Ampullaviridae

Ampullaviridae

Ampullavirus

Systematik
Klassifikation:Viren
Realm:nicht klassifiziert[1]
Reich:nicht klassifiziert[1]
Phylum:nicht klassifiziert[1]
Klasse:nicht klassifiziert[1]
Ordnung:nicht klassifiziert[1]
Familie:Ampullaviridae[1]
Gattung:Ampullavirus
Taxonomische Merkmale
Genom:dsDNA linear
Baltimore:Gruppe 1
Symmetrie:flaschenförmig
Hülle:behüllt
Wissenschaftlicher Name
Ampullaviridae
Links
NCBI Taxonomy:573053 (Familie),
573054 (Gattung)
ViralZone (Expasy, SIB):3016 (Familie),
623 (Gattung)
ICTV Taxon History:201902481

Ampullaviridae ist die Bezeichnung einer Familie von Viren mit einem linearen Doppelstrang-DNA-Genom, die Archaeen der Gattung Acidianus ([en], Crenarchaeota) infizieren.[2] Bisher ist vom International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) nur die einzige Gattung Ampullavirus in dieser Familie bestätigt, und diese mit nur einer Spezies (Art): Acidianus bottle-shaped virus.[3]

Der Name der Familie und der Gattung ist vom lateinischen Wort für Flasche, ampulla, abgeleitet, da die Virionen die Form einer Flasche haben. Die Familie wurde erstmals bei einer Untersuchung der mikrobiellen Flora von heißen Quellen in Italien beschrieben.

Aufbau und Genom

Negativ-Kontrast.EM-Aufnahme von ursprünglichen (links) und teilweise degradierten Virionen von ABV. Rechts unten Schemazeichnung nach Häring et al. (2005).[2][4][Anm. 1]

Ampullaviren haben eine sehr spezifische Morphologie. Die Virionen (Virusteilchen) sind flaschenförmig mit einem schmalen Ende auf der einen Seite, wobei sich die Gestalt zum anderen Ende fließend erweitert. Die Gesamtlänge beträgt etwa 230 nm bei einer Breite (am weiten Ende) von etwa 75 nm. Das schmale Ende ragt über die Virushülle hinaus und dient wahrscheinlich der Injektion der viralen DNA in Wirtszellen. Das breite Ende besitzt etwa 20 dünne Filamente, die regelmäßig in einem Ring verteilt sind. Im Inneren der Hülle befindet sich eine trichterförmige Proteinhülle, die die virale DNA beherbergt.[2]

Das Genom der Ampullaviren ist unsegmentiert (monopartit) und besteht aus einem linearen doppelsträngigen DNA-Molekül mit einer Länge von etwa 23,8 kbp (Kilobasenpaaren). Es enthält schätzungsweise 56 oder 57 offene Leserahmen (en. Open Reading Frames, ORFs), die für mindestens sechs Strukturproteine kodieren.[2][5]

Reproduktionszyklus

Die virale Replikation erfolgt im Zytoplasma der Wirtszelle. Der Eintritt in die Wirtszelle erfolgt nach die Anheftung des Virus an die Wirtszelle. Die Transkription erfolgt durch Ablesen des dsDNA-Genoms (en. DNA templated transcription). Als natürlicher Wirt dienen Archaeen der Gattung Acidianus. (Crenarchaeota) Die Übertragung der Virusteilchen geschieht durch passive Diffusion.[6][7]

Systematik

Die innere Systematik der Familie ist mit Stand 18. März 2021 nach ICTV und NCBI wie folgt (vorgeschlagene Taxa in doppelten Anführungszeichen):

Familie: Ampullaviridae

  • Gattung: Ampullavirus
    • Spezies: Acidianus bottle-shaped virus (ABV, Typus)
    • Spezies: Acidianus bottle-shaped virus 2 (ABV2)[8]
    • Spezies: Acidianus bottle-shaped virus 3 (ABV3)[9]

Bezüglich der äußeren Systematik schlugen Kim et al. (2019) folgendes Kladogramm vor (vereinfacht):[10][11]

 ​​​ 
 ​ 

Ovaliviridae


 ​​​ 
 ​ 

Salasmaviridae: Picovirinae


   

Tectiviridae (monoderm hosts: Gram-positive Bakterien)



 ​ 

Tectiviridae (diderm hosts: Gram-negative Bakterien)


   

Autolykiviridae[12][13]





 ​ 

Ampullaviridae


 ​ 

Thaspiviridae: Nitmarvirus (Stämme Nitrosopumilus spindle-shaped virus 1,2 und 3; NSV1–3)[14][15]


 ​ 

Halspiviridae: Salterprovirus (His 1 virus)


   

Pleolipoviridae: Gammapleolipovirus (His 2 virus)






Vorlage:Klade/Wartung/Style

Anmerkung: Die Picovirinae wurden zwischenzeitlich vom ICTV von der ehemaligen Familie Podoviridae in die neue Familie Salasmaviridae verschoben.

