Caudoviricetes

Caudoviricetes

Caudoviricetes

Systematik
Klassifikation:Viren
Realm:Duplodnaviria[1][3][2][4]
Reich:Heunggongvirae
Phylum:Uroviricota
Klasse:Caudoviricetes[1][2]
Taxonomische Merkmale
Genom:dsDNA linear/zirkulär unsegmentiert
Baltimore:Gruppe 1
Symmetrie:ikosaedrisch, tailed
Hülle:keine
Wissenschaftlicher Name
Caudoviricetes
Links
Typische Morphologie der Myoviren (Morphotyp A), Podoviren (Typ C) und Siphoviren (Typ B);
von links nach rechts.
Bacillus-Phage Gamma (Gattung Wbetavirus, Siphoviren)[5]

Caudoviricetes (von lateinisch cauda ‚Schwanz‘) ist eine Klasse von Viren, die Bakterien und Archaeen als Wirte nutzen und eine Kopf-Schwanz-Struk­tur besitzen, weshalb die Mit­glieder der Caudo­viricetes einer­seits als Bakterio­phagen klassi­fiziert, anderer­seits gelegentlich informell als Schwanz­viren bezeichnet werden. Die Klasse umfasste bis zum März 2022 nur eine einzige vom International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) bestätigte Ordnung, Caudo­virales. Diese Ordnung war 1998 von Hans-Wolfgang Ackermann aufgrund von EM-Aufnahmen der Virionen als Supergruppe aller geschwänzten Bakteriophagen vorgeschlagen worden, was in der Folge vom ICTV bestätigt wurde. Die klassische Unterteilung dieser Gruppe in Familien erfolgte ebenfalls hauptsächlich aufgrund der genauen Morphologie des am Kapsid sitzenden Schwanz­stückes:

  • Myoviren (englisch myoviruses, ehemalige Familie Myoviridae): Morphotyp A: langes kontraktiles Schwanzstück
  • Siphoviren (en. siphoviruses, ehemalige Familie Siphoviridae): Morphotyp B: langes nicht-kontraktiles Schwanzstück
  • Podoviren (en. podoviruses, ehemalige Familie Podoviridae): Morphotyp C: kurzes nicht-kontraktiles Schwanzstück.

In zunehmendem Maße erlangen aber Gen- und Genom- bzw. Proteom-Vergleiche für die Taxonomie an Bedeutung. Es zeigte sich dabei, dass diese drei traditionellen morphologisch begründeten Familien nicht monophyletisch waren. Dies hatte zur Folge, dass Genomsequenzen (sog. Contigs) aus der Metagenomik im bestehenden System – mit fehlender Information über die Morphologie – nicht zugeordnet werden konnten.[6]

Um dieses Problem zu lösen, hatte das ICTV zunächst verschiedene Gruppen aus diesen herkömmlichen Familien – zunächst formell noch innerhalb der damaligen Ordnung Caudovirales – in neue geschaffene Familien verschoben, darunter die Ackermannviridae, Autographiviridae (jetzt Ordnung Autographivirales), Chaseviridae, Demerecviridae und Herelleviridae.

Im März 2021 resultierten diese Bestrebungen in dem Vorschlag einer kompletten Reorganisation der Klasse unter Abschaffung der bisherigen Ordnung Caudovirales; sowie der Auflösung der damaligen polphyletischen Familien (Myoviridae, Podoviridae und Siphoviridae), wobei diese durch neue monophyletische Familien ersetzt werden und nur noch informall als nicht-taxonomische Gruppen zur morphologischen Klassifizierung (Morphotypen) bestehen bleiben.[6]

Diesen Vorschlag hat das ICTV dann im März 2022 vollständig umgesetzt. Die Ordnung Caudovirales wurde aufgelöst. Der Klade der aus der Metagenomik identifizierten crAss-like phages wurde dabei gemäß Vorschlag der Rang einer Ordnung Crassvirales gegeben[6] und noch weitere Ordnungen eingerichtet. Neben den oben genannten bereits aus den herkömmlichen drei Familien (Morphotypen) ausgegliederten Familien wurden dabei weitere Familien definiert, etliche Unterfamilien verblieben aber zunächst noch ohne Familienzuordnung.

