Aenigmarchaeota
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| Wissenschaftlicher Name | ||||||||||
| Aenigmarchaeota | ||||||||||
| Rinke et al. 2013 |
Aenigmarchaeota ist ein 2013 vorgeschlagenes Phylum (auch Stamm oder englisch division, lateinisch divisio) von Archaeen.[2] Dessen erste Vertreter wurden, wie der Stamm (en. strain) Aenigmarchaeota archaeon SCGC AAA011-O16 (Spezies „Candidatus Aenigmatarchaeum subterraneum“) in Abwässern von Bergwerken und in Sedimenten von Thermalquellen gefunden.[3] Sie sind obligate Symbionten von Bakterien des Stammes (Phylums) Chloroflexi[1] und gehören zur Klade der DPANN-Archaeen (Diapherotrites, Parvarchaeaota, Aenigmarchaeota, Nanohaloarchaeota und Nanoarchaeota).[4][3]
Systematik
Die hier angegebene Taxonomie basiert mit Stand 19. Februar 2022 auf den folgenden Quellen:
- L – List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN)[5]
- N – National Center for Biotechnology Information (NCBI, Taxonomy Browser),[6]
Die Taxonomie der DPANN-Archaeen ist wie die der Archaeen überhaupt derzeit (Stand Februar 2022) noch in der Diskussion. Wie an der früheren Bezeichnung „Euryarchaeota DSEG Cluster“ zu erkennen ist, ordneten davon abweichende Taxonomien das Phylum den Euryarchaeota anstelle der DPANN-Gruppe zu. Zudem wurde eine Reklassifizierung vorgeschlagen, die vielen Gruppen niedrigere Rangstufen als die überkommenen zuordnet. Aus dem Phylum Aenigmarchaeota wird danach eine Klasse Aenigmarchaea mit einer Ordnung Aenigmarchaeales als Subtaxon.[7] Allerdings sind bisher nur einige Autoren diesem Vorschlag gefolgt,[8] insbesondere die LPSN und die Taxonomie des NCBI sind diesem Vorschlag (bisher) nicht gefolgt. Die LPSN kennt im Phylum Aenigmarchaeota nur eine einzige Gattung Aenigmarchaeum mit nur einer Spezies (Art), Aenigmatarchaeum subterraneum, die NCBI-Taxonomie listet noch eine Reihe weiterer Kandidatenspezies mit vorläufigen Namen. Vertreter in doppelten Anführungszeichen sind noch nicht vollgültig taxonomisch beschrieben:
Phylum: (Candidatus) Aenigmarchaeota Rinke et al. 2013 (L,N), früher Candidate division DUSEL2 (N), „Euryarchaeota DSEG Cluster“ (N)
- Gattung: „Candidatus Aenigmatarchaeum“ corrig.Rinke et al. 2013 (L), mit Schreibvariante „Ca. Aenigmarchaeum“ Rinke et al. 2013 (L,N)
- Spezies: „Candidatus Aenigmatarchaeum subterraneum“ corrig.Rinke et al. 2013 (L), mit Schreibvariante „Ca. Aenigmarchaeum subterraneum“ Rinke et al. 2013 (L,N)[9]
- Stamm: Candidatus Aenigmarchaeum subterraneum SCGC AAA011-O16 (N), früher Aenigmarchaeota archaeon SCGC AAA011-O16 (N) und Candidate division DUSEL2 archaeon SCGC AAA011-O16 (N),
Fundstelle: Süßwasser, Grundwasser, Mine[10]
- Stamm: Candidatus Aenigmarchaeum subterraneum SCGC AAA011-O16 (N), früher Aenigmarchaeota archaeon SCGC AAA011-O16 (N) und Candidate division DUSEL2 archaeon SCGC AAA011-O16 (N),
- Spezies: „Candidatus Aenigmatarchaeum subterraneum“ corrig.Rinke et al. 2013 (L), mit Schreibvariante „Ca. Aenigmarchaeum subterraneum“ Rinke et al. 2013 (L,N)[9]
- Nicht in Gattungen klassifizierte Mitglieds-Stämme aus der Metagenomik mit vorläufigen Bezeichnungen im Rang einer (möglichen) Spezies (N):
- Spezies: Candidatus Aenigmarchaeota archaeon CG01_land_8_20_14_3_00_37_9
