist unsegmentiert (monopartit) und besteht aus einem zirkulären Einzelstrang-DNA-Molekül (ssDNA) mit einer Länge von etwa 9,2 kb (Kilobasen).[3]

Einzelnachweise

  1. ↑ a b c d e f ICTV: ICTV Master Species List 2019.v1, New MSL including all taxa updates since the 2018b release, March 2020 (MSL #35)
  2. ↑ a b c d S. Mäntynen, E. Laanto, L. R. Sundberg, M. M. Poranen, H. M. Oksanen: ICTV Report Consortium: ICTV Virus Taxonomy Profile: Finnlakeviridae, in: The Journal of General Virology, Band 101, Nr. 9, September 2020, S. 894–895, doi:10.1099/jgv.0.001488, PMID 32840474, ICTV.
  3. ↑ a b c ICTV Report Finnlakeviridae.
  4. ↑ NCBI: Pseudoalteromonas virus PM2 (species)

Weblinks

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Viruses.11.-2019-76-Tbl-1-Finnlakeviridae.png
Autor/Urheber: Sari Mäntynen, Lotta-Riina Sundberg, Hanna M. Oksanen, Minna M. Poranen, Lizenz: CC BY-SA 4.0
Schematic Representation of of membrane-containing bacteriophages (left to right): Finnlakeviridae
OSD.Finnlake.Fig2.v3-FLiP-Genome.png
Autor/Urheber: Sari Mäntynen, Elina Laanto, Lotta-Riina Sundberg, Minna M. Poranen, Hanna M. Oksanen, Lizenz: CC BY-SA 4.0
Finnlakeviridae. Genome organization of Flavobacterium phage FLiP. Nucleotide numbering starts from a unique EcoRII restriction site. Sixteen predicted coding sequences are marked with arrows indicating the direction of transcription. CDS encoding structural proteins are indicated by light blue colour and labelled with the protein they encode.
OSD.Finnlake.Fig1 v2 WEB-Finnlakeviridae (B).png
Autor/Urheber: Sari Mäntynen, Elina Laanto, Lotta-Riina Sundberg, Minna M. Poranen, Hanna M. Oksanen, Lizenz: CC BY-SA 4.0
Finnlakeviridae. Flavobacterium phage FLiP virions negatively-stained with 2% phosphotungstic acid (pH 8.5) and visualized under transmission electron microscopy. Scale bar represents 100 nm.
OSD.Finnlake.Fig1.v2 WEB-Finnlakeviridae (A).png
Autor/Urheber: Sari Mäntynen, Elina Laanto, Lotta-Riina Sundberg, Minna M. Poranen, Hanna M. Oksanen, Lizenz: CC BY-SA 4.0
Finnlakeviridae. Cryo-electron microscopic reconstruction of the Flavobacterium phage FLiP virion (Laanto et al., 2017).