Genom

Das Genom der Caudoviricetes ist unsegmentiert (monopartit), d. h. es besteht aus einem einzigen Molekül einer (gewöhnlich) doppelsträngigen DNA mit einer Größe von 18 bis 500 kBp (Kilobasenpaare). Es ist bei den klassischen Myo-, Sipho- und Podoviren linear, kann aber (wie bei den Crassvirales, en. crAss-like phages) auch als eine ringförmig geschlossene (zirkuläre) DNA vorliegen.

Neben den üblichen Nukleotiden des genetischen Codes besitzen die Caudoviricetes auch modifizierte, z. B. glykosylierte Basen (d. h. mit angehängten zusätzlichen Zuckerresten) oder 5-Hydroxymethylcytosin an Stelle von Cytosin. Die DNA befindet sich in einem 45 bis 170 nm im Durchmesser großen ikosaedrischen Kapsid aus meist 72 Kapsomeren; das Schwanzstück kann bis zu 230 nm lang sein.

Das Genom kodiert für 27 bis über 600 Gene, deren Anordnung stark variiert. Das Genom kann von einzelsträngigen Lücken durchbrochen sein und im linearen Fall kovalent gebundene terminale Proteine besitzen. Im Bakterium können diese Caudoviricetes in das Nukleoid integrieren (Prophage) oder als lineares bzw. zirkuläres Plasmid in der Zelle verbleiben. Die Anzahl der isolierten Genome ist verhältnismäßig hoch, da die Caudoviricetes einem ständigen genetischen Austausch zwischen viralem und bakteriellem Genom wie auch dem horizontalen Austausch als Plasmid zwischen Bakterien unterliegen (siehe horizontaler Gentransfer). Es entsteht so eine Vielzahl von so genannten „Mosaiktypen“.

Verbreitung

Die Caudoviricetes sind stammesgeschichtlich sehr alte Viren mit großen Populationsvarianten und weltweiter Verbreitung. Man schätzt, dass sich etwa 1031 Virionen der Caudoviricetes in der Biosphäre befinden, die aneinandergelegt einer Strecke von 2×108 Lichtjahren entsprächen. Die Caudoviricetes machen den überwiegenden Anteil des Virioplanktons in den Meeren und Gewässern aus.

Systematik

Mit Stand 3. März 2025 kennt das International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) die folgende Familien und Unterfamilien (ergänzt um einige Vorschläge in doppelten Anführungszeichen), wobei etliche Gattungen, Unterfamilien und Familien noch ohne Zuordnung sind:[7]

