Downstream Promoter Element

Übersicht der Konsensussequenzen der vier Kernpromotorelemente B recognition element (BRE), TATA-Box, initiator motif (Inr) und downstream promoter element (DPE).[1]

Downstream Promoter Element (engl., zu deutsch etwa ‚strangabwärtiges Promotorelement‘, DPE) ist ein Bereich eines Promotors und die Bindungsstelle für den Transkriptionsfaktor TFIID.

Eigenschaften

Das Downstream Promoter Element ist ein Teil des Kernpromotors im Bereich von etwa +28 bis +33 nach dem Transkriptionsstartpunkt.[2] Ursprünglich wurde die Konsensussequenz als RGWCGTG beschrieben,[3] während heute die Konsensussequenz RGWYV(T) angenommen wird.[1][2][4] Eine typische gebundene Sequenz lautet A/G-G-A/T-C-G-T-G.

DPE wurden bisher in Drosophila melanogaster und Menschen, jedoch nicht in Saccharomyces cerevisiae gefunden.[2]

Geschichte

DPE wurde erstmals 1996 durch T. W. Burke und James T. Kadonaga an der University of California, San Diego beschrieben.[3]

Einzelnachweise

  1. ↑ a b Jennifer E.F. Butler, James T. Kadonaga: The RNA polymerase II core promoter: a key component in the regulation of gene expression. In: Genes & Development. 16, Nr. 20, 15. Oktober 2002, S. 2583–2592. doi:10.1101/gad.1026202. PMID 12381658.
  2. ↑ a b c Tamar Juven-Gershon, James T. Kadonaga: Regulation of Gene Expression via the Core Promoter and the Basal Transcriptional Machinery. In: Developmental Biology. 339, Nr. 2, 15. März 2010, S. 225–229. doi:10.1016/j.ydbio.2009.08.009. PMID 19682982. PMC 2830304 (freier Volltext).
  3. ↑ a b T.W. Burke, James T. Kadonaga: Drosophila TFIID binds to a conserved downstream basal promoter element that is present in many TATA-box-deficient promoters. (PDF, 5.5 MB) In: Genes & Development. 10, Nr. 6, 15. März 1996, S. 711–724. doi:10.1101/gad.10.6.711. PMID 8598298.
  4. ↑ James T. Kadonaga: The DPE, a core promoter element for transcription by RNA polymerase II Archiviert vom Original am 4. März 2016.  Info: Der Archivlink wurde automatisch eingesetzt und noch nicht geprüft. Bitte prüfe Original- und Archivlink gemäß Anleitung und entferne dann diesen Hinweis.@1@2Vorlage:Webachiv/IABot/www.e-emm.or.kr (PDF, 0.9 MB) In: Experimental & Molecular Medicine. 34, Nr. 4, September 2002, S. 259–264. PMID 12515390. Abgerufen am 5. April 2014.

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Übersicht über die vier Promoter-Kernelemente (core promoter elements) B recognition element (BRE), TATA-Box, initiator element (Inr) und downstream promoter element (DPE) mit ihren jeweiligen Konsensussequenzen sowie dem Abstand vom Startpunkt der Transkription. Die Inr-Konsensussequenz ist sowohl für den Modellorganismus de (Dm) als auch für den Menschen (Hs) angegeben.