Dicer

Dicer
Dicer-Homolog-Protein aus Giardia intestinalis nach PDB 2FFL
Vorhandene Strukturdaten: 2EB1, 4NGB, 4NGC, 4NGD, 4NGF, 4NGG, 4NH3, 4NH5, 4NH6, 4NHA, 4WYQ
Eigenschaften des menschlichen Proteins
Masse/Länge Primärstruktur	1912 Aminosäuren
Bezeichner
Gen-Name	DICER1
Externe IDs	OMIM: 606241 UniProt: Q9UPY3
Enzymklassifikation
EC, Kategorie	3.1.26.-, Ribonuklease
Substrat	RNA
Produkte	RNA-Stücke mit Länge 21–23 bp
Vorkommen
Homologie-Familie	Dicer
Übergeordnetes Taxon	Kiefermäuler
Orthologe
	Mensch	Hausmaus
Entrez	23405	192119
Ensembl	ENSG00000100697	ENSMUSG00000041415
UniProt	Q9UPY3	Q8R418
Refseq (mRNA)	NM_001195573	NM_148948
Refseq (Protein)	NP_001182502	NP_683750
Genlocus	Chr 14: 95.09 – 95.16 Mb	Chr 12: 104.69 – 104.75 Mb
PubMed-Suche	23405	192119

Dicer [ˈdaɪsɚ] (wörtlich etwa „Würfelschneider“, von engl.: to dice: „in Würfel schneiden“) ist eine Endoribonuklease, die doppelsträngige RNA in kurze, doppelsträngige Fragmente schneidet. Je nach Substrat werden diese Produkte unterschiedlich bezeichnet. Diese Fragmente sind etwa 20 bis 25 Nukleotide lang und spielen bei dem Mechanismus der RNA-Interferenz die zentrale Rolle. Mutationen des DICER1-Gens wurden bei kindlichen Tumoren wie dem Pleuro-pulmonalen Blastom oder seltenen kindlichen Tumoren des zentralen Nervensystems^[1] beschrieben. Auch Schilddrüsenveränderungen (mehrknotige Struma) kommen in diesem Kontext vor.^[2]

Dicer ist ein RNase-III-ähnliches Enzym. Es enthält zwei RNase-III-Domänen und eine PAZ-Domäne. Der Abstand zwischen diesen beiden Domänen wird durch einen Helixbereich bestimmt, dessen Länge die Länge der entstehenden siRNAs bestimmt. Dicer katalysiert den ersten Schritt der RNA-Interferenz und initiiert die Bildung des RNA-induced silencing complex (RISC), dessen Endonuklease „argonaute“ in der Lage ist, mRNA abzubauen, deren Sequenz komplementär zu der entstandenen siRNA ist.

Mithilfe von Knockout-Moosen konnte gezeigt werden, dass DCL1b, eines von vier Dicer-Proteinen von Physcomitrella, nicht für die miRNA Biogenese, sondern für das Schneiden der Zieltranskripte notwendig ist. Dies führte zur Aufklärung eines neuen Mechanismus der Genregulation.^[3]

Der Name Dicer wurde von Emily Bernstein vergeben, einer Doktorandin in der Arbeitsgruppe von Greg Hannon am Cold Spring Harbor Laboratory, die als erste Ribonuklease-Aktivität des Dicers an dsRNA zeigen konnte.

Siehe auch

• RNA-induced silencing complex
• RNA-Interferenz

Literatur

• J. J. Rossi: Mammalian Dicer finds a partner. In: EMBO Rep. Band 6, Nr. 10, Okt 2005, S. 927–929. Review. PMID 16222240

Einzelnachweise

1. ↑ Leanne de Kock, John R. Priest, William D. Foulkes, Sanda Alexandrescu: An update on the central nervous system manifestations of DICER1 syndrome. In: Acta Neuropathologica. , doi:10.1007/s00401-019-01997-y.
2. ↑ Doros L, Schultz KA, Stewart DR, et al. DICER1-Related Disorders. 2014 Apr 24. In: Adam MP, Ardinger HH, Pagon RA, et al., editors. GeneReviews® [Internet]. Seattle (WA): University of Washington, Seattle; 1993–2019. Available from: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK196157/
3. ↑ Basel Khraiwesh, M. Asif Arif, Gotelinde I. Seumel, Stephan Ossowski, Detlef Weigel, Ralf Reski, Wolfgang Frank: Transcriptional Control of Gene Expression by MicroRNAs. In: Cell. Band 140, Nr. 1, 8. Januar 2010, ISSN 0092-8674, S. 111–122, doi:10.1016/j.cell.2009.12.023.