Klasse Caudoviricetes

  • Ordnung AdrikaviralesArchaeenviren
  • Ordnung Autographivirales – früher Familie Autographiviridae, ursprünglich Unterfamilie Autographivirinae und Mitglied der ehemaligen Familie Podoviridae; Morphotyp: Podoviren
  • Ordnung CrassviralesKlade crAss-like phages mit zirkulärem Genom, Morphotyp: Podoviren (ursprünglich als Mitglieder der ehemaligen Familie Podoviridae vorgeschlagen);[10][11][12][6][13] inklusive Gubaphagen.
  • Ordnung Grandevirales (provisorisch auch „Caudoviricetes code 15 Clade“[14]) – vom Morphotyp Myoviren[15][16]
    • Familie Epsomviridae
    • Familie Lakviridae (Lak-Phagen)[15]
  • Ordnung Juraviralesmarin, Wirte: Ammoniak-oxidierende marine Archaeen der Klasse Nitrososphaeria: Mathaviren; Morphotyp: Siphoviren[17]
  • Ordnung Kirjokansivirales – Archaeen-Viren der Halobacteria mit Kopf-Schwanz-Struktur (Podo- und Siphoviren)[18]
  • Ordnung Magroviralesmarin, Wirte: Euryarchaeota der Ordnung Poseidoniales alias marine group II: Magroviren, Morphotyp: Siphoviren[17]
  • Ordnung Methanobavirales – Archaeen-Viren der Methanbildner mit Kopf-Schwanz-Struktur, Siphoviren[18]
  • Ordnung Nakonvirales – Archaeen-Viren[19]
  • Ordnung Pantevenvirales
  • Ordnung Thumleimavirales – Archaeen-Viren mit Kopf-Schwanz-Struktur (Myo- und Siphoviren)[18]
  • ohne Ordnungszuweisung
    • Morphotyp A: Myoviren (englisch myoviruses)
      • Familie Andersonviridae (nur Unterfamilie Ounavirinae, ehem. Myoviridae)
      • Familie Arenbergviridae (neu 2023)
      • Familie Berryhillviridae (mit Gattung Ayohtrevirus, ehem. Myoviridae)
      • Familie Chaseviridae[21]
      • Familie Chimalliviridae (nur Unterfamilie Gorgonvirinae, ehem. Myoviridae)
      • Familie Connertonviridae (früher Unterfamilie Eucampyvirinae, ehem. Myoviridae)
      • Familie Herelleviridae (Myoviren[22])
      • Familie Lindbergviridae (Myoviren)
      • Familie Peduoviridae (ehemalige Myoviridae-Unterfamilie Peduovirinae)
      • Familie Vandenendeviridae
      • Familie Vertoviridae (Archaeenviren)
      • Familie Winoviridae (2 Gattungen)
      • keiner Familie zugeordnet
        • Unterfamilie Ceeclamvirinae
        • Unterfamilie Iiscvirinae
        • Unterfamilie Jameshumphriesvirinae
        • Unterfamilie Kantovirinae
        • Unterfamilie Stephanstirmvirinae
        • Unterfamilie Vequintavirinae
    • Morphotyp B: Siphoviren (englisch siphoviruses)
      • Familie Aliceevansviridae
      • Familie Assiduviridae (3 Gattungen)
      • Familie Casidaviridae
      • Familie Casjensviridae
      • Familie Colingsworthviridae
      • Familie Demerecviridae
      • Familie Drexlerviridae
      • Familie Duneviridae
      • Familie Ehrlichviridae
      • Familie Fervensviridae
      • Familie Forsetiviridae, ehemalige Unterfamilie Bclasvirinae
      • Familie Hodgkinviridae
      • Familie Jeanschmidtviridae (früher Unterfamilie Dolichocephalovirinae, ehem. Siphoviridae)
      • Familie Madisaviridae (Archaeenviren)
      • Familie Mesyanzhinovviridae
      • Familie Naomviridae (1 Gattung)[23]
      • Familie Orlajensenviridae
      • Familie Pungoviridae (Archaeenviren)
      • Familie Saparoviridae (Archaeenviren)
      • Familie Sarkviridae
        • Unterfamilie Guernseyvirinae (ehem. zu Siphoviridae)
