Corticoviridae

Corticoviridae

Aufbau des Phagen PM2

Systematik
Klassifikation:Viren
Realm:Varidnaviria[1]
Reich:Bamfordvirae[1]
Phylum:Preplasmiviricota[1]
Klasse:Tectiliviricetes[1]
Ordnung:Vinavirales[1]
Familie:Corticoviridae
Gattung:Corticovirus
Art:Pseudoalteromonas Phage PM2
Taxonomische Merkmale
Genom:dsDNA zirkulär
Baltimore:Gruppe 1
Symmetrie:ikosaedrisch T=21
Hülle:keine
Wissenschaftlicher Name
Corticoviridae
Links

Die Virusfamilie Corticoviridae (lateinisch cortex ‚Rinde, Kruste‘) umfasst nur eine monotypische Gattung Corticovirus von Bakteriophagen. Die einzige bislang (Stand März 2019) vom International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) bestätigte Spezies Corticovirus PM2 (früher Pseudoalteromonas-Virus PM2, mit Pseudoalteromonas-Phage PM2, auch PM2-Phage, ursprünglich Alteromonas-Phage PM2 genannt) hat ein zirkuläres, doppelsträngiges DNA-Genom und ein ca. 56 nm im Durchmesser großes, unbehülltes ikosaedrischen Kapsid.

Aufbau

Rekonstruktion eines Kapsids von Pseudoalteromonas phage PM2
Eintrittsmechanismus von Pseudoalteromonas phage PM2

Die Kapsomere sind aus Trimeren des Kapsidproteins P2 aufgebaut; an den Ecken der Ikosaeder-Struktur befinden sich Fortsätze (spikes), die durch das Virusprotein P1 gebildet werden. Innerhalb (!) des Kapsids befindet sich ein Lipidmembran-Bläschen, das aus Virusproteinen und der Lipidmembran des Wirtsbakteriums besteht. Dieses innere Membranbläschen hat der PM2-Phage mit den Tectiviridae gemein, es dient jedoch dem PM2-Phagen nicht zur Injektion der DNA in das Wirtsbakterium.

Genom

Das ringförmige Genom ist in stark verdrillter Form (supercoiled) innerhalb des Membranbläschens verpackt. Die doppelsträngige DNA ist 10.079 bp (Basenpaare) groß und codiert für neun Strukturproteine (P1-P9), fünf Nicht-Strukturproteine (P12-16) und sieben Genprodukte unbekannter Funktion.

Wirte

Bisher sind zwei marine Bakterienspezies, Pseudoalteromonas BAL-31 und ER72M2, als Wirte für den PM2-Phagen identifiziert.

Systematik

Das National Center for Biotechnology Information (NCBI) nennt neben den ICTV-bestätigten Spezies weitere Kandidaten:

  • Gattung Corticovirus
  • Spezies Corticovirus Cr39582 (veraltet Pseudoalteromonas virus Cr39582), mit Pseudoalteromonas phage Cr39582
  • Spezies Corticovirus PM2 (veraltet Pseudoalteromonas virus PM2)
  • Spezies „Pseudoalteromonas phage GXT1010“ (vorgeschlagen)[2]

Literatur

  • R. T. Espejo, E. S. Canelo: Properties of bacteriophage PM2: A lipid-containing bacterial virus. Virology (1968) 34, S. 738–747
  • H. M. Kivelä, N. Kalkkinnen, Dennis H. Bamford: Bacteriophage PM2 has a protein capsid surrounding a spherical lipid-protein core. Journal of Virology (2002) 76, S. 8169–8178
  • C.M. Fauquet, M.A. Mayo et al.: Eighth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses, London, San Diego, 2004
  • David M. Knipe, Peter M. Howley et al. (Hrsg.): Fields’ Virology, 4. Auflage, Philadelphia 2001

Einzelnachweise

  1. a b c d e ICTV: ICTV Taxonomy history: Pseudoalteromonas virus Cr39582, EC 51, Berlin, Germany, July 2019; Email ratification March 2020 (MSL #35)
  2. NCBI: Pseudoalteromonas phage GXT1010 (species)

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2w0c capsid.png
Autor/Urheber: Opabinia regalis, Lizenz: CC BY-SA 4.0
The assembled capsid of bacteriophage PM2, composed of the major capsid proteins P2 and P3. P2 possesses a canonical double jelly roll fold; here the two distinct jelly roll domains are colored red and blue, with the remainder of the proteins shown in white. The topology and connectivity in each jelly roll is identical to that illustrated in File:4oq9 chainA jellyroll.png. The component pseudohexameric P2 trimers are illustrated in File:2w0c_trimer.png and the individual P2 monomers in File:2w0c_monomer.png.

Rendered from PDB ID 2W0C:

Abrescia NG, Grimes JM, Kivelä HM, Assenberg R, Sutton GC, Butcher SJ, Bamford JK, Bamford DH, Stuart DI. Insights into virus evolution and membrane biogenesis from the structure of the marine lipid-containing bacteriophage PM2. Molecular cell. 2008 Sep 5;31(5):749-61. DOI 10.1016/j.molcel.2008.06.026.
Viruses.11.-2019-76-Fig-1c.png
Autor/Urheber: Sari Mäntynen, Lotta-Riina Sundberg, Hanna M. Oksanen, Minna M. Poranen, Lizenz: CC BY-SA 4.0
Entry mechanisms of membrane-containing phages: Pseudoalteromonas phage PM2. It has been suggested that after phage PM2 binds to the host receptor, its protein capsid dissociates triggering the fusion between the internal membrane vesicle and the bacterial outer membrane and consequently the release of the circular dsDNA genome into the cell. CM, cytoplasmic membrane; PG, peptidoglycan layer; OM, outer membrane of the envelope in Gram-negative host bacterium.
Corticovirus.png
Autor/Urheber: Gleiberg, Lizenz: CC BY-SA 2.0 de
Schematischer Querschnitt des Phagen PM2 der Virusfamilie „Corticoviridae“