Aegiribacteria

Aegiribacteria ist ein 2016 vorgeschlagener Kandidat für eine Gattung von Bak­terien.^[3][2] Sie wurde anhand von Genomsequenzen aus der Umwelt identifiziert (Metagenomik), und zwar aus Tiefensediment vom extrem meromiktischen Mahoney Lake in British Columbia (Kanada). Dieser See weist ungewöhnlich hohe Sulfat- und Sulfid­werte in der unteren Wassersäule (Hypolimnion) auf. Anhand dieser Analysen wurde festgestellt, dass die Organismen dieser Gattung wahrscheinlich einen fermentativen Stoffwechsel (Gärungs-Stoff­wech­sel) haben, und dass die vorgeschlagene Gattung zum Phylum (d. h. Stamm bzw. Abteilung, englisch division, lateinisch divisio) Fermentibacterota innerhalb der FCB-Gruppe gehört.^[4][2][1]

Systematik

Die hier angegebene Konsensus-Taxonomie der Gattung Aegiribacteria und ihrer (möglichen) näheren Verwandtschaft basiert mit Stand 9. März 2022 auf den folgenden Quellen:

• G – Genome Taxonomy database (GTDB)^[2]
• L – List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN), Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen (DSMZ)^[5]
• N – National Center for Biotechnology Information (NCBI, Taxonomy Browser)^[1]

Mit Fragezeichen versehene Einträge sind unsicher, mit Anführungszeichen veröffentlichte Namen sind nicht gültig veröffentlicht:

Klade (Superphylum): FCB-Gruppe (N)

• Phylum: Fermentibacterota (G), synonym "Candidatus Fermentibacteria" [phylum] Kirkegaard et al. 2016 (N), früher Candidate division Hyd24-12 (N)
  • Klasse: Fermentibacteria (G) bzw. Candidatus Fermentibacteria [class] (N)
    • Ordnung: Fermentibacterales (G)
      • Familie: Fermentibacteraceae (G)
        • Gattung: Aegiribacteria (G) alias „Candidatus Aegiribacteria“ Hamilton et al. 2016 (L,N)
          • Spezies: Aegiribacteria sp002030045 (G) alias Ca. Aegiribacteria sp. MLS_C (N,G)
          • Spezies: Aegiribacteria sp003644925 (G) alias Ca. Fermentibacteria bacterium B22_G4^[6]
          • Spezies: Aegiribacteria sp013138965 (G) alias Ca. Aegiribacteria sp. isolate GLR63^[7][8] (G,N)
          • Isolat: Candidatus Aegiribacteria sp. isolate SMBSF04^[8] (N)
          • Isolat: Candidatus Aegiribacteria sp. isolate SMBSF24^[8] (N)
          • Isolat: Candidatus Aegiribacteria sp. isolate SMBSF55^[8] (N)
          • Isolat: Candidatus Aegiribacteria sp. isolate RBin_049^[8] (N)
      • ?Familie: „Fermentobadaceae“ Haiying 1995 (L)
        • Gattung: Guhaiyingella Haiying 1995 (L) mit Schreibvariante Guhaiyinggella Haiying 1995 (N mit abweichender Klassifizierung!)^[9]
          • Spezies Guhaiyingella guhaiyingii Haiying 1995 (L) mit Schreibvariante Guhaiyinggella guhaiyingii Haiying 1995 (N)
        • Gattung: „Candidatus Sabulitectum“ Saad et al. 2017 (N)
          • Spezies: „Candidatus Sabulitectum silens“ Saad et al. 2017 (N), inkl. Candidate division Hyd24-12 bacterium JCC-6 (N)

Anmerkungen:

1. NCBI klassifiziert die Gattung Guhaiyinggella in die Ordnung Enterobacterales der Klasse Gammaproteobacteria.^[9]
2. NCBI synonymisiert die Klasse „Paramycetes“ mit der Klasse Mollicutes unter dem Phylum Tenericutes.^[10]

Kladogramm

Anbei ein bezüglich 16S-rRNA Maximum-Likelihood-basierter phylogenetischer Baum der FCB-Gruppe (Fibrobacteres, Chlorobi, Bacteroidetes) inklusive MLS_C, vereinfacht nach Trinity Hamilton et al. (2016):

Etymologie

Der Begriff Aegiribacteria leitet sich von Ägir ab, einem nordischen Meeresgott. Dieser galt als berühmter Bierbrauer, was auf den vermuteten Gärungsstoffwechsel dieser Bakteriengruppe widerspiegelt.^[5][4]

Die für den provisorischen Artnamen benutzte Abkürzung MLS_C steht für Mahoney Lake Sediment C.^[4]

Literatur

• Donovan H. Parks, Maria Chuvochina, David W. Waite, Christian Rinke, Adam Skarshewski, Pierre-Alain Chaumeil, Philip Hugenholtz: A proposal for a standardized bacterial taxonomy based on genome phylogeny. Auf: Biorxiv, Version 2, 31. Januar 2018. doi:10.1101/256800 (PrePrint).

Einzelnachweise

1. ↑ ^{a b c} NCBI: Candidatus Aegiribacteria, Details: "Candidatus Aegiribacteria" Hamilton et al. 2016 (genus); Candidatus Aegiribacteria, Lifemap NCBI Version.
2. ↑ ^{a b c d e f g} Aegiribacteria, Genome Taxonomy Database, Release 06-RS202 (27. April 2021). University of Queensland, Australia.
3. ↑ Donovan H. Parks, Maria Chuvochina, David W. Waite, Christian Rinke, Adam Skarshewski, Pierre-Alain Chaumeil, Philip Hugenholtz: A standardized bacterial taxonomy based on genome phylogeny substantially revises the tree of life. In: Nature Biotechnology. Band 36, S. 996–1004, 27. August 2018; doi:10.1038/nbt.4229, PMID 30148503.
4. ↑ ^{a b c} Trinity L. Hamilton, Roderick J. Bovee, Sarah R. Sattin, Wiebke Mohr, William P. Gilhooly, Timothy W. Lyons, Ann Pearson, Jennifer L. Macalady: Carbon and sulfur cycling below the chemocline in a meromictic lake and the identification of a novel taxonomic lineage in the FCB superphylum, Candidatus Aegiribacteria. In: Frontiers in Microbiology. Band 7, S. 598, 27. April 2016; doi:10.3389/fmicb.2016.00598, PMC 4846661 (freier Volltext), PMID 27199928. Siehe insbes. Fig. 8: Maximum likelihood based phylogenetic 16S rRNA gene tree of members of the FCB superphylum and MLS_C.
5. ↑ ^{a b} LPSN: "Candidatus Aegiribacteria" Hamilton et al. 2016 (Genus)
6. ↑ NCBI: Nucleotide: Fermentibacteria bacterium B22_G4
7. ↑ NCBI: MAG: Candidatus Aegiribacteria sp. isolate GLR63, whole genome shotgun sequencing project
8. ↑ ^{a b c d e} NCBI: Nucleotide: txid2528271[Organism:noexp]
9. ↑ ^{a b} NCBI: Guhaiyinggella, Details: "Guhaiyinggella" Haiying 1995 (genus); graphisch: Guhaiyinggella, Lifemap, NCBI Version.
10. ↑ ^{a b} NCBI: Mollicutes, Details: Mollicutes Edward and Freundt 1967 (class, heterotypic synonym: "Paramycetes" Sabin 1941)