        • ohne zugewiesene Unterfamilie (Gattungen Otakuvirus und Seretavirus)
      • Familie Speroviridae (Archaeenviren)
      • Familie Stackebrandtviridae (mit Vividuovirus vivi2)
      • Familie Stanwilliamsviridae
        • Unterfamilie Boydwoodruffvirinae (mit Gattung Karimacvirus ehem. Siphoviridae)
        • Unterfamilie Loccivirinae
      • Familie Suolaviridae (Archaeenviren)
      • Familie Trautnerviridae (mit Bacillus-Phage SPP1, Morphotyp Siphoviren)
      • Familie Verdandiviridae (Archaeenviren)[24][25]
      • Virion des Mycobacterium-Phagen Rey (Gattung Reyvirus, Familie Vilmaviridae).
        Familie Vilmaviridae
      • Familie Zierdtviridae
      • Familie „Suviridae[26][27][A. 2]
      • keiner Familie zugeordnet
        • Unterfamilie Andrewesvirinae
        • Unterfamilie Arquatrovirinae
        • Unterfamilie Azeredovirinae
        • Unterfamilie Bclasvirinae
        • Unterfamilie Bronfenbrennervirinae
        • Unterfamilie Chebruvirinae
        • Unterfamilie Dclasvirinae
        • Unterfamilie Deejayvirinae
        • Unterfamilie Dovevirinae
        • Unterfamilie Gclasvirinae
        • Unterfamilie Gochnauervirinae
        • Unterfamilie Gracegardnervirinae
        • Unterfamilie Guarnerosvirinae
        • Unterfamilie Gutmannvirinae
        • Unterfamilie Hendrixvirinae
        • Unterfamilie Jondennisvirinae
        • Unterfamilie Kutznervirinae
        • Unterfamilie Langleyhallvirinae
        • Unterfamilie Mccleskeyvirinae
        • Unterfamilie Nclasvirinae
        • Unterfamilie Nymbaxtervirinae
        • Unterfamilie Pclasvirinae
        • Unterfamilie Queuovirinae
        • Unterfamilie Ruthgordonvirinae
        • Unterfamilie Sejongvirinae
        • Unterfamilie Skryabinvirinae
        • Unterfamilie Trabyvirinae
        • Unterfamilie Tybeckvirinae
        • Unterfamilie Weiservirinae
    • Morphotyp C: Podoviren (englisch podoviruses)
      • Familie Fredfastierviridae
      • Familie Grimontviridae
      • Familie Guelinviridae
      • Familie Madridviridae
      • Familie Mktvariviridae
      • Familie Pachyviridae
      • Familie Pervagoviridae
      • Familie Rountreeviridae
      • Familie Saffermanviridae
      • Familie Salasmaviridae
      • Familie Schitoviridae[28][29][6]
      • Familie Zobellviridae
      • Klade/KladeLambda-Supergruppe“ (en. „λ supergroup“, vorgeschlagen)[30]
        • Gattung Backyardiganvirus
        • Gattung Eagleeyevirus
        • Gattung Fromanvirus
        • Gattung Gladiatorvirus
        • Gattung Lambdavirus (früher Lambdalikevirus, λ‐like phages, Lambda-ähnliche Viren)
        • Gattung Lomovskayavirus
        • Gattung Skunavirus (früher Sk1virus, Skunalikevirus, Sk1likevirus, Sk1-like phages)
        • Gattung Turbidovirus
        • Gattung Veracruzvirus
      • keiner Familie oder Supergruppe zugeordnet
        • Unterfamilie Beephvirinae
        • Unterfamilie Eekayvirinae
        • Unterfamilie Sepvirinae
        • ohne zugewiesene Familien- oder Unterfamilienzuordnung
          • Gattung Lilyvirus
          • Gattung Alteavirus (mögliche Schwesterklade der Schitoviridae)[28]
    • ohne bekannte Zuordnung zu einer Ordnung oder einer der drei obigen Morphotypen:
      • Familie Aggregaviridae
      • Familie Alisviridae
      • Familie Clermontviridae
      • Familie Felixviridae
      • Familie Fuxiviridae
      • Familie Helgolandviridae
        • Gattung Leefvirus
          • Spezies Polaribacter-Virus Leef (wiss. Leefvirus Leef)[31]
      • Familie Kleczkowskaviridae
      • Familie Konodaiviridae
      • Familie Kruegerviridae
      • Familie Kunpengviridae
      • Familie Ludisviridae
      • Familie Lutetiaviridae
      • Familie Mazoviaviridae
      • Familie Molycolviridae
        • Gattung Mollyvirus – zu unterscheiden von der vorgeschlagenen Gattung Mollivirus (Mimiviridae)
          • Spezies Maribacter-Virus Colly (wiss. Mollyvirus colly)[32]
          • Spezies Maribacter-Virus Molly (wiss. Mollyvirus molly)[33]
      • Familie Nixviridae
      • Familie Pootjesviridae
      • Familie Toyamaviridae
      • Familie Umezonoviridae[A. 3]
      • Familie „Flandersviridae“[35]
      • Familie „Gratiaviridae“[35]
      • Familie „Quimbyviridae“[35]
      • Familie „Saltoviridae“[36]
      • ohne zugewiesene Familie
        • Unterfamilie Andregratiavirinae
        • Unterfamilie Beaumontvirinae
        • Unterfamilie Daemsvirinae
        • Unterfamilie Deeyouvirinae
        • Unterfamilie Feeclasvirinae
        • Unterfamilie Ferrettivirinae
        • Unterfamilie Heleneionescovirinae
        • Unterfamilie Joanripponvirinae
        • Unterfamilie Johnpaulvirinae
        • Unterfamilie Mcshanvirinae
        • Unterfamilie Munstervirinae
        • Unterfamilie Stanbaylleyvirinae
        • ohne zugewiesene Unterfamilie
          • Gattung „Chungbukvirus“[37] – war früher den Siphoviridae zugeordnet, weicht laut ICTV erheblich von diesen ab und hat Gemeinsamkeiten mit den Myoviridae; sie wird mit ihren Spezies vom ICTV aktuell nicht gelistet (wg. unvollständiger Genom-Daten).
          • Gattung „Pyrovirus“ – Wirte: Bakterien der Aquificae[38][39][40]
            • Spezies „Thermocrinis Octopus Spring virus“ (TOSV), Isolat OS3173 – Wirt: Thermocrinis (Aquificae), Fundort: Octopus Spring (Yellowstone-Nationalpark),[41][42] nicht zu verwechseln mit Toskana-Virus (TOSV)
            • Spezies „Thermocrinis Great Boiling Spring virus“ (TGBSV), Isolat GBS41 – Wirt: Thermocrinis (Aquificae), Fundort: Great Boiling Spring (GBS), Nevada[43][44]
            • Spezies „Aquificae Joseph’s Coat Spring Virus“ (AJCSV), Isolat JC39 – Fundort: Joseph’s Coat Spring[45][46] und Calcite Spring[47][48]
            • Spezies „Aquificae Conch Spring Virus“ (ACSV), Isolat Conch37 – Fundort: [Iron] Conch Spring im Shoshone Geyser Basin (Yellowstone-Nationalpark)[49]
          • ohne Zuordnung zu einem Taxon oder einer (oben genannten) Klade:
            • Spezies „Pseudomonas-Virus Ptobp6g“ (Typus)[50] (mit „Pseudomonas-Phage phi_Pto-bp6g“)[51]
            • Spezies „Streptococcus-Phage ω1“ (alias Pneumococcus phage ω1, auch „ω-1“)[52][53][54]
            • „Hydrogenobaculum phage HP1“ nahe verwandt mit der vorgeschlagenen Gattung „Pyrovirus“[38]
            • „Escherichia-Phage P4“ ist ein Satellitenvirus, das Phagen der Gattung Peduovirus (früher P2likevirus, Familie Peduoviridae, Morphotyp Myoviren) als Helfervirus benötigt, d. h. ein Satellitenphage.[55][56]