- Spezies: Candidatus Aenigmarchaeota archaeon CG01_land_8_20_14_3_00_37_9
- Spezies: Candidatus Aenigmarchaeota archaeon CG15_BIG_FIL_POST_REV_8_21_14_020_37_27
- Spezies: Candidatus Aenigmarchaeota archaeon CG1_02_38_14
- Spezies: Candidatus Aenigmarchaeota archaeon CG_4_10_14_0_8_um_filter_37_24
- Spezies: Candidatus Aenigmarchaeota archaeon CG_4_10_14_3_um_filter_37_21
- Spezies: Candidatus Aenigmarchaeota archaeon CG_4_8_14_3_um_filter_37_24
- Spezies: Candidatus Aenigmarchaeota archaeon CG_4_9_14_3_um_filter_37_18
- Spezies: Candidatus Aenigmarchaeota archaeon ex4484_14,
Fundstelle: Hydrothermale Tiefseequelle (Schlot), Sediment: Guaymas-Becken, Golf von Kalifornien, entnommen im Dezember 2009, Metagenom (N) - Spezies: Candidatus Aenigmarchaeota archaeon ex4484_52,
Fundstelle: Hydrothermale Tiefseequelle (Schlot), Sediment: Guaymas-Becken, Golf von Kalifornien, entnommen im Dezember 2009, Metagenom (N) - Spezies: Candidatus Aenigmarchaeota archaeon ex4484_56,
Fundstelle: Hydrothermale Tiefseequelle (Schlot), Sediment: Guaymas-Becken, Golf von Kalifornien, entnommen im Dezember 2009, Metagenom (N) - Spezies: Candidatus Aenigmarchaeota archaeon ex4484_224,
Fundstelle: Hydrothermale Tiefseequelle (Schlot), Sediment: Guaymas-Becken, Golf von Kalifornien, entnommen im Dezember 2009, Metagenom (N) - Spezies: Candidatus Aenigmarchaeota archaeon JGI 0000106-F11,
Fundstelle: Thermalquelle, Sediment, 42-90 °C[11][12] - Spezies: Candidatus Aenigmarchaeota archaeon LH_S4,
Fundstelle: Kalte salzhaltige Quelle, Sediment (en. cold saline spring sediment): Nunavut, Kanada (N) - Spezies: Candidatus Aenigmarchaeota archaeon LH_S5
- Spezies: Candidatus Aenigmarchaeota archaeon LH_S6
- Spezies: Candidatus Aenigmarchaeota archaeon LH_S7
- Spezies: Candidatus Aenigmarchaeota archaeon LH_S8
- Spezies: Candidatus Aenigmarchaeota archaeon LH_S52
- Spezies: Candidatus Aenigmarchaeota archaeon LH_S53
- Spezies: Candidatus Aenigmarchaeota archaeon LH_S54
- Spezies: Candidatus Aenigmarchaeota archaeon LH_S55
- Spezies: Candidatus Aenigmarchaeota archaeon LH_S56
- Spezies: Candidatus Aenigmarchaeota archaeon LH_S57
- Spezies: Candidatus Aenigmarchaeota archaeon LH_S58
- Spezies: Candidatus Aenigmarchaeota archaeon LH_S59
- Spezies: Candidatus Aenigmarchaeota archaeon LH_S60
- Spezies: Candidatus Aenigmarchaeota archaeon SCGC AAA011-F07,
Fundstelle: Süßwasser, Grundwasser: Homestake Mine, South Dakota, USA; Tiefe 100 Meter[13]
Etymologie
Die Name des Phylum und der Gattung leiten sich ab von altgriechisch αἴνιγμαainigma, deutsch ‚Rätsel‘, Plural αἰνίγματαainigmata, die Endungen „-archaeota“ und „-archaeum“ sind für Archaeenphyla respektive -gattungen reserviert. Die Namen beschreiben somit enigmatische, rätselhafte Archaeen.[5][14]
Das Artepitheton subterraneum ist lateinisch und bedeutet wörtlich ‚unterirdisch‘, was auf den Fundort dieser Bodenmikroben verweist.[5]
Einzelnachweise
- ↑ a b Nina Dombrowski, Tom A. Williams, Jiarui Sun, Benjamin J. Woodcroft, Jun-Hoe Lee, Bui Quang Minh, Christian Rinke, Anja Spang: Undinarchaeota illuminate DPANN phylogeny and the impact of gene transfer on archaeal evolution. In: Nature Communications. Band 11, Nr. 1, 7. August 2020, S. 3939, doi:10.1038/s41467-020-17408-w, PMID 32770105.