Anmerkungen

  1. ↑ Das Material wurde von dieser Quelle kopiert, die unter einer Creative Commons Attribution 4.0 International License verfügbar ist.

Weblinks

Einzelnachweise

  1. ↑ a b c d e f ICTV: ICTV Master Species List 2019.v1, New MSL including all taxa updates since the 2018b release, March 2020 (MSL #35)
  2. ↑ a b c d Monika Häring, R. Rachel, X. Peng, R. A. Garrett, D. Prangishvili: Viral diversity in hot springs of Pozzuoli, Italy, and characterization of a unique archaeal virus, Acidianus bottle-shaped virus, from a new family, the Ampullaviridae. In: Journal of Virology. 79, Nr. 15, 2005, S. 9904–9911. doi:10.1128/JVI.79.15.9904-9911.2005. PMID 16014951. PMC 1181580 (freier Volltext).
  3. ↑ D Prangishvili, M Krupovic, ICTV Report Consortium: ICTV Virus Taxonomy Profile: Ampullaviridae.. In: The Journal of General Virology. 99, Nr. 3, 8. Februar 2018, S. 288–289. doi:10.1099/jgv.0.001023. PMID 29458532. PMC 5882107 (freier Volltext).
  4. ↑ Andrew M. Kropinski, Stuart G. Siddell: ICTV Online Report/ampullaviridae Ampullaviridae, Genus: Ampullavirus (ICTV)
  5. ↑ X. Peng, T. Basta, M. Häring, R. A. Garrett, D. Prangishvili: Genome of the Acidianus bottle-shaped virus and insights into the replication and packaging mechanisms. In: Virology. 364, Nr. 1, 2007, S. 237–243. doi:10.1016/j.virol.2007.03.005. PMID 17412384.
  6. ↑ ICTV Online Report Ampullaviridae. Abgerufen am 2. Mai 2020.
  7. ↑ Viral Zone. ExPASy. Abgerufen am 2. Mai 2020.
  8. ↑ Acidianus bottle-shaped virus 2 (species). NCBI.
  9. ↑ Acidianus bottle-shaped virus 3 (species). NCBI
  10. ↑ Jong-Geol Kim, So-Jeong Kim, Virginija Cvirkaite-Krupovic, Woon-Jong Yu, Joo-Han Gwak, Mario López-Pérez, Francisco Rodriguez-Valera, Mart Krupovic, Jang-Cheon Cho, Sung-Keun Rhee: Spindle-shaped viruses infect marine ammonia-oxidizing thaumarchaea. In: PNAS, Band 116, Nr. 31, 30. Juli 2019, S. 15645–15650; doi:10.1073/pnas.1905682116, ResearchGate, Epub 16. Juli 2019.
  11. ↑ Jong-Geol Kim, Mart Krupovic, Sung-Keun Rhee: Thaspiviridae Proposal 2019.092B (ZIP-Member 2019.092B.A.v1.Thaspiviridae_1nfam.docx), 2019 – accepted
  12. ↑ Scientists Find New Type of Virus in World’s Oceans: Autolykiviridae, auf: sci-news vom 25. Januar 2018
    Forscher entdecken ein mysteriöses Virus, das die Ozeane dominiert, auf: business insider vom 29. Januar 2018
    Never-Before-Seen Viruses With Weird DNA Were Just Discovered in The Ocean. sciencealert, 25. Januar 2018
    David L. Chandler: Researchers Discover a Missing Link in Virus Evolution, auf: SciTechDaily vom 25. Januar 2018
  13. ↑ Autolykiviridae (family). NCBI
  14. ↑ ICTV Taxonomy history: Nitmarvirus NSV1. ICTV, EC 51, Berlin, Germany, July 2019; Email ratification March 2020 (MSL #35)
  15. ↑ ICTV Master Species List 2020.v1. ICTV, New MSL including all taxa updates since the 2019 release, March 2021 (MSL #36)

Auf dieser Seite verwendete Medien

ODD.Amp.Fig1 Acidianus bottle-shaped virus.png
Autor/Urheber: ICTV Internatiuonal Committee on Taxonomy of Viruses, David Prangishvili, Mart Krupovic, Andrew M. Kropinski, Stuart G. Siddell; bottom right: Häring et al. 2005, Lizenz: CC BY-SA 4.0
Ampullaviridae. Negative-contrast electron micrographs of native (left) and partially degraded (right) virions of an isolate of Acidianus bottle-shaped virus. Schematic representation of the virion (bottom right). The scale bars represent 100 nm. (Modified with permission from (Häring et al., 2005))
Ampullavirus virion.jpg
Autor/Urheber: ViralZone, SIB Swiss Institute of Bioinformatics, Lizenz: CC BY-SA 4.0
Schemazeichnung eines Virions der Gattung Ampullavirus im Querschnitt