Galerie

Anmerkungen

  1. mit Poseidoniales virus P01 (Poseidoniales virus isolate PR24_contig_10065_pilon), Zugriffsnummer PP497040.[8][9]
  2. Im Oktober 2023 das tiefste je gefundene Virus (Marianengraben). Wirt: Halomonas meridiana H4907.
  3. teilweise verschrieben als Umezuonoviridae[34]

Literatur

  • C. M. Fauquet, M. A. Mayo et al.: Eighth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses. San Diego / London 2004.
  • Bernard N. Fields, David M. Knipe, Peter Howley (Hrsg.): Fields Virology. 4. Auflage. Philadelphia 2001.
Commons: Caudoviricetes – Sammlung von Bildern, Videos und Audiodateien
Wikispecies: Caudoviricetes – Artenverzeichnis

Einzelnachweise

  1. a b ICTV: ICTV Master Species List 2019.v1, New MSL including all taxa updates since the 2018b release, March 2020 (MSL #35).
  2. a b ICTV: ICTV Master Species List 2021.v1, New MSL including all taxa updates since the 2020 release, March 2022 (MSL #37).
  3. ICTV: ICTV Master Species List 2020.v1, New MSL including all taxa updates since the 2019 release, March 2021 (MSL #36).
  4. ICTV: ICTV Master Species List 2021.v2, New MSL including some corrections.
  5. NCBI Taxonomy Browser: Bacillus phage Gamma (species).
  6. a b c d e Dann Turner, Andrew M. Kropinski, Evelien M. Adriaenssens: A Roadmap for Genome-Based Phage Taxonomy, in: MDPI Viruses Band 13, Nr. 3, Section Bacterial Viruses, 18. März 2021, 506, fdoi:10.3390/v13030506
  7. ICTV: MSL #40.v1, 3. März 2025.
  8. a b ICTV: VMR_MSL40.v1.
  9. NCBI Nucleotide: MAG: Poseidoniales virus isolate PR24_contig_10065_pilon. Accession: PP497040.
  10. NCBI Taxonomy Browser: Crassvirales (order).
  11. SIB: Intestiviridae, früher crAss-like phages/viruses. Auf: ViralZone (Expasy).
  12. Eugene V. Koonin, Natalya Yutin: The crAss-like Phage Group: How Metagenomics Reshaped the Human Virome. In: Trends in Microbiology, Band 28, Nr. 5, 28. Februar/1. Mai 2020, S. 349–359; doi:10.1016/j.tim.2020.01.010 (englisch).
  13. Andrey N. Shkoporov, Stephen R. Stockdale, Evelien M. Adriaenssens, Natalya Yutin, Eugene V. Koonin, B. E. Dutilh, Mart Krupovic, Robert A. Edwards, I. Tolstoy, C. Hill (crAss-like phages Study Group): Create one new order (Crassvirales) including four new families, ten new subfamilies, 42 new genera and 73 new species (Caudoviricetes). 2021.022B.R.Crassvirales (zip:docx). Revision vom 13. Mai 2021 (englisch).
  14. NCBI Taxonomy Browser: Caudoviricetes code 15 clade. Details: Caudoviricetes code 15 clade.
  15. a b Audra E. Devoto, Joanne M. Santini et al.: Megaphages infect Prevotella and variants are widespread in gut microbiomes. In: Nature Microbiology, Band 4, 28. Januar 2019, S. 693–700; doi:10.1038/s41564-018-0338-9 (englisch). Siehe insbes. Tabelle 1 und Supplementary Figure 11.
  16. Igor Babkin, Artem Tikunov, Vera Morozova, Andrey Matveev, Vitaliy V. Morozov, Nina Tikunova: Genomes of a Novel Group of Phages That Use Alternative Genetic Code Found in Human Gut Viromes. In: MDPI: International Journal of Molecular Sciences, Band 24, Nr. 20, 18. Oktober 2023, S. 15302; doi:10.3390/ijms242015302, PMC 10607447 (freier Volltext), PMID 37894982 (englisch).
  17. a b Yifan Zhou, Mart Krupovic, Yongjie Wang: Create two new orders, Juravirales and Magrovirales, including two and one new families of marine archaeal viruses, respectively. 2022.003A.Caudoviricetes_2no_3n (zip:docx). Proposal 2022.003A, Oktober 2022. Memento im Webarchiv vom 8. März 2023.
  18. a b c Y. Liu et al. (ICTV Archaeal Viruses Subcommittee): Proposal 2021.001A (zip:docx), PDF (via Universität Helsinki). Create three new orders and 14 new families in the class Caudoviricetes (Duplodnaviria, Uroviricota) for classification of archaeal tailed viruses. Oktober 2020.
