Fiersviridae

Fiersviridae
Ms2capsid surface.png

Kapsid des Bakteriophagen MS2

Systematik
Klassifikation:Viren
Realm:Riboviria[3]
Reich:Orthornavirae[2]
Phylum:Lenarviricota[2]
Klasse:Leviviricetes[1]
Ordnung:Norzivirales[1]
Familie:Fiersviridae
Taxonomische Merkmale
Genom:(+)ssRNA linear
Baltimore:Gruppe 4
Symmetrie:ikosaedrisch
Wissenschaftlicher Name
Fiersviridae
Links
NCBI Taxonomy:11989
ViralZone (Expasy, SIB):163
ICTV Taxon History:201903751

Die Fiersviridae (veraltet: Leviviridae) sind eine Familie von Viren, die als Bakteriophagen verschiedene Bakterien, einschließlich Enterobakterien, Caulobacter, Pseudomonas und Acinetobacter befallen. Die Taxonomie des International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) mit Stand November 2018 kennt zwei Gattungen zu je zwei Spezis.[4][5]

Es handelt sich um kleine RNA-Viren mit linearem, einzelsträngigem RNA-Genom positiver Polarität, die nur vier Proteine kodieren. Alle Phagen dieser Familie benötigen bakterielle Pili, um sich an die Wirtszelle (Bakterienzelle) zu binden und diese zu infizieren.[6]

Im März 2021 wurde vorgeschlagen, diese Viren aus der bisherigen Klasse Allassoviricetes in eine neue Klasse Leviviricetes zu verschieben.[7] Dem hat das ICTV in der Ausgabe 36 seiner Master Species List (MSL) 2021 entsprochen, und dabei gleichzeitig die Ordnung (von Levivirales zu Norzivirales) und die Familie (von Leviviridae zu Fersviridae) umbenannt. Gleichzeitig hat sich die Anzahl der Gattungen von zwei auf 185 erhöht.[1]

Systematik

Äußere Systematik

Die Familie ist Mitglied der Ordnung Norzivirales (früher Levivirales). Die meisten Vertreter dieser Ordnung wurden per Metagenomik gefunden.[8] Zu dieser gehören die folgenden Familien:[1]

  • Familie Atkinsviridae
  • Familie Duinviridae
  • Familie Fiersviridae (veraltet Leviviridae)
  • Familie Solspiviridae

Innere Systematik

Die Familie hat mit ICTV Stand Juni 2021 einhundertfünfundachzig (185) Gattungen (Genera). Diese sind – mit einer Auswahl an Arten (Spezies):[1]