- ↑ UniProt Taxonomy. Aenigmarchaeota
- ↑ a b Ken Takai, Duane P. Moser, Mary DeFlaun, Tullis C. Onstott, James K. Fredrickson: Archaeal Diversity in Waters from Deep South African Gold Mines. In: Applied and Environmental Microbiology. 1. Dezember 2001, S. 5750–5760, doi:10.1128/AEM.67.21.5750-5760.2001, PMID 11722932.
- ↑ Christian Rinke, Patrick Schwientek, Alexander Sczyrba, Natalia N. Ivanova, Iain J. Anderson, Jan-Fang Cheng, Aaron Darling, Stephanie Malfatti, Brandon K. Swan, Esther A. Gies, Jeremy A. Dodsworth, Brian P. Hedlund, George Tsiamis, Stefan M. Sievert, Wen-Tso Liu, Jonathan A. Eisen, Steven J. Hallam, Nikos C. Kyrpides, Ramunas Stepanauskas, Edward M. Rubin, Philip Hugenholtz, Tanja Woyke: Insights into the phylogeny and coding potential of microbial dark matter. In: Nature. Band 499, Nr. 7459, 25. Juli 2013, S. 431–437, doi:10.1038/nature12352, PMID 23851394.
- ↑ a b c LPSN: Phylum “Candidatus Aenigmarchaeota”
- ↑ NCBI: Candidatus Aenigmarchaeota (Liste), Details: Candidatus Aenigmarchaeota (phylum, heterotypic synonym: Aenigmarchaeota Rinke et al. 2013); graphisch: Candidatus Aenigmarchaeota, Lifemap NCBI Version.
- ↑ Céline Petitjean, Philippe Deschamps, Purificación López-García, David Moreira: Rooting the domain archaea by phylogenomic analysis supports the foundation of the new kingdom Proteoarchaeota. In: Genome Biology and Evolution. Band 7, Nr. 1, Januar 2015, ISSN 1759-6653, S. 191–204, doi:10.1093/gbe/evu274, PMID 25527841, PMC 4316627 (freier Volltext) – (Epub 19. Dezember 2014).
- ↑ Julia M. McGonigle, Jeremiah A. Bernau, Brenda B. Bowen, William J. Brazelton: Robust Archaeal and Bacterial Communities Inhabit Shallow Subsurface Sediments of the Bonneville Salt Flats. In: mSphere. 28. August 2019, doi:10.1128/mSphere.00378-19, PMID 31462415.
- ↑ OneZoom: Candidatus Aenigmarchaeum subterraneum
- ↑ Gp0010633 §Organism Information, Joined Genome Institute, DOE Office of Science.
- ↑ DHVE3 group archaeon 000106-F11 und Gp0018860, Joined Genome Institute, DOE Office of Science.
- ↑ NCBI Taxonomy: Candidatus Aenigmarchaeota archaeon JGI 0000106-F11 (ncbi.nlm.nih.gov).
- ↑ Go0011606 und Go0011606 §Environmental Metadata, Joined Genome Institute, DOE Office of Science.
- ↑ Aharon Oren, George M. Garrity, Charles T. Parker, Maria Chuvochina, Martha E.YR 2020 Trujillo: Lists of names of prokaryotic Candidatus taxa. In: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. Band 70, Nr. 7, 30. Juni 2020, ISSN 1466-5034, S. 3956–4042, doi:10.1099/ijsem.0.003789.