  19. Rafael Laso-Pérez, Fabai Wu, Antoine Crémière, Daan R. Speth, John S. Magyar, Mart Krupovic, Victoria J. Orphan: Create three new orders and 5 new families of viruses associated with methanotrophic archaea. Vorschlag 2022.001A vom Mai 2022. Memento im Webarchiv vom 8. März 2023.
  20. SIB: Ackermannviridae, auf: ViralZone
  21. Evelien M. Adriaenssens, Mart Krupovic et al.: Taxonomy of prokaryotic viruses: 2018–2019 update from the ICTV Bacterial and Archaeal Viruses Subcommittee. In: Archives of Virology, Band 165, 11. März 2020, S. 1253–1260; doi:10.1007/s00705-020-04577-8, ResearchGate:339882046, PDF (PDF) – (englisch).
  22. SIB: Herelleviridae. Auf: ViralZone (Expasy).
  23. B. Rihtman et al. (ICTV Bacterial Viruses Subcommittee): Proposal 2021.056B. Create one new family Naomiviridae including one new genus (Caudoviricetes)
  24. ICTV: The Master Species List: A Spreadsheet of Current Taxonomy, §ICTV Master Species List 2022 MSL38 v1 (xlsx). 8. April 2023.
  25. Sofia Medvedeva, Jiarui Sun, Natalya Yutin, Eugene V. Koonin, Takuro Nunoura, Christian Rinke, Mart Krupovic: ictv.global (zip:docx): Create one new order, ‘Atroposvirales’ and two new families, ‘Verdandiviridae’ and ‘Skuldviridae’ for classification of viruses of Asgardarchaeota. Oktober 2021.
  26. Yue Su, Wenjing Zhang, Yantao Liang, Hongmin Wang, Yundan Liu, Kaiyang Zheng, Ziqi Liu, Hao Yu, Linyi Ren, Hongbing Shao, Yeong Yik Sung, Wen Jye Mok, Li Lian Wong, Yu-Zhong Zhang, Andrew McMinn, Min Wang: Identification and genomic analysis of temperate Halomonas bacteriophage vB_HmeY_H4907 from the surface sediment of the Mariana Trench at a depth of 8,900 m. In: ASM Journals: Microbiology Spectrum (Bacteriophages), 20. September 2023; doi:10.1128/spectrum.01912-23, PMID 37728551, PMC 10580944 (freier Volltext), ResearchGate (englisch). Siehe insbes. Fig. 1. Dazu:
  27. NCBI Taxonomy Browser: Halomonas phage vB_HmeY_H4907 (species).
  28. a b E. M. Adriaenssens, T. Tolstoy, A. M. Kropinski, C. Moraru, J. Wittmann: 2020.146B.R.Schitoviridae.zip (docx, xlsx), Vorschlag an das ICTV 2020.146B.R.Schitoviridae: Create one new family (Schitoviridae) including eight existing subfamilies and 40 existing genera (Caudovirales), 6. Juli 2020.
  29. ICTV: Bacterial and archaeal virus proposals@1@2Vorlage:Toter Link/talk.ictvonline.org (Seite nicht mehr abrufbar, festgestellt im März 2023. Suche in Webarchiven)  Info: Der Link wurde automatisch als defekt markiert. Bitte prüfe den Link gemäß Anleitung und entferne dann diesen Hinweis. (zip): 2020.146B.R.Schitoviridae.xlsx
  30. Harald Brüssow, Frank Desiere: Comparative phage genomics and the evolution of Siphoviridae: insights from dairy phages. In: Mol Microbiol. 39, Nr. 2, 2001, S. 213–222. doi:10.1046/j.1365-2958.2001.02228.x, PMID 11136444, 21. Dezember 2001 (englisch), Stichwort „λ supergroup“.
  31. NCBI: Polaribacter phage Leef (species)
  32. NCBI: Maribacter phage Colly (species)
  33. NCBI: Maribacter phage Molly (species)
  34. ICTV: Virion Diagrams, § Bacteria: Page 3.
  35. a b c Sean Benler, Natalya Yutin, Dmitry Antipov, Mikhail Raykov, Sergey Shmakov, Ayal B. Gussow, Pavel Pevzner, Eugene V. Koonin: Thousands of previously unknown phages discovered in whole-community human gut metagenomes (PDF) auf: bioRxiv, Preprint vom 7. Oktober 2020, doi:10.1101/2020.10.07.330464
  36. ICTV:2018.139B.Ud.v1.Saltoviridae.xlsx (Memento desOriginals vom 11. November 2019 im Internet Archive)  Info: Der Archivlink wurde automatisch eingesetzt und noch nicht geprüft. Bitte prüfe Original- und Archivlink gemäß Anleitung und entferne dann diesen Hinweis.@1@2Vorlage:Webachiv/IABot/talk.ictvonline.org, ICTV Proposals: Saltoviridae, vom 27. August 2018
  37. ICTV: ICTV Taxonomy history: Chungbukvirus, ICTV Taxonomy History
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