  • Familie Fiersviridae (veraltet Leviviridae)
  1. Genus Adahivirus
  2. Genus Aldhiuvirus
  3. Genus Amubhivirus
  4. Genus Andhasavirus
  5. Genus Andhaxevirus
  6. Genus Anedhivirus
  7. Genus Apukhovirus
  8. Genus Ashucavirus
  9. Genus Bahscuvirus
  10. Genus Bathrivirus
  11. Genus Behevivirus
  12. Genus Behlfluvirus
  13. Genus Bertavirus
  14. Genus Bihdovirus
  15. Genus Bisdanovirus
  16. Genus Blafavirus
  17. Genus Bohnovirus
  18. Genus Bohwovirus
  19. Genus Boloprevirus
  20. Genus Boschuvirus
  21. Genus Breudwovirus
  22. Genus Brudgevirus
  23. Genus Buhdavirus
  24. Genus Cahdavirus
  25. Genus Cahrpivirus
  26. Genus Caloevirus
  27. Genus Cauhldivirus
  28. Genus Cehakivirus
  29. Genus Chaedoavirus
  30. Genus Chahsmivirus
  31. Genus Chihyovirus
  32. Genus Chobevirus
  33. Genus Choctavirus
  34. Genus Cintrevirus
  35. Genus Condavirus
  36. Genus Creshivirus
  37. Genus Cunavirus
  38. Genus Dahmuvirus
  39. Genus Darnbovirus
  40. Genus Decadevirus
  41. Genus Dehcevirus
  42. Genus Denfovirus
  43. Genus Depandovirus
  44. Genus Dihsdivirus
  45. Genus Dohlivirus
  46. Genus Dosmizivirus
  47. Genus Duhcivirus
  48. Genus Emesvirus (früher Levivirus)[9]
    • Spezies Emesvirus japonicum (veraltet: Escherichia virus BZ13)
    • Spezies Emesvirus zinderi (veraltet Escherichia virus MS2, Enterobakteriophage MS2, Coliphage MS2)
    • Spezies Emesvirus piscicola
  49. Genus Empivirus
  50. Genus Fagihyuvirus
  51. Genus Febihevirus
  52. Genus Fiyodovirus
  53. Genus Gahlinevirus
  54. Genus Gahlovirus
  55. Genus Garovuvirus
  56. Genus Gehnevirus
  57. Genus Glincaevirus
  58. Genus Glyciruvirus
  59. Genus Gmuhndevirus
  60. Genus Gorodievirus
  61. Genus Grendvuvirus
  62. Genus Gunawavirus
  63. Genus Hagavirus
  64. Genus Hahdsevirus
  65. Genus Halcalevirus
  66. Genus Hihdivirus
  67. Genus Hukohnovirus
  68. Genus Icumivirus
  69. Genus Ideskevirus
  70. Genus Imeberivirus
  71. Genus Ineyimevirus
  72. Genus Iruqauvirus
  73. Genus Ishugivirus
  74. Genus Jiesduavirus
  75. Genus Johnovirus
  76. Genus Jupbevirus
  77. Genus Kahfsdivirus
  78. Genus Keghovirus
  79. Genus Kehmevirus
  80. Genus Kemicevirus
  81. Genus Kenamavirus
  82. Genus Kihryuvirus
  83. Genus Kirnavirus
  84. Genus Kiwsmaevirus
  85. Genus Konkivirus
  86. Genus Kowinovirus
  87. Genus Kuhshuvirus
  88. Genus Lohmavirus
  89. Genus Loslovirus
  90. Genus Lulohlevirus
  91. Genus Luthavirus
  92. Genus Mahqeavirus
  93. Genus Mahraivirus
  94. Genus Manohtivirus
  95. Genus Manrohovirus
  96. Genus Martavirus
  97. Genus Meblowovirus
  98. Genus Mehraxmevirus
  99. Genus Mekintivirus
  100. Genus Methovirus
  101. Genus Mihkrovirus
  102. Genus Mintuvirus
  103. Genus Monamovirus
  104. Genus Mucrahivirus
  105. Genus Muyegivirus
  106. Genus Nadsecevirus
  107. Genus Nahjiuvirus
  108. Genus Nahrudavirus
  109. Genus Nahsuvirus
  110. Genus Niankuvirus
  111. Genus Nihucivirus
  112. Genus Niuhvovirus
  113. Genus Noehsivirus
  114. Genus Nuihimevirus
  115. Genus Oceshuvirus
  116. Genus Olmsdivirus
  117. Genus Omohevirus
  118. Genus Onohmuvirus
  119. Genus Opdykovirus
  120. Genus Osigowavirus
  121. Genus Owenocuvirus
  122. Genus Oxychlovirus
  123. Genus Palsdevirus
  124. Genus Paysduvirus
  125. Genus Pehohrivirus
  126. Genus Pehsaduvirus
  127. Genus Pepevirus
  128. Genus Perrunavirus
  129. Genus Philtcovirus
  130. Genus Phobpsivirus
  131. Genus Phulivirus
  132. Genus Piponevirus
  133. Genus Pipunevirus
  134. Genus Pohlevirus
  135. Genus Pohtamavirus
  136. Genus Poncivirus
  137. Genus Psehatovirus
  138. Genus Psimevirus
  139. Genus Pudlivirus
  140. Genus Qubevirus (früher Allolevivirus)[10]
    • Spezies Qubevirus durum (veraltet Escherichia virus Qbeta, Enterobakteriophage Qbeta, Coliphage Qβ)
    • Spezies Qubevirus faecium (veraltet Escherichia virus FI)
  141. Genus Radbaivirus
  142. Genus Rehihmevirus
  143. Genus Rehudzovirus
  144. Genus Rusvolovirus
  145. Genus Scuadavirus
  146. Genus Sehcovirus
  147. Genus Sehpovirus
  148. Genus Seybrovirus
  149. Genus Shebanavirus
  150. Genus Shihovirus
  151. Genus Sholavirus
  152. Genus Shomudavirus
  153. Genus Shuravirus
  154. Genus Sincthavirus
  155. Genus Skhembuvirus
  156. Genus Smudhfivirus
  157. Genus Soetuvirus
  158. Genus Sphonivirus
  159. Genus Stehlmavirus
  160. Genus Swihdzovirus
  161. Genus Tahluvirus
  162. Genus Tapikevirus
  163. Genus Teciucevirus
  164. Genus Tehdravirus
  165. Genus Tehnexuvirus
  166. Genus Thidevirus
  167. Genus Thiwvovirus
  168. Genus Thiyevirus
  169. Genus Thobivirus
  170. Genus Ticahravirus
  171. Genus Tohvovirus
  172. Genus Trucevirus
  173. Genus Ureyisuvirus
  174. Genus Ushumevirus
  175. Genus Vinehtivirus
  176. Genus Vohsuavirus
  177. Genus Wahtavirus
  178. Genus Whietlevirus
  179. Genus Whilavirus
  180. Genus Wohudhevirus
  181. Genus Wyahnevirus
  182. Genus Yahnavirus
  183. Genus Yemegivirus
  184. Genus Yohcadevirus
  185. Genus Yuhrihovirus

Aufbau

Schemazeichnung eines Virusteilchens der Leviviridae (Querschnitt) und Genom von
(a) Enterobacteriaphage MS2 (Gattung Levivirus)
(b) Enterobacteriaphage Qß (Gattung Allolevivirus)

Die Viruspartikel (Virionen) der Leviviridae sind nicht umhüllt mit ikosaedrischer oder sphärischer Geometri und mit Triangulationszahl (Symmetrie) T=3. Der Durchmesser beträgt etwa 26 nm. Das Genom ist linear und nicht segmentiert mit einer Größe von etwa 4000 Nukleotidbasen. Es kodiert für 4 Proteine.[4]

Wirkungsweise

Replikationszyklus der Leviviridae

Nach Eintritt die Wirtszelle erfolgt die Replikation dem Modell für RNA-Viren positiver Polarität. Das Virus tritt durch Bakterienlyse aus der Wirtszelle aus.[4]

Die vier kodierten Proteine sind das Mantel- oder Hüllprotein (für das Kapsid), die Replikase, das Reifungsprotein (A-Protein) und das Lyse-Protein, die zugehörigen Gene heißen cp, rep, mat und lys.[6]

Einzelnachweise

  1. ↑ a b c d e ICTV: ICTV Master Species List 2020.v1, New MSL including all taxa updates since the 2019 release, March 2021 (MSL #36)
  2. ↑ a b ICTV: ICTV Master Species List 2019.v1, New MSL including all taxa updates since the 2018b release, March 2020 (MSL #35)
  3. ↑ ICTV Master Species List 2018b v1 MSL #34, Feb. 2019
  4. ↑ a b c Viral Zone. ExPASy. Abgerufen am 19. Dezember 2018.
  5. ↑ ICTV: ICTV Master Species List 2018a v1. Abgerufen am 19. Dezember 2018.
  6. ↑ a b JP Bollback, JP Huelsenbeck: Phylogeny, genome evolution, and host specificity of single-stranded RNA bacteriophage (family Leviviridae).. In: Journal of Molecular Evolution. 52, Nr. 2, Februar 2001, S. 117–28. doi:10.1007/s002390010140. PMID 11231891.
  7. ↑ Dann Turner, Andrew M. Kropinski, Evelien M. Adriaenssens: A Roadmap for Genome-Based Phage Taxonomy, in: MDPI Viruses Band 13, Nr. 3, Section Bacterial Viruses, 18. März 2021, 506, doi:10.3390/v13030506
  8. ↑ J. Callanan, S. R. Stockdale, E. M. Adriaenssens, J. H. Kuhn: Rename one class (Leviviricetes - formerly Allassoviricetes), rename one order (Norzivirales - formerly Levivirales), create one new order (Timlovirales), and expand the class to a total of six families, 420 genera and 883 species. In: Researchgate. Januar 2021. doi:10.13140/RG.2.2.25363.40481.
  9. ↑ SIB: Levivirus, auf: ViralZone
  10. ↑ SIB: Allolevivirus, auf: ViralZone

Weblinks

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Autor/Urheber: Óttar Rolfsson, Stefani Middleton, Iain W. Manfield, Simon J. White, Baochang Fan, Robert Vaughan, Neil A. Ranson, Eric Dykeman, Reidun Twarock, James Ford, C. Cheng Kao, Peter G. Stockley, Lizenz: CC BY 4.0
Schematic of the bacteriophage MS2 lifecycle. Virions initially bind to the sides of the bacterial pilus via the MP. MPs are an essential single-copy structural component of RNA phages. By a mechanism that remains largely obscure, the RNA–MP complex but not the remaining capsid shell enters the cell. MP also binds to its own PSs located toward either end of the MS2 genome. Recent asymmetric reconstruction of the MS2–pilus complex suggests that MP replaces a CP dimer of the C/C conformer in an otherwise entirely icosahedral protein shell, from which position it is ideally placed to contact the cellular receptor and escort the RNA into the cytoplasm. Note that the presence of the asymmetric MP component could not be detected in averaged X-ray and EM density maps. Once internalized, the MP is cleaved into two separate fragments by protease, allowing translation and replication to start. Temporal control of phage gene expression then regulates the production of progeny genomes and structural proteins that assemble prior to the action of the phage lysis protein.
Viruses-10-00386-g002.png
Autor/Urheber: Julie Callanan,Stephen R. Stockdale, Andrey Shkoporov,Lorraine A. Draper, Paul Ross, and Colin Hill, Lizenz: CC BY 4.0
Schemazeichnung eines Virusteilchens der Leviviridae (Querschnitt) und Genom von

(a) Enterobacteriaphage MS2 (Gattung Levivirus)

(b) Enterobacteriaphage Qß (Gattung Allolevivirus)
Ms2capsid surface.png
Autor/Urheber: Naranson, Lizenz: CC BY-SA 3.0
Cartoon representation of the entire bacteriophage MS2 protein capsid (pdb id 1AQ3). The three quasi-equivalent conformers in the structure are labelled blue (chain a), green (chain b) and magenta (chain c). The view is approximately down an icosahedral 5-fold symmetry axis